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1毛冠鹿与3种麂属动物的线粒体细胞色素b的系统进化分析显示文摘采用PCR直接测序法 ,获得毛冠鹿、小麂、赤麂和黑麂等 4种麂亚科动物线粒体细胞色素b核酸序列36 6bp ,麂属动物之间的序列差异为 3 5 %~ 4 6 % ,毛冠鹿属与麂属之间的序列差异为 9 2 9%~ 10 11% ,麂属3种动物分歧时间约为 142~ 184万年 ,毛冠鹿与麂属动物的分歧时间约为 370万年。结合鹿科其余 3亚科动物的同源序列 ,用MEGA软件的Neighbor JoiningMethod (NJ法 )和最大简约法构建系统进化树。结果表明 ,小麂、赤麂与黑麂组成一个单系群 。曹祥荣 束峰珏 张锡然 毕春明 李朝军 胡均 方笺阳 2002动物学报2002,48,1:45
2分子系统学研究进展显示文摘Molecular systematics has developed very quickly these years,on which most studies of molecular ecology have been focused.In this paper,the main content of this comprehensive subject is briefly reviewed.We emphasized on its techniques,including their principles,advantages and disadvantages as their applications.Several problems have been enumerated which exist in recent research of molecular systematics.The development tendency of molecular systematics is also discussed in this paper.徐宏发 王静波 2001生态学杂志2001,20,3:26
3基于COI条形码序列的鹿茸及其混伪品的DNA分子鉴定显示文摘目的:利用COI序列对鹿茸及其混伪品进行DNA条形码鉴别,考察其可行性。方法:对鹿茸及其混伪品源自动物鹿科4属7种共14份样品的COI条形码序列进行研究,分析药材正品来源的种内变异,与混伪品的种间变异,以及系统树中物种的聚类情况。结果:梅花鹿和马鹿COI序列种内变异较小,混伪品的种间序列差异较大,种间最小K-2P距离远大于梅花鹿和马鹿种内最大K-2P距离。由所构建的系统聚类树可以看出,同属聚在一起,且各物种又形成相对独立的支,支持率较高。基于COI序列的NJ树能够明显地看出,鹿茸与其混伪品能够明确地区分开。结论:运用COI条形码序列能够准确鉴定鹿茸的基源动物及其混伪品,本研究为鹿茸的鉴别提供了新的可行性方法。崔丽娜 杜鹤 刘新成 张辉 曲晓波 2012吉林中医药2012,32,4:20
4黑麂线粒体基因组序列分析显示文摘采用PCR产物直接测序方法测定了黑麂线粒体基因组全序列 ,初步分析了其基因组特点并定位了各基因的位置 .结果显示 :黑麂的线粒体基因组全序列长度为 1 6 35 7bp ,可编码 2 2种tRNA、2种rRNA、1 3种蛋白质 ,碱基组成及基因位置与小麂、赤麂和其它哺乳类动物的线粒体基因组相似 ;模拟电子酶切图谱与先前的报道基本一致 ;基于细胞色素b的全基因序列 ,分别以最大简约法、N J法、最大似然数法与其它 1 4种鹿类动物的相应序列进行了聚类分析 ,构建出相似的系统进化树 :初步确定了麂亚科动物在鹿科中处于与鹿亚科、北美鹿亚科并列的进化地位 .在此基础上 ,进一步以黑麂、赤麂、小麂的线粒体编码RNA和编码蛋白质的基因序列构建系统进化树 ,分析了三者的亲缘关系 .结果表明 :黑麂和赤麂亲缘关系较近 ,是较新的物种 。张海军 李健 施燕峰 张晓梅 徐春宏 单祥年 2004中国生物化学与分子生物学报2004,20,4:12
