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| 1 | 碱基编辑系统研究进展显示文摘碱基编辑技术(base editing)是基于CRISPR/Cas系统发展起来的新型靶基因修饰技术,目前依据碱基修饰酶的不同可分为胞嘧啶碱基编辑器(cytosine base editor,CBE)和腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editor,ABE)。这两类碱基编辑系统利用胞嘧啶脱氨酶或人工进化的腺嘌呤脱氨酶对靶位点进行精准的碱基编辑,最终可以分别实现C-T(G-A)或A-G(T-C)的碱基替换。碱基编辑技术自2016年被开发以来,因其高效、不依赖DNA双链断裂产生、无需供体DNA参与等优势,已经成功应用在各种动物、植物及其他生物中,为基因治疗及精准作物育种等领域提供了重要技术支撑。本文从碱基编辑技术的特点、开发过程、优化、应用、脱靶效应及改善策略等方面进行了系统介绍,最后对未来需要迫切解决的一些问题进行了分析和展望,以期为相关领域的科研人员进一步了解、使用及优化碱基编辑系统提供参考。 | 宗媛 高彩霞 | 2019 | 遗传2019，41，9： | 37 |
| 2 | 碱基编辑器的开发及其在细菌基因组编辑中的应用显示文摘碱基编辑器是近两年发展起来的新型基因组编辑工具,它将碱基脱氨酶的催化活性和CRISPR/Cas系统的靶向特异性进行结合,催化DNA或RNA链上特定位点的碱基发生脱氨基反应,进而完成碱基的替换。碱基编辑器分为DNA和RNA碱基编辑器两大类,其中DNA碱基编辑器分为两种:胞嘧啶碱基编辑器和腺嘌呤碱基编辑器;前者可以实现胞嘧啶到胸腺嘧啶的转换,而后者则可以将腺嘌呤突变为鸟嘌呤。由于DNA碱基编辑器不会造成DNA的双链断裂(DSB),也不依赖于宿主的非同源末端修复和同源重组途径,因此,大大减少了DSB相关的编辑副产物,如小片段插入或缺失等。基于CRISPR/Cas系统的RNA碱基编辑器,可以实现RNA链上腺嘌呤核苷到次黄苷的转换。本文对不同类型碱基编辑器的开发过程、适用范围和编辑特点等进行梳理,并对其在细菌基因组编辑中的应用进行了介绍;最后简要探讨了细菌中碱基编辑器的缺点以及将来可能的研究方向。 | 赵亚伟 姜卫红 邓子新 汪志军 芦银华 | 2019 | 微生物学通报2019，46，2： | 6 |
| 3 | 新型DNA碱基编辑器的研究进展显示文摘DNA碱基编辑技术是由CRISPR/Cas系统发展而来,能对基因组碱基进行精准编辑。目前已开发的DNA碱基编辑器包括介导C·G至T·A转换的胞嘧啶单碱基编辑器、介导A·T至G·C转换的腺嘌呤单碱基编辑器、介导C·G至G·C颠换的糖基化酶单碱基编辑器、介导C·G至T·A和A·T至G·C同时转换的双碱基编辑器、介导任意碱基之间转换的引导编辑器以及线粒体DNA编辑器。本文系统总结了上述6种DNA编辑器的原理、优化历程及最新研究进展,着重介绍了应用到植物研究中的碱基编辑器工具及其在作物遗传改良中的应用,并对碱基编辑技术今后的发展进行了展望。 | 张雅玲 王锌和 李构思 曾栋昌 祝钦泷 陈乐天 刘耀光 | 2022 | 华南农业大学学报2022，43，6： | 4 |
| 4 | 单碱基编辑工具—腺嘌呤碱基编辑器ABE的研究进展显示文摘基因编辑技术CRISPR/Cas9自诞生以来,在基因敲除、敲入、碱基修复等领域得到了广泛的应用,但其效率低下,且存在非靶向切割,安全性较低,极大地限制了传统CRISPR/Cas9在高分辨率单碱基编辑中的应用。基于传统CRISPR/Cas9发展起来的碱基编辑器(base editor, BE)的出现则克服了这些弊端,其中,胞嘧啶碱基编辑器(cytosine base editor, CBE)能够使C·G转换为T·A,腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editor, ABE)能够使A·T转换为G·C,都可以在不引入双链断裂的情况下实现高效的单碱基置换,这就避免了传统的CRISPR/Cas9在进行非同源末端连接(nonhomologous end-joining, NHEJ)时引入不可控的插入或缺失突变(Indels)。人类(Homo sapiens)大部分遗传疾病是由于碱基突变造成的,而单碱基编辑工具的出现能够在一定程度上纠正一定比例的致病性SNP,因此,其在动物模型构建、功能基因组学研究、分子育种、临床医学、转化医学等领域应用前景广阔。本文针对发展较晚、脱靶效率更低的腺嘌呤碱基编辑器ABE的原理、发展历程、应用和所面临的机遇与挑战进行了综述,以期为单碱基编辑技术的研究与应用提供参考。 | 李广栋 张鲁 富俊才 连正兴 刘国世 | 2019 | 农业生物技术学报2019，27，10： | 4 |
