| 1 | 常态化防控阶段新型冠状病毒感染聚集性疫情特征分析显示文摘目的分析常态化防控阶段新型冠状病毒感染聚集性疫情特征,为进一步做好防控工作提供参考。方法收集2020年5月8日—2022年5月7日全国新型冠状病毒感染聚集性疫情资料,分析疫情起止时间、波及人群、规模、发现方式、指示病例的特征、发生原因、基因型等。采用描述性流行病学方法分析聚集性疫情特征。使用二分类非条件logistic回归分析疫情规模影响因素。结果共151起聚集性疫情纳入研究,单起疫情感染者中位数M(P_(25),P_(75))为103.00(29.00,419.00)例,≥100例的疫情78起,其中14起感染者数超过1000例。疫情持续时间为15.00(10.00,23.00)d。疫情最主要的发现方式为重点人群筛查(59起)和发热门诊主动就诊(49起)。境外输入为疫情主要来源(65起)。151起疫情中,未公布基因型信息17起;武汉株类似株引起的疫情10起,Alpha B.1.1.7变异株2起,武汉株类似株和Alpha B.1.1.7引起的疫情中感染者为29.50(8.50,274.50)例,确诊病例占74.66%(2551/3417);Delta B.1.617.2变异株32起,感染者为89.50(20.50,389.00)例,确诊病例占比为96.76%(7641/7897);Omicron变异株90起,感染者为151.00(37.75,487.00)例,无症状感染者占比高(85.28%,606756/711447)。≥100例的疫情在大规模核酸筛查中发现新感染者的概率是<100例组的6.17倍(95%CI:1.65~23.08)。结论Omicron变异株引起的疫情规模均较大,单起疫情中感染者人数多,持续天数范围广,无症状感染者占比高。在常态化防控阶段应实时追踪全球变异株变化趋势,持续做好入境人员和冷链食品工作人员管理,建立多点触发监测预警机制,及早发现疫情,采取针对性的防控措施。 | 田祎 杜丹 谭梦迪 李函凝 李舒婷 赵珏琼 高志勇 贾蕾 杨鹏 王全意 庞星火 | 2023 | 中国预防医学杂志2023,24,4: | 1 |
| 2 | 厦门市境外输入新冠病毒奥密克戎变异株基因组特征分析显示文摘目的 分析厦门市输入性新冠病毒奥密克戎(Omicron)变异株的基因组序列特征,为防控境外输入性Omicron变异株引起的本土疫情提供理论依据。方法 采集厦门市2021年12月—2022年2月输入的144例新冠肺炎病例鼻拭子样本,用二代测序技术进行新冠病毒基因组测序,对获取的全基因组序列进行变异位点检测,并基于邻接法用Mega软件构建进化树。结果 去除低质量序列后,共获得119例病例的组装完整的病毒基因组序列,1×覆盖度99.3%~99.6%。Pangolin分型显示,共鉴定出17个Omicron变异型,包括11个BA.1及其分支,6个BA.2及其分支。共发现149个核苷酸突变位点,71个新发氨基酸突变位点:其中ORF1ab区50个、S蛋白区4个、ORF3a区6个、ORF7a区2个、ORF8区2个、N蛋白区7个。在S蛋白的受体结合域关键位点上未发现变异。结论 在Omicron变异株流行初期,揭示了厦门市输入性Omicron变异株病毒序列的基因组变异特征,为持续监测新冠病毒基因组变异奠定了基础。 | 陈泽辉 曾小红 张荣秋 张建梅 邱汉泉 | 2023 | 中国国境卫生检疫杂志2023,46,2: | 0 |