5牛线粒体CYTB基因的序列分析及进化关系显示文摘对CYTB基因全长1140 bp序列进行分析的结果表明,10个品种的20条CYTB碱基序列中共发现10种单倍型,黄牛中单倍型较少.共检测到98个变异位点,未发现插入和缺失,牦牛和黄牛除了异亮氨酸以外有着相同的密码子偏好.将核酸序列转换成氨基酸序列后,黄牛表现的遗传差异更小,18个个体分享5种氨基酸序列单倍型,共有6个氨基酸突变位点,8个突变氨基酸.黄秉周 徐公瑾 李相烈 李宁 金海国 2004延边大学农学学报2004,26,3:8
6动物线粒体DNA多态研究及其在鱼类群体遗传结构上的应用(综述)显示文摘概述了动物线粒体的主要特征、动物线粒体 DNA(mtDNA)的结构特点、多态和进化及线粒体DNA多态研究方法 ,最后介绍了动物mtDNA的多态在鱼类群体遗传结构上的应用。胡文革 王金富 2001石河子大学学报(自然科学版)2001,5,3:8
7赤麂线粒体全基因组的序列和结构显示文摘提取赤麂细胞株总DNA ,参照我们实验室已测定的同属动物小麂线粒体全基因组序列设计引物 ,PCR扩增、测序、拼接 ,获得赤麂线粒体全基因组序列并进行生物信息学分析。赤麂线粒体全基因组序列全长 16 35 4bp。定位了 2 2个tRNA基因、 2个rRNA基因、 13个蛋白编码基因和 1个D loop区。赤麂与小麂及其它哺乳动物线粒体的基因组结构相同 。施燕峰 单祥年 李健 张晓梅 张海军 2003动物学报2003,49,5:7
8小麂、赤麂、黑麂mtDNA序列变异性及反映的进化关系显示文摘利用已测定的鹿科麂亚科动物小麂、赤麂、黑麂的线粒体全基因组序列 ,统计它们各自连接在一起的 1 3个蛋白编码基因、2 2个tRNA基因、2个rRNA基因和 1个控制区序列的碱基长度和组成 ,计算rRNA基因遗传距离 ,估算分歧时间 ,比较蛋白编码基因的碱基水平和氨基酸水平上的差异 ,基于连接在一起的 1 3个氨基酸序列 ,以羊为外群 ,通过邻位相连法和最大简约性法构建进化树 ,探讨小麂、赤麂、黑麂的进化关系。结果表明 ,小麂是较原始的物种 ,赤麂和黑麂较为近缘 。单祥年 施燕峰 张海军 徐春宏 李健 郑爱玲 2004动物学杂志2004,39,4:7
9一种改进的禽类线粒体DNA提取方法显示文摘介绍一种碱变性法从禽类脏器中提取大量线粒体DNA ,比较了从不同脏器提取mtDNA的难易程度和得率 ,结果表明 :肝脏、脾脏的匀浆操作易于心脏 ,且肝脏的得率高于心脏、更高于脾脏 ;同时对影响mtDNA产量和质量的匀浆速度和次数、差速离心速度、溶液Ⅱ中SDS含量及溶液pH值等因素进行了初步分析和探讨。在借鉴前人研究基础上对禽类脏器mtDNA提取方法上进行了改进和优化 ,建立了一种从禽类脏器中有效制备mtDNA的方法。结果表明 ,这种方法得到的mtDNA可以满足限制性酶切实验的要求。孙杰 赵宗胜 李大全 李岩 2003生物技术2003,13,4:7
10构建分子系统树的简易方法显示文摘利用大分子序列差异构建分子系统树已成为现代系统分类和生物进化研究工作者的基本方法和工具,掌握建树方法对该领域的研究工作具有十分重要的意义。构建分子系统树的软件很多。就DNAMAN6.0和MEGA5.1联合建树的简易方法进行阐述,帮助初学者建树。杜玉杰 2013生物学通报2013,48,4:7
11云南野生动植物地理分布特点和退化原因分析显示文摘云南由于特殊地理气候孕育了极其丰富的生物多样性。从南向北 ,植被带类型由水平分布转为垂直分布 ,并形成滇西北、滇东南两大生物多样性类群。其中各自蕴藏了较多不同的特有珍稀物种。但由于定量化研究的缺乏和资源破坏的历史原因等 ,这些物种急需得到进一步有效保护。黄海魁 2000云南地理环境研究2000,12,1:6
