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| 1 | lncRNA及其生物学功能显示文摘长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度>200 nt、生物来源广泛、二级及三级结构高度保守的RNA分子。lnc RNA生物学功能丰富,广泛参与生物体各类重要生理过程,在转录、转录后表观遗传水平上对靶基因的表达进行调控,其精细的分子调控机制已在染色体剂量补偿、基因组印记、靶目标模仿、功能性蛋白质转运等生物学过程中被广泛揭示。随着lncRNA生物学作用机制不断被揭示,研究者发现,高度保守的lnc RNA二级、三级结构对其生物学功能的发挥至关重要。目前研究者主要采用计算机手段和数学方法对lncRNA高级功能结构域进行预测,从结构上阐明其生物学调控机制。关于lncRNA相关研究方法也在近年来得到了飞速的发展,比较成熟的技术例如RNA纯化的染色质分离(chromatin isolation by RNA purification,Ch IRP)和RNA结合蛋白免疫沉淀(RNA-binding protein immunoprecipitation,RIP)已逐渐成为该领域内研究lncRNA与染色质、lncRNA与蛋白质之间相互作用的热门技术。本文主要就lncRNA来源、分类标准、生物学功能、高级结构预测及相关研究方法进行了综述,旨在为更好地理解和研究lncRNA在生物体内的作用提供参考。 | 李睿 罗云波 | 2016 | 农业生物技术学报2016,24,4: | 20 |
| 2 | 胃癌长链非编码RNA SNHG16异常表达及其临床病理意义显示文摘目的:检测长链非编码RNA SNHG16在胃癌组织与癌旁组织中的表达及其临床意义。方法:实时荧光定量PCR(quantitative real time-PCR,qRT-PCR)法检测SNHG16在41例胃癌组织及5株不同分化程度细胞系和胃黏膜上皮细胞中的表达情况,分析SNHG16表达与胃癌临床病理的相关性。结果:胃癌组织中SNHG16相对于癌旁组织其表达量为(2.64±1.59),表达显著上调且与胃癌侵袭相关(P<0.05,r=0.361)。与GES-1细胞株比较,HGC-27中SNHG16相对表达量为(4.21±0.69),MGC-803为(1.99±0.21),BGC-803为(1.90±0.44),SGC-7901为(0.76±0.05),AGS为(3.36±0.81);SNHG16在SGC-7901中低表达,但差异无统计学意义(P>0.05),在其他4株细胞中显著高表达(P<0.01)。结论:SNHG16在胃癌组织中高表达,且其表达水平与胃癌侵袭程度相关,可成为胃癌预后监测及治疗的靶点。 | 赵娟娟 韦四喜 严芝强 刘娟娟 万颖 黄海 | 2017 | 东南大学学报(医学版)2017,36,4: | 16 |
| 3 | Non-coding RNAs and gastric cancer显示文摘Non-coding RNAs(ncRNAs)play key roles in development,proliferation,differentiation and apoptosis.Altered ncRNA expression is associated with gastric cancer occurrence,invasion,and metastasis.Moreover,aberrant expression of microRNAs(miRNAs)is significantly related to gastric cancer tumor stage,size,differentiation and metastasis.MiRNAs interrupt cellular signaling pathways,inhibit the activity of tumor suppressor genes,and affect the cell cycle in gastric cancer cells.Some miRNAs,including miR-21,miR-106a and miR-421,could be potential markers for the diagnosis of gastric cancer.Long non-coding RNAs (lncRNAs),a new research hotspot among cancerassociated ncRNAs,play important roles in epigenetic,transcriptional and post-transcriptional regulation.Several gastric