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| 1 | 中国水稻遗传学研究进展与分子设计育种显示文摘我国是一个农业大国,水稻是保障我国粮食安全和实现农业可持续发展的主粮作物.经过几十年的努力,我国科学家在水稻遗传学和功能基因组学领域取得了瞩目的成就,特别是在水稻复杂农艺性状基因解析方面取得了一系列重要的原创性研究成果,开创了以水稻为模式作物研究复杂性状基因调控网络的新领域.随着水稻功能基因组学的发展,我国科学家率先践行了分子设计育种理念,为培育高产、优质、抗逆、营养高效利用的'绿色超级稻'提供了有效的策略,对于确保我国粮食安全具有重要的意义. | 郭韬 余泓 邱杰 李家洋 韩斌 林鸿宣 | 2019 | 中国科学:生命科学2019，49，10： | 69 |
| 2 | Rice functional genomics:decades'efforts and roads ahead显示文摘Rice(Oryza sativa L.)is one of the most important crops in the world.Since the completion of rice reference genome sequences,tremendous progress has been achieved in understanding the molecular mechanisms on various rice traits and dissecting the underlying regulatory networks.In this review,we summarize the research progress of rice biology over past decades,including omics,genome-wide association study,phytohormone action,nutrient use,biotic and abiotic responses,photoperiodic flowering,and reproductive development(fertility and sterility).For the roads ahead,cutting-edge technologies such as new genomics methods,high-throughput phenotyping platforms,precise genome-editing tools,environmental microbiome optimization,and synthetic methods will further extend our understanding of unsolved molecular biology questions in rice,and facilitate integrations of the knowledge for agricultural applications. | Rongzhi Chen Yiwen Deng Yanglin Ding Jingxin Guo Jie Qiu Bing Wang Changsheng Wang Yongyao Xie Zhihua Zhang Jiaxin Chen Letian Chen Chengcai Chu Guangcun He Zuhua He Xuehui Huang Yongzhong Xing Shuhua Yang Daoxin Xie Yaoguang Liu Jiayang Li | 2022 | Science China(Life Sciences)2022，65，1： | 12 |
| 3 | 我国水稻分子生物学发展现状及展望显示文摘在水稻分子生物学研究方面,解析了水稻广谱抗病遗传基础及机制、杂种优势的分子遗传机制、水稻感知和耐受冷害热害机制、调控植物生长-代谢平衡实现可持续农业发展的分子机理、自私基因维持植物基因组稳定性的分子机制和大规模种质资源的全基因组变异,并提出我国水稻科技发展趋势与对策。 | 胡海涛 郭龙彪 | 2019 | 中国稻米2019，25，5： | 3 |
| 4 | 广东雷州杂草稻sh4和qSH1基因的功能SNP位点序列分析显示文摘sh4和qSH1基因是水稻的主效落粒基因,本研究旨在测定雷州杂草稻的sh4和qSH1的基因型,为雷州杂草稻的落粒机制研究提供分子基础。本研究从雷州10个杂草稻群体采集了100个单株及10份栽培稻种子,观测其颖壳颜色、果皮颜色和芒及落粒率,并对sh4和qSH1的功能SNP位点进行PCR扩增及序列分析。结果表明,57份杂草稻的sh4功能SNP位点为野生落粒型(G),15份为杂合型G/T,28份为突变难落粒型(T)。其中,G型和G/T型的72份杂草稻的落粒率都极高(95%~100%),而28份T型杂草稻中,19份为中度落粒(30%~75%),5份杂草稻的落粒率很高(>95%),4份杂草稻的落粒率小于30%。100份杂草稻和10份栽培稻的qSH1功能SNP位点均为G。结合落粒表型及基因型,推测sh4是调控雷州杂草稻落粒性的一个主要基因。 | 夏启玉 曹扬 孔华 李美英 张丽丽 贺萍萍 张雨良 郭安平 | 2020 | 热带作物学报2020，41，1： | 2 |