12麂属(Muntiacus)动物线粒体12SrRNA、细胞色素b基因和多药耐药基因序列分析及其分子进化关系显示文摘对麂属 (Muntiacus)中的 3种动物 :赤麂 (M .muntjak) (2n =6♀ ,7♂ )、小麂 (M .reevesi) (2n =4 6 )、黑麂 (M .crinifrons) (2n =8♀ ,9♂ )线粒体DNA 12SrRNA和细胞色素b基因 784bp左右的片段和核基因———多药耐药基因(multidrugresistance ,MDR1)的 72 8bp左右的片段进行了序列分析 ,并根据序列信息建立了分子系统树 ,同时探讨了这 3种动物的起源。易广才 张晓梅 单祥年 2002Acta Genetica Sinica2002,29,8:5
13亚洲黑熊四川亚种Ursus thibetanus mupinensis线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅲ基因的克隆与初步分析显示文摘根据已报道的部分哺乳动物线粒体细胞色素C氧化酶(Cytochrome C Oxidase)亚基Ⅲ基因(mtCOXⅢ)的相关信息设计引物,运用PCR技术,首次从亚洲黑熊四川亚种(以下简称四川黑熊,Ursus thibetanus mupinensis)的肌肉组织总DNA中成功克隆了mtCOXⅢ基因的编码序列,并对其进行了初步分析.结果表明:四川黑熊mtCOXⅢ基因序列全长784 bp,ORF是783 bp,编码261个氨基酸的蛋白质,该蛋白的等电点为6.47,分子量为29840.6 Da.四川黑熊的mtCOXⅢ与已报道的部分哺乳动物的mtCOXⅢ基因具有很高的同源性.进一步分析发现,四川黑熊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅲ功能位点的位置、种类和数量均与已报道的部分哺乳动物具有很高的相似性.杜玉杰 黎云祥 吴夏 陈瑜 侯万儒 2007四川大学学报(自然科学版)2007,44,6:5
14动物mtDNA的研究及在鱼类生态学中的应用显示文摘概述了动物线粒体的主要特征、动物线粒体DNA(mtDNA)的结构特点、多态和进化;以及线粒体DNA多态研究方法,最后介绍了动物mtDNA的多态性在研究鱼类群体遗传结构上的应用。杨明生 熊邦喜 2005孝感学院学报2005,25,3:5
15鹿科动物线粒体DNA序列差异和系统进化关系显示文摘从Gen Bank数据库中获得20种鹿科动物的线粒体DNA序列全长,分析了序列碱基含量和遗传距离关系,并构建系统进化树,探讨了鹿科动物的系统进化关系。序列分析表明:鹿科动物线粒体DNA全长为16 305~16 482 bp,A+T含量约占62.58%,各物种间遗传距离为0.014~0.164。系统进化分析表明:驼鹿在鹿科动物中可能是最古老的;麋鹿与鹿属亲缘关系较近,支持将麋鹿划到鹿属的观点;泽鹿与花鹿属的斑鹿和豚鹿先聚到一起,支持将泽鹿划到花鹿属中;麂亚科中小麂可能是最原始的,赤麂和黑麂亲缘关系较近;獐与狍亲缘关系更近,建议将獐与狍划归到一个亚科。鞠妍 刘华淼 邢秀梅 2017吉林农业大学学报2017,39,1:4