| 5 | 碱基编辑系统研究最新进展及应用显示文摘CRISPR系统能够在基因组DNA中完成精准编辑,但依赖于细胞内的同源重组(Homologydirected recombination,HDR)修复途径,且效率极低。基于CRISPR/Cas9系统开发的碱基编辑技术(Base editing)通过将失去切割活性的核酸酶与不同碱基脱氨基酶融合,构建了两套碱基编辑系统(Baseeditors,BE):胞嘧啶碱基编辑器(Cytosine base editor,CBE)和腺嘌呤碱基编辑器(Adenine base editor,ABE)。这两类编辑器分别能够在不产生DNA双链断裂的前提下在基因靶位点完成C>T (G>A)或A>G (T>C)的替换,最终实现精准的碱基编辑。目前碱基编辑技术已经广泛应用于基因治疗、动物模型构建、精准动物育种和基因功能分析等领域,为基础和应用研究提供了强大的技术工具。文中概括了碱基编辑技术的研发过程、技术优势、应用现状、存在问题及改进策略,以期为相关领域的科研人员了解和使用碱基编辑系统提供参考。 | 徐鑫 刘明军 | 2021 | 生物工程学报2021，37，7： | 2 |
| 6 | 基于CRISPR/Cas系统的单碱基编辑技术研究进展显示文摘基于CRISPR/Cas系统出现的单碱基编辑技术可以实现高效且简便的单个碱基的替换编辑,其原理是将胞嘧啶脱氨酶(cytosine deaminase)或腺苷脱氨酶(adenosine deaminase)与Cas9n(D10A)形成融合蛋白,通过CRISPR/Cas精准识别和定位DNA上的靶位点后,利用胞嘧啶脱氨酶或腺苷脱氨酶将靶点距离sgRNA位点基序(protospacer adjacent motif,PAM)序列端的4~7位的单个碱基发生单碱基转换或颠换。对基于CRISPR/Cas系统的单碱基编辑技术发现的历史、组成和分类、工作原理进行了概述,并总结了该系统最新进展及应用。 | 王玥 牟彦双 刘忠华 | 2020 | 中国生物工程杂志2020，40，12： | 2 |
| 7 | DNA碱基编辑器在微生物中的研究进展显示文摘在众多生物中利用具有切割作用的CRISPR/Cas9系统与非同源性末端连接(non-homologous end joining,NHEJ)修复系统或同源性末端连接(homology-directed repair,HDR)修复系统共同完成基因编辑工作都有报道。但是由于NHEJ的不精确性以及一些微生物中HDR效率较低导致生物体死亡限制了该工具的发展。基于CRISPR/dCas9系统构建而成的DNA碱基编辑器作为一种编辑工具,可靶向地实现碱基之间的转换,且不导致微生物死亡。DNA碱基编辑器在微生物中已经实现靶向编辑工作,可以同时多个位点进行编辑,同时可以利用该工具将编码氨基酸的密码子转化为终止密码子,提前终止翻译过程实现对基因的失活。本文主要对DNA碱基编辑器的作用原理,发展历程以及在微生物中的应用做了概述,最后提出了该工具存在的一些不足之处,并结合相关研究展望了未来的研究方向。为在微生物中开发与利用DNA碱基编辑的研究提供了思路。 | 刘振权 董会娜 丛丽娜 张大伟 | 2020 | 工业微生物2020，50，6： | 1 |
| 8 | Cost-effective generation of A-to-G mutant mice by zygote electroporation of adenine base editor ribonucleoproteins显示文摘More than 32,000 pathogenic single nucleotide polymorphisms(SNPs)have been identified in the human genome(Gaudelli et al.,2017).Genetically modified mice with pathogenic SNPs are good models for studies of disease pathogenesis and the development of new therapeutics.Accordingly,an efficient,high-throughput method for the generation of mouse models with SNPs is needed. | Hongwei Sun Shengyao Zhi Guifang Wu Guanglan Wu Tianqi Cao Hu Hao Zhou Songyang Puping Liang Junjiu Huang | 2020 | Journal of Genetics and Genomics2020，47，6： | 1 |