cancer-associated lncRNAs,such as CCAT1,GACAT1,H19,and SUMO1P3,have been explored.In addition,Piwi-interacting RNAs,another type of small ncRNA that is recognized by gastroenterologists,are involved in gastric carcinogenesis,and piR-651/823represents an efficient diagnostic biomarker of gastric cancer that can be detected in the blood and gastric juice.Small interfering RNAs also function in posttranscriptional regulation in gastric cancer and might be useful in gastric cancer treatment. | Pei-Fei Li Sheng-Can Chen Tian Xia Xiao-Ming Jiang Yong-Fu Shao Bing-Xiu Xiao Jun-Ming Guo | 2014 | World Journal of Gastroenterology2014,20,18: | 12 |
| 4 | 补阳还五汤对急性脑梗死患者血清外泌体lncRNA表达谱的研究显示文摘目的分析补阳还五汤对急性脑梗死患者血清外泌体lncRNA表达谱的影响,以期阐明其治疗脑梗死的机理。方法选取6例符合纳入标准的急性脑梗死患者,随机分为观察组和对照组。其中观察组4例患者给予补阳还五汤联合西医基础治疗,对照组2例患者给予单纯西医基础治疗。在治疗第7天后采集静脉血,离心后分离血清并提取外泌体,运用基因芯片高通量检测lncRNA,筛选差异表达的lncRNA,最后对其cis作用靶基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果两组间共有20个差异表达的lncRNA,其中19个下调,1个上调;GO富集分析前30的结果涉及生物过程19个,细胞组分7个,分子功能4个;KEGG通路富集主要为MAPK信号通路、雌激素信号通路等,这些通路与脑缺血后的氧化应激、炎症反应、细胞凋亡及细胞自噬等病理过程密切相关。结论补阳还五汤会改变急性脑梗死患者的血清外泌体lncRNA表达谱,涉及诸多生物过程和信号通路。本研究可为后续的临床及基础研究提供了新思路。 | 陈博威 刘柏炎 黄昕 易健 唐荣梅 王小菊 | 2021 | 世界科学技术-中医药现代化2021,23,6: | 9 |
| 5 | Transcriptome analysis reveals long noncoding RNAs involved in fiber development in cotton (Gossypium arboreum)显示文摘Long noncoding RNAs(lnc RNAs)play important roles in various biological regulatory processes in yeast,mammals,and plants.However,no systematic identification of lnc RNAs has been reported in Gossypium arboreum.In this study,the strand-specific RNA sequencing(ss RNA-seq)of samples from cotton fibers and leaves was performed,and lnc RNAs involved in fiber initiation and elongation processes were systematically identified and analyzed.We identified 5,996 lnc RNAs,of which 3,510 and 2,486 can be classified as long intergenic noncoding RNAs(linc RNAs)and natural antisense transcripts(lnc NAT),respectively.Linc RNAs and lnc NATs are similar in many aspects,but have some differences in exon number,exon length,and transcript length.Expression analysis