| 5 | 马铃薯品种(系)田间晚疫病抗性评价和全基因组遗传多样性分析显示文摘【目的】进行田间晚疫病抗性评价,利用SNP分子标记分析马铃薯抗晚疫病种质的遗传多样性及分离基因组内可能影响马铃薯晚疫病抗病性状的遗传区段,为马铃薯晚疫病抗性种质创新与利用提供理论依据。【方法】通过多年多点田间鉴定对马铃薯种质资源进行晚疫病抗性评价。利用dd-RAD技术对马铃薯种质资源进行简化基因组测序并分型SNP标记。利用Admixture软件分析群体的遗传结构,GCTA软件进行主成分分析,fastTree软件构建系统发育树,stacks程序包中的populations命令计算群体遗传多样性参数,vcftools程序计算选择性消除参数,Clustal Omega程序比对氨基酸序列,MEGA6绘制氨基酸序列进化树,GEMMA 0.98.1软件进行全基因组关联分析,CMplot程序绘制QQ图和曼哈顿图。【结果】通过对马铃薯种质资源多年多点田间晚疫病抗性进行鉴定,得到101个抗晚疫病的品种(系)及21个感病品种,并对它们进行dd-RAD简化基因组测序,通过对比参考基因组,共检测到分布相对均匀的8697602个SNP。通过种群结构分析、主成分分析和系统进化分析,将这些种质资源进一步划分为6个群体。6个群体之内的平均核苷酸多样性值(π)为0.2055-0.2572,之间的群体分化指数(Fst)为0.156909-0.187336,说明这些种质资源存在较丰富的单核苷酸多态性。同时6个群体内期望杂合度(He)为0.187-0.2297,观测杂合度(Ho)为0.0829-0.1186,6个群体内的观测杂合度均小于期望杂合度,并且6个群体内的近交系数(Fis)范围为0.2412-0.3554,说明在选育这些种质的过程中存在近交现象。分析可能影响晚疫病抗性的马铃薯基因组遗传区段,以20 kb为窗口,5 kb为步长,在基因组相同位置,分别计算不同抗性种质间π值比值和Fst值,进行选择性消除分析,选择π值比值最小的5%及Fst值最大的10%的745个遗传区段进行分析,遗传区段中共包含507个基因,其中,有4个NBS-LRR类基因。利用群体SNP和马铃薯种质的不同晚疫病抗性表型,进行全基因组关联分析,有9个SNP与抗病性状高度相关,其周围50 kb的基因组范围内,有69个基因,其中15个基因预测参与到应激反应,12个基因预测参与清除过氧化物自由基过程。【结论】dd-RAD简化基因组测序可以在马铃薯基因组中分型获得数量较多、分布相对均匀的SNP标记。马铃薯田间抗晚疫病种质资源拥有较丰富的单核苷酸多态性,但在其选育过程中存在近交现象。选择性清除和关联分析有助于分离影响晚疫病抗病性状的遗传区段。 | 李晓川 王朝海 周平 马维 吴瑞 宋治豪 梅艳 | 2022 | 中国农业科学2022，55，18： | 2 |
| 6 | 我国水稻分子生物学发展及展望显示文摘水稻是最重要的主粮之一,也是禾谷类作物基因组研究的模式作物。经过几十年的努力,我国科学家在水稻遗传学和功能基因组学领域取得了一系列创新性的成就,特别是在水稻理想株型、育性、广谱抗病、耐冷耐热、耐盐和养分高效利用方面的分子遗传机理解析,以及分子设计育种理论方面,开创了以水稻为模式作物研究复杂性状基因调控网络的新领域。展望了我国未来水稻分子生物学发展的趋势。 | 崔元江 郭龙彪 | 2022 | 中国稻米2022，28，1： | 2 |
| 7 | 我国杂草科学学科发展现状与展望显示文摘杂草科学是研究杂草生物学特性、生长发育规律、分类与鉴定、分布与危害、群落结构与演替、抗药性机制、防治技术的综合学科。本文重点阐述了近5年(2018年-2022年)来我国杂草科学学科在杂草生物学与生态学、杂草抗药性机理、除草剂安全剂作用机理、杂草防控技术等领域取得的系列研究进展,并展望了今后杂草科学学科的发展方向。 | 潘浪 刘敏 刘伟堂 徐洪乐 黄兆峰 李俊 张铮 齐龙 柏连阳 | 2023 | 植物保护2023，49，5： | 1 |
| 8 | 广东雷州杂草稻黑壳基因Bh4和红皮基因Rc的基因型鉴定显示文摘为测定雷州杂草稻的黑色颖壳基因Bh4和红色果皮基因Rc的基因型,本研究对雷州10个杂草稻群体的100个单株的种子的颖壳和果皮颜色进行表型观察,同时通过PCR扩增及序列分析对Bh4和Rc的基因型进行鉴定。结果表明,雷州杂草稻中黑色颖壳和黄色颖壳的种子几乎各占一半,果皮颜色则以红色为主,有少量白色和浅红色果皮的种子。雷州杂草稻的Bh4和Rc的基因型与表型鉴定结果一致。57份黑色颖壳杂草稻的Bh4基因型为39个野生型和18个杂合型,25份黄色颖壳和18份黄色带黑斑颖壳杂草稻的Bh4基因型均为缺失22 bp的突变型;90份红色果皮杂草稻的Rc基因型为73个野生型和17个杂合型,4份白色和6份浅红色果皮杂草稻的Rc基因型均为缺失14 bp的突变型。本研究为分析雷州杂草稻的Bh4和Rc基因的来源提供了分子基础。 | 夏启玉 赵辉 贺萍萍 张丽丽 杨小亮 肖苏生 张雨良 郭安平 | 2020 | 热带作物学报2020，41，12： | 0 |
| 9 | 基于SNP标记的单种属野鸦椿遗传变异和分化分析显示文摘[目的]基于表型观测和单核苷酸多态性(SNP)分子标记,探索单种属野鸦椿自然群体的遗传变异和分化,为野鸦椿的保护和分子育种提供遗传资源和理论依据。[方法]在野鸦椿的典型分布区开展野外种质资源调查,记录叶和果的表型,收集嫩叶用于简化基因组测序。利用特异性位点扩增片段测序技术(SLAF)挖掘多态性SNP位点,基于高质量的位点计算遗传多样性参数、构建系统发育树,进行主成分和群体结构分析。[结果]分子方差分析表明,群体间的遗传变异(40.36%)比群体内的遗传变异(27.65%)丰富。系统发育树、主成分分析和群体遗传的聚类模式一致,将所有样品分为落叶类和常绿类。群体结构分析表明,常绿类和落叶类之间缺乏基因交流(K=3)。对各个群体的遗传分化指数(F_(ST))进行分析发现,福建省的TN(0.79)、DH(0.759)、JS(0.53)等野鸦椿群体的分化程度高,且这些群体同时存在落叶类和常绿类。野外观测发现,落叶类和常绿类野鸦椿的物候、叶和果的表型具有明显差异。[结论]由于地理隔离、栖息地破碎化、基因交流受阻或缺乏等原因造成了野鸦椿群体内遗传多样性降低、群体间遗传分化程度高,且已分化为落叶类和常绿类。 | 陈志峰 倪辉 冯翯 陈啸 蔡丽娟 孙维红 邹双全 | 2023 | 亚热带农业研究2023，19，2： | 0 |
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