| 9 | 基因编辑技术在细胞治疗中的研究进展显示文摘近年来,基因治疗领域捷报频传,在遗传疾病和肿瘤等疾病的治疗方面多个基因和细胞治疗药物获批上市,更有一批新药将在2~3年内上市,为患者带来革命性的治疗方案。相对于传统的外源基因导入的基因治疗策略而言,基因编辑技术能实现基因组片段高效而精确的修复、插入和剔除,有望显著提高基因治疗的持久性和安全性。以锌指核酸酶(zinc finger nuclease, ZFNs)、转录激活因子样效应核酸酶(transcription activator-like effector nuclease, TALEN)、规律成簇的间隔短回文重复CRISPR/Cas核酸酶(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPRassociated systems, CRISPR/Cas)为代表的基因编辑技术蓬勃发展为细胞治疗领域带来开创性突破。该文将重点回顾基因编辑技术应用于细胞治疗的不同策略,探讨其在细胞治疗中的特点、应用前景、机遇和挑战,以期为基因编辑技术向细胞治疗的临床转化提供参考。 | 朱碧云 李林夕 王立人 李大力 | 2019 | 中国细胞生物学学报2019，0，4： | 0 |
| 10 | 碱基编辑的研究进展显示文摘碱基编辑(base editing)是一种基于CRISPR/Cas(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)系统发展起来的新型基因修饰技术,它成功地将切割DNA双链的“剪刀”改变为特定碱基的“修正器”,该技术能在不诱导双链DNA断裂的情况下,通过sgRNA引导碱基修饰酶至特定位点,进而实现碱基的替换。碱基编辑器主要分为胞嘧啶碱基编辑器(cytidine base editors, CBEs)、腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editors, ABEs)和Prime编辑器(prime editors, PEs),CBEs可以完成胞嘧啶(C)到胸腺嘧啶(T)的转换,ABEs能将腺嘌呤(A)转换成鸟嘌呤(G),PEs可以实现任意碱基间的转换。文章对碱基编辑的基本原理、发展历史、使用方法、应用策略和发展前景等进行综述,以期为其在分子育种和基因治疗等领域的应用提供新的思路。 | 王晶 朱喆 毕延震 张鹏 | 2022 | 黑龙江畜牧兽医2022，，5： | 0 |
| 11 | A brief review of genome editing technology for generating animal models显示文摘The recent development of genome editing technologies has given researchers unprecedented power to alter DNA sequences at chosen genomic loci,thereby generating various genetically edited animal models.This mini-review briefly summarizes the development of major genome editing tools,focusing on the application of these tools to generate animal models in multiple species. | Haoyi WANG Sen WU Mario R.CAPECCHI Rudolf JAENISCH | 2020 | Frontiers of Agricultural Science and Engineering2020，7，2： | 0 |
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