revealed that 51.9%of linc RNAs and 54.5%of lnc NATs transcripts were preferentially expressed at one stage of fiber development,and were significantly highly expressed than protein-coding transcripts(21.7%).During the fiber and rapid elongation stages,rapid and dynamic changes in lnc RNAs may contribute to fiber development in cotton.This work describes a set of lnc RNAs that are involved in fiber development.The characterization and expression analysis of lnc RNAs will facilitate future studies on their roles in fiber development in cotton. | Changsong Zou Qiaolian Wang Cairui Lu Wencui Yang Youping Zhang Hailiang Cheng Xiaoxu Feng Mtawa Andrew Prosper Guoli Song | 2016 | Science China(Life Sciences)2016,59,2: | 9 |
| 6 | 长链非编码RNA在乳腺癌中的研究进展显示文摘长链非编码RNA(long non-coding RNA,Lnc RNA)是非编码RNA的重要一员,长度超过200个核苷酸,缺乏开放的阅读框,无编码蛋白质的功能。近年来研究发现Lnc RNA的表达异常与乳腺癌的发生、发展和侵袭转移密切相关。最新研究数据显示,Lnc RNA的组织特异性表达具有区分正常和肿瘤组织甚至乳腺癌不同阶段的潜能,深入研究Lnc RNA在乳腺癌中的机制作用有望对乳腺癌的早期诊断、治疗、预后提供新的思路与方法。 | 许家瑞 胡剑 刘冬冬 李有强 林莉 刘丹 徐建华 | 2018 | 分子诊断与治疗杂志2018,10,1: | 8 |
| 7 | LncRNA H19在肿瘤发病中的作用机制研究进展显示文摘随着研究的深入和研究技术的提高,研究者在人类基因组中发现了大量非编码RNA(NcRNA),这类RNA一直受到人们的广泛关注。越来越多的研究显示,NcRNA可能参与各种基因表达的调控。目前的研究已证实,长链非编码RNA(LncRNA)在生长调控及生理代谢中发挥重要作用,并且参与肿瘤调控。LncRNA H19是最早发现的印迹LncRNA,虽然在大多数组织中LncRNA H19的表达在出生后被关闭,但很多研究提示其可在肿瘤发生期间被重新激活或抑制,从而影响肿瘤进展。本文主要综述近期LncRNA H19在肿瘤发病中作用机制的研究进展,为今后的研究提供参考。 | 朱敏 郗雪艳 杜伯雨(指导) | 2021 | 中国免疫学杂志2021,37,7: | 8 |
| 8 | lncRNA在骨关节炎发病及病变机制中的可能作用显示文摘骨关节炎是以软骨退变为核心病理特征、累及关节周围组织的一种关节病变。现代研究表明,lncRNA对骨关节炎病理变化起一定的调控作用。在总结大量文献的基础上发现,lncRNA可能从影响软骨细胞功能、软骨基质代谢、滑膜增生、新生血管生成方面调节骨关节炎病理变化。后续还需进一步研究和验证lncRNA对骨关节炎发病及病变的作用。 | 林洁 叶锦霞 陈俊 付长龙 吴广文 | 2017 | 风湿病与关节炎2017,6,8: | 8 |
| 9 | 长链非编码RNA的功能及其作用机制显示文摘近年来,随着高通量深度测序技术的飞速发展,大量长链非编码RNA(lncRNA)在真核生物体内不断被发现。lncRNA是一类长度大于200 nt,生物学功能丰富,高级结构保守的非编码RNA(ncRNA)分子,能直接与蛋白质、微小RNA(microRNA)等分子作用,在表观遗传水平、转录水平、转录后水平上调控靶基因的表达。主要就lncRNA的分类标准、调控基因表达模式及其与蛋白质、miRNA的相互作用进行综述,旨在为更好地理解和研究lncRNA生物学功能提供参考。 | 李睿 杨永芳 李冉 朱鸿亮 罗云波 | 2016 | 生命科学2016,28,6: | 7 |
