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| 1 | 马铃薯产量组分的基因型与环境互作及稳定性显示文摘本研究主要探究基因型和基因型与环境互作(genotype+genotypes and environment interactions,GGE)双标图在马铃薯育种中的应用。综合评价马铃薯品系产量性状在不同环境中的丰产性、稳定性和适应性,筛选出适应不同生态环境的产量性状优良品系。同时评价各试点的区分力和代表性,为试点的选择提供依据。2015年和2016年在甘肃安定区鲁家沟镇、安定区内官镇、渭源县五竹镇3个试点种植国际马铃薯中心引进的101份高代品系和对照青薯9号。收获后记录小区产量、小区大薯产量、小区小薯产量、单株产量、单株大薯产量、单株小薯产量、单株结薯数、单株大薯数、单株小薯数;采用联合方差和GGE双标图对产量性状进行基因型与环境互作分析。方差分析表明,除小区小薯产量在基因型与环境互作效应中无显著差异外,其他产量组分在基因型效应、环境效应和互作效应中均呈现极显著差异(P<0.01)。小区产量、小区大薯产量、小区小薯产量、单株产量、单株大薯产量、单株结薯数环境效应平方和占总方差平方和最大;单株小薯产量、单株大薯数和单株小薯数的基因型与环境互作效应平方和占总方差平方和最大。GGE分析结果表明,适应性最强的品系在鲁家沟试点是G86;在五竹镇试点是G65;在内官镇试点是G86。参试品系中丰产品系有G86、G116、G124;稳产品系有G124、G125、G10;高产稳产品系有G86、G116、G124、青薯9号。单株大薯数高的品系有G45、G86、G67,稳定性好的品系有G67、G116、G51,对照青薯9号的单株大薯产量不稳定。综合鉴别力和代表性的强弱,依次为鲁家沟镇2016年、鲁家沟镇2015年、五竹镇2015年、五竹镇2016年、内官镇2015年、内官镇2016年。GGE模型能够直观地展现多年多点品系试验结果,并客观评价参试品系的丰产性、稳定性和适应性,同时可以对试点的代表性和区分力进行评价。以GGE模型综合评价,高产稳产品系有G116、G124、G125、G122、青薯9号;高产不稳定的品系有G86、G10、G121、G106、G107、G72。最理想的生态区试点是鲁家沟镇,对品种的鉴别力最强的试点是五竹镇。 | 叶夕苗 程鑫 安聪聪 袁剑龙 余斌 文国宏 李高峰 程李香 王玉萍 张峰 | 2020 | 作物学报2020，46，3： | 20 |
| 2 | 亚麻全基因组关联分析的研究进展显示文摘全基因组关联分析(GWAS)是应用单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)在全基因组水平上发现影响复杂性状的基因变异的一种手段。为了加强GWAS在亚麻育种中的应用,本文归纳了GWAS的优势及分析流程,列举了近年来国内外利用GWAS定位到的亚麻产量及品质相关性状的标记位点和候选基因,总结了亚麻白粉病的研究现状及其他作物在GWAS的相关研究,并提出GWAS在亚麻育种和抗病的未来发展趋势,为亚麻GWAS研究提供理论基础。 | 陆美光 段海燕 姜恭好 | 2021 | 中国农学通报2021，37，21： | 3 |
| 3 | 不同节水型小麦新品系籽粒产量对浇水因子相应的综合评判显示文摘为了准确评判不同节水型冬小麦新品种(系)的高产性、稳产性及节水特性,精准筛选、取舍小麦新品种(系),以2018年小麦品比试验中的14个品种系为研究材料,测定其在春季分别浇0水、1水和2水的情况下的籽粒产量。运用联合方差分析法和GGEbiplots双标图法比较了不同品种(系)的高产稳产特性,同时评价不同浇水因子的区分力和代表性。结果表明:小区产量在基因型效应、浇水因子效应和互作效应中均存在极显著差异(P<0.01);小区产量随着浇水次数的增加产量提高,平均增产率分别为34.17%和20.71%;新品系V1、V5、V8、V6高产稳产性较好;W0环境即春季不浇水的情况下,环境鉴别力和代表性较好,更有利于筛选节水型新品种。两种方法的综合应用可以达到量化、直观的特点,有利于综合评价新品系及浇水因子效应。 | 孙宪印 吕广德 亓晓蕾 孙盈盈 米勇 钱兆国 吴科 | 2021 | 干旱区资源与环境2021，35，1： | 3 |
| 4 | 亚麻主要农艺与品质相关性状的QTL定位显示文摘为了全面了解亚麻产量和品质相关性状的遗传基础,为亚麻基因克隆和分子标记辅助育种提供理论依据,在已构建SNP连锁遗传图谱的基础上,以LH-89为父本,R43为母本构建F2:3家系QTL定位群体,用R/QTL软件采用复合区间作图法对13个农艺和品质性状进行QTL定位。结果表明:(1)该研究共检测出35个QTL位点,与粗脂肪及其组成成分相关的QTL有20个,与农艺性状相关的QTL有15个;其中:亚油酸和粗脂肪各5个,亚麻酸、千粒重各4个,棕榈酸、株高、工艺长度各3个,硬脂酸、分枝数各2个,单株果数、果粒数、单株粒重、油酸各1个。(2)共有18个QTL的表型贡献率超10%(主效基因),其中农艺性状定位8个主效基因,品质性状定位10个主效基因。 | 高凤云 斯钦巴特尔 张辉 伊六喜 侯建华 周宇 | 2018 | 西北植物学报2018，38，3： | 2 |
| 5 | 亚麻全基因组关联分析研究进展显示文摘全基因组关联分析(GWAS,genome-wide association studies)是研究作物表型多样性遗传基础的方法之一,在连锁标记开发、目的基因挖掘和复杂性状的遗传研究等方面具有重要作用,为揭示作物复杂农艺性状的遗传机理提供了研究思路。文章简要介绍了全基因组关联分析的原理及方法步骤,论述其在亚麻农艺、品质及抗性性状研究中的应用进展,并对存在的问题进行探讨及展望,为今后利用GWAS进行亚麻农艺及品质性状遗传基础的研究及分子标记辅助育种提供依据和参考。 | 伍叶娜 潘根 姜慧 常丽 黄思齐 唐慧娟 栾明宝 陈安国 | 2022 | 中国麻业科学2022，44，2： | 1 |
| 6 | Estimation of genetic parameters and their sampling variances for quantitative traits in the type 2 modified augmented design显示文摘The type 2 modified augmented design(MAD2) is an efficient unreplicated experimental design used for evaluating large numbers of lines in plant breeding and for assessing genetic variation in a population. Statistical methods and data adjustment for soil heterogeneity have been previously described for this design. In the absence of replicated test genotypes in MAD2, their total variance cannot be partitioned into genetic and error components as required to estimate heritability and genetic correlation of quantitative traits, the two conventional genetic parameters used for breeding selection. We propose a method of estimating the error variance of unreplicated