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| 1 | 高茶氨酸茶树新品系‘福黄2号’黄化变异机理显示文摘为了探讨茶树黄化变异和高茶氨酸形成机理,文中选用‘福云6号’和高茶氨酸茶树新品系‘福黄2号’为试验材料,利用超微电镜、广泛靶向代谢组学、靶向代谢组学和转录组学联合分析了茶树黄化变异的相关色素、代谢组及转录组数据。结果表明,通过靶向测定主要生化成分,共鉴定到5种儿茶素、可可碱和咖啡碱,以及20种游离氨基酸,包括茶氨酸、谷氨酰胺、精氨酸和谷氨酸等,其中,‘福黄2号’的氨基酸含量显著高于‘福云6号’,茶氨酸含量高达57.37 mg/g。叶片的超微结构显示,‘福黄2号’叶绿体细胞结构模糊,基粒片层大部分排列散乱、间隙大,类囊体呈丝状。色素测定显示,叶绿素a和叶绿素b、类胡萝卜素、类黄酮等色素含量显著下降,叶绿素酶(chlorophyllase,CLH)、9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase,NCED)、类黄酮3β-羟化酶(flavonoid 3β-hydroxylase,F3H)和类黄酮3′,5′-羟化酶(flavonoid 3′,5′-hydroxylase,F3′5′H)等相关关键调控基因发生显著变化。与‘福云6号’相比,‘福黄2号’中共鉴定出138个差异代谢物(significantly changed metabolites,SCMs)和658个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),KEGG富集分析表明,SCMs和DEGs显著富集到与氨基酸生物合成、谷胱甘肽代谢以及三羧酸循环等途径。‘福黄2号’黄化表型可能是光合作用蛋白、叶绿素代谢基因和叶绿素含量的缺乏所致。高茶氨酸的积累可能由于黄化叶中低氮消耗,以及碳骨架的缺乏,氨基和氮资源被更有效地储存,使得氨基酸合成通路中的代谢物及相关基因表达上调,茶氨酸成为黄化叶中显著积累的含氮化合物。 | 林馨颖 邵淑贤 王鹏杰 杨如兴 郑玉成 陈潇敏 张磊 叶乃兴 | 2022 | 生物工程学报2022，38，10： | 4 |
| 2 | 茶树4CL基因家族的全基因组鉴定及表达分析显示文摘4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)是茶树苯丙烷代谢途径的核心酶,是类黄酮和木质素生物合成的关键酶,对茶树抗胁迫及茶叶品质形成有重要作用。研究通过生物信息学分析,从‘黄棪’和‘铁观音’茶树中分别鉴定出8个和9个4CL基因家族成员,命名为HD-Cs4CL1~8和TGY-Cs4CL1~9。系统发育分析将其分为A和B两组,A组中第Ⅰ亚家族的HD-Cs4CL3、HD-Cs4CL7、TGY-Cs4CL2和第Ⅱ亚家族的HD-Cs4CL2、TGY-Cs4CL5可能分别参与木质素和类黄酮合成。启动子顺式元件分析表明4CL基因中存在大量与植物发育、激素和胁迫响应相关的顺式作用元件。不同组织转录组数据分析表明,Cs4CL基因在茶树特定发育时期具有重要作用。实时荧光定量检测表明,HD-Cs4CL6和HD-Cs4CL8在GA、MeJA、ABA、低温和干旱处理下表达量均显著上调;HD-Cs4CL7在ABA处理和干旱处理下表达量上调,HD-Cs4CL2和HD-Cs4CL3在ABA处理下表达量上调。研究为进一步探究茶树4CL基因家族参与响应多种环境的生物学机制提供参考。 | 任卫威 高婷 邵淑贤 侯炳豪 廖献盛 叶乃兴 | 2023 | 西北植物学报2023，43，9： | 0 |
| 3 | Recent Advances in Assembly of Complex Plant Genomes显示文摘Over the past 20 years,tremendous advances in sequencing technologies and computational algorithms have spurred plant genomic research into a thriving era with hundreds of genomes decoded already,ranging from those of nonvascular plants to those of flowering plants.However,complex plant genome assembly is still challenging and remains difficult to fully resolve with conventional sequencing and assembly methods due to high heterozygosity,highly repetitive sequences,or high ploidy characteristics of complex genomes.Herein,we summarize the challenges of and advances in complex plant genome assembly,including feasible experimental strategies,upgrades to sequencing technology,existing assembly methods,and different phasing algorithms.Moreover,we list actual cases of complex genome projects for readers to refer to and draw upon to solve future problems related to complex genomes.Finally,we expect that the accurate,gapless,telomere-totelomere,and fully phased assembly of complex plant genomes could soon become routine. | Weilong Kong Yibin Wang Shengcheng Zhang Jiaxin Yu Xingtan Zhang | 2023 | Genomics, Proteomics & Bioinformatics2023，21，3： | 0 |
| 4 | 福建特异茶树种质资源研究进展显示文摘福建省茶树种质资源丰富,特异资源种类繁多,这些茶树特异资源为研究茶树遗传多样性和茶树生物化学特性发挥重要的作用。茶树特异资源研究有利于拓展茶树资源利用的广度与深度,实现更高的市场价值。本文综述了福建地区高氨基酸、高茶多酚、高咖啡碱、低咖啡碱、高苦茶碱、高EGCG、高EGCG3'Me、叶色变异、高香型等茶树资源的研究进展,对今后茶树特异品种资源应用方向进行展望,以期为茶树遗传育种的研究重点提供参考。 | 俞滢 梁子钧 张磊 赵翊暄 陈强 杨如兴 | 2023 | 茶叶学报2023，64，6： | 0 |
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