| 10 | 长链非编码RNA在肝癌中的研究进展显示文摘长链非编码RNA(lncRNA)是一类200~100000核苷酸长度且无蛋白质编码功能的一类RNA分子。越来越多的证据表明,lncRNA主要通过在转录、转录后以及表观遗传水平参与基因的表达调控,并以此影响肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭及转移等过程,与原发性肝癌发生、发展的病理生理机制及患者预后密切相关。原发性肝癌中多种显著异常表达的lncRNA,有望成为原发性肝癌诊断和预后的新的分子标志物。笔者在简要介绍lncRNA的基础上,对近年来lncRNA在肝癌中的研究进展进行综述。 | 何运 陈攀 罗嘉 吴飞跃 | 2016 | 中国普通外科杂志2016,25,7: | 6 |
| 11 | 表观遗传学及其研究方法显示文摘表观遗传学是一门重要的生命学科,主要包括DNA的甲基化、组蛋白修饰以及非编码RNA等内容,其中任何一方面的表观遗传学变化对生物体的生命过程都有重要的影响。近年来随着生命科学的快速发展,表观遗传学越来越受到人们的关注,各种先进科技的应用也使得表观遗传学实验技术得到快速的发展。本文对DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA的基本内容及实验方法进行了综述,并对不同的研究方法进行分析,有利于表观遗传学的深入研究。 | 朱锋 王旭 刘倩莹 陆启荣 黄德玉 刘振利 戴梦红 袁宗辉 | 2017 | 现代生物医学进展2017,17,12: | 5 |
| 12 | 膀胱癌组织LncRNA FEZF1-AS1、miR-610表达变化及临床意义显示文摘目的探讨膀胱癌组织中长链非编码RNA(LncRNA)FEZF1-AS1、微小RNA(miR)-610表达变化及意义。方法采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测79例膀胱癌组织和40例正常膀胱黏膜组织LncRNA FEZF1-AS1及miR-610表达,分析LncRNA FEZF1-AS1、miR-610表达差异及两者与临床病理特征间的关系。结果与正常膀胱黏膜组织相比,膀胱癌组织LncRNA FEZF1-AS1相对表达量较高,而miR-610相对表达量较低(P均<0.05)。膀胱癌组织中LncRNA FEZF1-AS1、miR-610表达与肿瘤分期、组织分化程度有关(P均<0.05),而与患者性别、年龄、肿瘤大小、浸润深度及是否存在淋巴结转移无关(P均>0.05)。膀胱癌组织中LncRNA FEZF1-AS1表达与miR-610呈负相关(r=-0.611,P=0.000)。结论膀胱癌组织中LncRNA FEZF1-AS1表达升高,miR-610表达降低;检测两者表达有助于膀胱癌患者病情判断。 | 杨丰硕 李黎明 杨青松 胡月鹏 吕秀敏 王桂莲 陈茹 岳宏强 郭美荣 | 2020 | 山东医药2020,60,4: | 5 |
| 13 | 长链非编码RNA生物学特性和功能研究进展显示文摘长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是近年来备受关注的长度大于200 nt的内源性非蛋白编码RNA。大量资料显示其参与了哺乳动物许多重要生理、病理过程,并在其中起到非常重要的生物学作用。主要针对lncRNA的基本概念、生物学特性及主要生物学功能进行综述,为lncRNA的相关研究提供参考。 | 计红 李悦 牛春阳 詹雪龙 郭景茹 甄莉 杨焕民 李士泽 | 2019 | 黑龙江八一农垦大学学报2019,31,2: | 4 |
| 14 | lncRNA在动脉粥样硬化中的研究进展显示文摘长链非编码RNA(lncRNA)是一种在生物基因转录本中占据多数地位,且能够调节众多生命活动的生物分子,在细胞的增殖、凋亡、分化、衰老及发育等方面具有重要作用。目前人们已经发现,lncRNA在体内与肿瘤疾病、内分泌疾病、神经系统疾病等多种疾病均具有紧密联系。在心血管疾病中,lncRNA不仅在动脉粥样硬化斑块中表达水平出现异常改变,且与内皮功能障碍、平滑肌细胞增殖、泡沫细胞形成、脂质代谢等密切相关,从而参与调节动脉粥样硬化的发生与发展。 | 张睿 蔡君艳 | 2019 | 医学综述2019,25,2: | 4 |
| 15 | 水杉长链非编码RNA分析显示文摘水杉(Metasequoia glyptostroboides)是中国著名的一级保护植物,素有'活化石'之称。为了更好地保护和利用这一重要种质资源,本研究以水杉为实验材料,在全长转录组测序的基础上,利用四个软件对61057个Unigenes进行了蛋白编码潜能预测,最终获得3385个长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)分子。进一步对这些lncRNAs的长度和数量作统计分析,结果显示,最短为200 nt,最长为11134 nt,平均长度为1956 nt;大部分lncRNAs的长度介于200~2000 nt,占总量的59.5%;在2001~4000 nt的长度范围内,也发现较多的lncRNAs,达到总量的32.2%;在长度为4001~6000 nt的范围内,只有7.6%;长度超过6000 nt的lncRNAs很少,总共只有25个(占总量的0.7%)。本研究结果为水杉资源的保护和利用研究提供了一些分子依据,为其它植物在相关领域的研究提供了一些参考。 | 刘小红 | 2020 | 分子植物育种2020,18,3: | 4 |