165种常见石斑鱼的线粒体DNA酶切物理图谱显示文摘用识别5、6碱基序列的17种限制性内切酶,即BamHⅠ、BglⅠ、BglⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HindⅢ、KpnⅠ、MluⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、SalⅠ、ScaⅠ、SmaⅠ、StyⅠ、XbaⅠ和XhoⅠ,对南海海域石斑鱼属(EpinephelusBloch)野生蜂巢石斑鱼(E.merra)、鲑点石斑鱼(E.fario)、青石斑鱼(E.awoara)、赤点石斑鱼(E.akaara)和七带石斑鱼(E.septem-fasciatus)的线粒体DNA(mtDNA)进行RFLP分析。测算出蜂巢石斑鱼、鲑点石斑鱼、青石斑鱼、赤点石斑鱼和七带石斑鱼的mtDNA分子大小分别为(18.52±0.21)kb、(18.44±0.21)kb(、18.56±0.18)kb、(18.57±0.19)kb和(18.36±0.11)kb。通过单、双酶切分析,分别构建了蜂巢石斑鱼10种酶共20个酶切位点、鲑点石斑鱼9种酶共17个酶切位点、青石斑鱼8种酶共16个酶切位点、赤点石斑鱼7种酶共12个酶切位点和七带石斑鱼7种酶共13个酶切位点的酶切物理图谱。BglⅡ和XhoⅠ两种内切酶的酶切谱带可作为鉴别这5种石斑鱼的RFLP标记。杨少闻 刘楚吾 2006中国水产科学2006,13,3:3
17中国鹿类动物分类及系统进化研究进展显示文摘中国的鹿类资源十分丰富。过去国内外学者对鹿类动物的分类主要通过生物学特征和染色体核型进行研究。近年来,随着分子生物学技术及分子进化理论的快速发展,应用基因组(核、线粒体)对鹿类动物的研究逐渐开展起来,这在一定程度上对传统分类进行了修正和补充。由于传统分类易受主观和各种客观因素的限制(如难以获得足够数量和种类的标本),不同学者利用分子生物学分类使用的基因各不相同,因此,目前鹿类动物的分类和系统进化研究还存在着一些争议和不同的意见,如麝、狍、毛冠鹿等的归属仍没有统一定论,有关麝科、鹿科中亚科之间的系统进化关系还有待于进一步阐明。本文对中国鹿类动物分类和系统进化的研究进展进行综述,并提出展望,旨在为中国鹿类动物的分类及系统进化研究提供参考。刘汇涛 董依萌 王磊 周永娜 邢秀梅 杨福合 2017野生动物学报2017,38,3:3
18麝的分类研究概述显示文摘麝(Moschus spp.)是亚洲地区特产野生动物,具有非常重要的经济和生态价值,为我国一级重点保护物种,已被列入CITES附录Ⅰ中.麝一直颇为中外学者所关注.目前,麝作为独立的科已广泛被接受,但种及种下的分类仍处于'广泛争论'状态.本文从形态、分子生物学等特征对麝的分类研究进行了简要概述,提出了一些尚待解决的问题,并对将来的研究工作做出展望.彭红元 陈伟才 张修月 2010玉林师范学院学报2010,31,2:3
19鹿源中药材的DNA条形码鉴定研究进展显示文摘鹿源中药材的来源复杂多样,鉴定方法也有很多,如基原鉴定、性状鉴定、显微鉴定和理化鉴定等。但在实际应用中,鹿源中药材的鉴定难度极大,一般的鉴定方法很难满足其鉴定要求,因此需要一种快速有效的鉴定方法来鉴定鹿源的真伪和质量。本文以网络文献检索与手工检索相结合的方法,梳理了近20年的文献进行综述。张辛宁 许亮 才丽平 王孟虎 夏静文 王友辰 2017中国中医药现代远程教育2017,15,16:3
20麂属(Muntiacus)动物MDR-1基因序列分析及其分子进化关系显示文摘对麂属(Muntiacus)中的3种动物:赤麂(M.muntjak)(2n=6 ,7 )小麂(M.reevesi)(2n=46),黑麂(M.crinifrons)(2n=8 ,9 )MDR-1基因(multidrug resistance,多药耐药基因)726bP左右的片段进行了序列分析,并根据序列信息建立分子系统树,同时探讨了这3种动物的起源、分类地位及进化关系。易广才 易广才 张晓梅 单祥年 2002四川动物2002,21,4:3
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