genotypes that uses replicated controls, and then of estimating the genetic parameters. Using the Delta method, we also derived formulas for estimating the sampling variances of the genetic parameters.Computer simulations indicated that the proposed method for estimating genetic parameters and their sampling variances was feasible and the reliability of the estimates was positively associated with the level of heritability of the trait. A case study of estimating the genetic parameters of three quantitative traits, iodine value, oil content, and linolenic acid content, in a biparental recombinant inbred line population of flax with 243 individuals, was conducted using our statistical models. A joint analysis of data over multiple years and sites was suggested for genetic parameter estimation. A pipeline module using SAS and Perl was developed to facilitate data analysis and appended to the previously developed MAD data analysis pipeline(http://probes.pw.usda.gov/bioinformatics_ tools/MADPipeline/index.html). | Frank M.You Qijian Song Gaofeng Jia Yanzhao Cheng Scott Duguid Helen Booker Sylvie Cloutier | 2016 | The Crop Journal2016，4，2： | 1 |
| 7 | 亚麻QTL定位的研究进展显示文摘亚麻是一种重要的经济作物,在食品业、纺织业、医疗保健、畜牧业等领域均具有重要价值。多数亚麻性状都是由数量性状位点(quantitative trait loci,QTL)控制,因此QTL定位无疑有助于加快亚麻育种进程、提升亚麻产品品质、增强作物抗逆性等。目前作物QTL定位方法分为两大类,即基于遗传连锁图谱的传统QTL定位方法以及基于连锁不平衡原理的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)。文章总结了当前亚麻遗传图谱的构建情况,以及基于传统QTL定位、GWAS分析定位的QTL研究进展,以期为亚麻其他重要性状QTL定位分析和分子辅助育种提供参考。 | 巩文靓 康雪蒙 马梦影 段海燕 姜恭好 | 2020 | 中国麻业科学2020，42，4： | 0 |
| 8 | Accuracy of genomic selection in biparental populations of flax(Linum usitatissimum L.)显示文摘Flax is an important economic crop for seed oil and stem fiber. Phenotyping of traits such as seed yield, seed quality, stem fiber yield, and quality characteristics is expensive and time consuming. Genomic selection(GS) refers to a breeding approach aimed at selecting preferred individuals based on genomic estimated breeding values predicted by a statistical model based on the relationship between phenotypes and genome-wide genetic markers. We evaluated the prediction accuracy of GS(rMP) and the efficiency of GS relative to phenotypic selection(RE) for three GS models: ridge regression best linear unbiased prediction(RR-BLUP),Bayesian LASSO(BL), and Bayesian ridge regression(BRR), for seed yield, oil content, iodine value, linoleic, and linolenic acid content with a full and a common set of genome-wide simple sequence repeat markers in each of three biparental populations. The three GS models generated similar rMPand RE, while BRR displayed a higher coefficient of determination(R^2)of the fitted models than did RR-BLUP or BL. The mean rMPand RE varied for traits with different heritabilities and was affected by the genetic variation of the traits in the populations.GS for seed yield generated a mean RE of 1.52 across populations and marker sets, a value significantly superior to that for direct phenotypic selection. Our empirical results provide the first validation of GS in flax and demonstrate that GS could increase genetic gain per unit time for linseed breeding. Further studies for selection of training populations and markers are warranted. | Frank M.You Helen M.Booker Scott D.Duguid Gaofeng Jia Sylvie Cloutier | 2016 | The Crop Journal2016，4，4： | 0 |
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