| 16 | Identification and comparison of long non-coding RNAs in the silk gland between domestic and wild silkworms显示文摘 | Qiu-Zhong Zhou Shou-Min Fang Qiang Zhang Quan-You Yu Ze Zhang | 2018 | Insect Science2018,25,4: | 4 |
| 17 | 基于StarBase数据库分析lncRNA SNHG6在消化系统肿瘤中的表达及作用机制显示文摘目的研究长链非编码RNA SNHG6在消化系统肿瘤中的表达及作用机制。方法通过StarBase数据库不同分析功能,分析SNHG6在不同消化系统肿瘤中的表达水平;筛选出可能的下游靶基因,通过功能富集分析及KEGG通路富集分析,探讨SNHG6可能的作用机制;进一步探讨靶基因Eukaryotic Translation Initiation Factor 4 A3(EIF4A3)和SNHG6的相关性,同时分析EIF4A3在肝癌中的表达及预后分析。结果 SNHG6在除胰腺癌以外的消化系统肿瘤中均高表达,下游作用机制主要与剪切体、RNA转运、核糖体以及mRNA监测相关通路有关,同时与EIF4A3密切相关。EIF4A3和SNHG6在肝癌中明显正相关,并且EIF4A3在肝癌中明显高表达,生存分析提示EIF4A3与肝癌不良预后有关。结论 SNHG6在多数消化系统肿瘤中发挥促癌基因的作用,并且在肝癌中通过与EIF4A3相互作用,促进肝癌发生发展。 | 林思敏 蓝智贤 姚翔 王馨珂 | 2019 | 现代消化及介入诊疗2019,24,2: | 4 |
| 18 | 下调SNHG16对胃癌细胞HGC-27细胞周期的影响显示文摘目的下调长链非编码RNA SNHG16对人胃癌细胞HGC-27细胞周期的影响。方法实时荧光定量PCR(quantitative real time-PCR,qRT-PCR)法检测SNHG16siRNA在HGC-27细胞中的干扰效率;流式细胞术(FACS)检测敲低SNHG16后对HGC-27细胞周期的影响;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测周期相关蛋白细胞周期素依赖性蛋白激酶2(CDK2)的改变情况。结果qRT-PCR检测转染SNHG16siRNA后,细胞HGC-27中SNHG16表达量明显下降;流式细胞术检测低表达SNHG16使细胞HGC-27细胞周期中S期被阻滞且CDK2蛋白相对表达量下降。结论敲低SNHG16后阻滞细胞HGC-27的S期以及CDK2蛋白的表达,从而抑制细胞生长。 | 朱晓鸿 赵娟娟 刘娟娟 万颖 黄海 | 2017 | 贵州医药2017,41,12: | 4 |
| 19 | 长链非编码RNA与肺癌显示文摘长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA分子,其数量众多,但缺少蛋白质编码功能。研究发现,lncRNA能在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因的表达,在各类生物过程中起着重要的调节作用,并与多种疾病相关,已经成为现代遗传学的研究热点。近期研究证据显示,肺癌中有多种lncRNA的表达水平发生了变化,并在肺癌的发生、发展及预后中起着重要的调控作用。本文就lncRNA的定义、功能机制及与肺癌的相关性研究作一综述。 | 陈杰 朱成杰 商艳 白冲 李强 | 2014 | 第二军医大学学报2014,35,10: | 3 |
| 20 | 植物长链非编码RNA的研究进展显示文摘长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lnc RNAs)是真核生物中一类长度大于200个核苷酸、无蛋白编码能力或编码能力极低的RNA转录本。lnc RNA种类和功能的多样性导致了对其进行研究的复杂性,特别是对植物中lnc RNA的认识相当有限。该文就近年来植物中已发现的lnc RNA的种类、相关转录酶、参与的生物学过程、发挥功能的分子机制以及其相关的研究策略等方面进行综述和展望,以期为深入认识植物lnc RNA提供借鉴。 | 张芳 董衡 刘丹丹 黄鹂 曹家树 | 2015 | 中国细胞生物学学报2015,37,4: | 3 |