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1肠炎沙门氏菌脉冲场凝胶电泳分型研究显示文摘目的 为研究肠炎沙门氏菌菌株间的关系,特建立了分子流行病学研究方法脉冲场凝胶电泳分型方法,并对从食品中分离的肠炎沙门氏菌进行了分型研究。方法 1991~2 0 0 1年间,从河南、黑龙江等省份采集食品样品,分离出肠炎沙门氏菌,挑取单个菌落增菌,用溶菌酶、蛋白酶K和TE缓冲液依次提取菌体DNA后,用限制性内切酶XbaΙ消化胶块,然后在CHEFMapper仪上进行脉冲场凝胶电泳,电泳条件:0 . 5×TBE缓冲液、14℃、1%琼脂糖、脉冲时间5s~4 5s、2 6h、6V cm。应用λ噬菌体DNA作为脉冲场凝胶分子量标准。结果 从鸡肉、牛肉、熟肉及蔬菜中分离出30株肠炎沙门氏菌,其中18株来自河南省,绝大多数菌株(2 2株)分离于2 0 0 1年。对所得菌株进行脉冲场凝胶电泳后,结果显示30株肠炎沙门氏菌分为A、B两个型,两型图谱之间有8个条带的差异。A型菌株有19株,占全部菌株的6 3. 3% ,B型菌株有11株,占36 .7%。A型之内又可以分出2个亚型,其中A1型占78 .9% ,A2亚型与A1亚型相比的差别在于,A2型在5 0kb处有一条带缺失。在菌株分型与采集时间和采集地点之间没有相关性,但所有从鸡肉中分离到的菌株均为A1型,提示了某种有待进一步研究的流行病学趋势。结论 在研究肠炎沙门氏菌不同菌株之间的分子流行病学关系方面。李燕俊 赵熙 杨宝兰 李志刚 刘秀梅 计融 2005卫生研究2005,34,3:37
2鸡源肠炎沙门氏菌对抗菌药物的耐药性分析显示文摘目的调查鸡源肠炎沙门氏菌临床分离株耐药特征。方法从山东省不同来源分离肠炎沙门氏菌,采用微量肉汤稀释法对菌株进行19种抗菌药物敏感性分析;通过PCR方法对菌株携带的耐药基因进行检测;采用脉冲场凝胶电泳对不同场所分离的菌株进行PFGE分型。结果肠炎沙门氏菌分离率为17.94%(178株),菌株对氨苄西林耐药率达到68.54%、对四环素耐药率达到66.85%、对磺胺甲恶唑和萘啶酸耐药率达到100%。而对庆大霉素、氯霉素、多粘菌素敏感,耐药率在5.62%以下。68.54%的菌株(122株)携带Ⅰ型整合子、blaTEM和tetA基因。不同场所分离的肠炎沙门氏菌表现4种PFGE谱型。结论山东省分离的肠炎沙门氏菌对青霉素类、四环素类药物耐药,携带Ⅰ型整合子、blaTEM和tetA耐药基因是导致菌株耐药的主要因素。陆彦 吕安 赵红玉 侯晓林 吴国娟 2014中国人兽共患病学报2014,30,1:29
3沙门氏菌分型研究进展显示文摘沙门氏菌是重要的致病菌之一,该菌属型别繁多。沙门氏菌的分型方法可分为以表型特征为依据的表型分型方法和以基因特征为依据的分子分型方法。沙门氏菌的表型分型主要有血清分型和噬菌体分型。分子分型主要有分子血清分型、脉冲场凝胶电泳(Pulsed field gel electrophoresis,PFGE)、多位点序列分析(Multi-locus sequence typing,MLST)、多位点可变重复序列分析(Multi-locus variable numbers tandem repeat analysis,MLVA)以及成簇的规律间隔的短回文重复序列分析(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)等。与表型分型相比,分子分型技术具有快速、准确、重复性好等特点,现已得到广泛应用。其中,分子血清分型是鉴定沙门氏菌血清型的新方法,PFGE被认为是病原微生物分子分型的'金标准',MLST和MLVA以其分辨率高、可重复性好和可比性强等优势满足了全球流行病学发展的要求,能实现序列数据交换和共享,成为新一代的分子分型新工具,而近年发现的CRISPR分型对同源性较高的同种血清型具有较高的分型能力。但每种分型方法也有各自的优缺点和使用条件及适用范围,因此可以根据菌株特性、分型目的和实验室拥有的条件选择最合适的分型方法。陈玲 张菊梅 杨小鹃 吴清平 2016微生物学通报2016,43,3:29
4沙门氏菌在食品与食源性疾病中分布及病原特征分析显示文摘目的了解食品中沙门氏菌的污染状况及食源性疾病中沙门氏菌的发病率,探讨食品与食源性疾病的相关性,为更好的预防食源性疾病提供科学依据。方法采用分离培养方法及生化实验进行沙门氏菌检测鉴定,并应用微量肉汤稀释法进行药物敏感性试验、玻片凝集法进行血清学试验及PFGE方法进行分子分型。结果 80件生禽肉中检出沙门氏菌21株,阳性率为26.3%;60件生畜肉中检出4株,阳性率为6.7%,两者差异有统计学意义(χ~2=9.885,P=0.002)。采集1 230件腹泻患者肛拭子,检出沙门氏菌80株,阳性率为6.5%,沙门氏菌血清型以鼠伤寒和肠炎沙门氏菌为主,药敏结果显示食品和患者肛拭子中检出的沙门氏菌都对AMP、NAL、SUL、STR耐药比较严重,而对CAZ、CFX、GEN、IMI、AZI、CT、PB、AMI、MEM、KAN都比较敏感,PFGE分子分型结果显示食品与患者中检出的部分沙门氏菌有100%同源性。结论上海市松江区生禽肉中沙门氏菌污染严重,食品和患者中部分菌株具有同源性,结果提示食品与食源性疾病有一定的相关性,同时为食品安全风险监测提供基础数据。李欣 俞佳莉 乔雪飞 吴佳瑾 安娜 夏瑜洁 吴健灏 2020实用预防医学2020,27,7:26
52011-2013年河南省鼠伤寒沙门菌耐药与分子分型研究显示文摘目的 分析2011-2013年河南省鼠伤寒沙门菌临床分离株的耐药状况与脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型带型,为以鼠伤寒沙门菌为代表的食源性疾病暴发预警、调查、溯源及公共卫生意义上的抗生素使用策略提供基线与参考数据。方法 根据国际PulseNet细菌性传染病分子分型监测网络公布的沙门菌PFGE分型技术与美国临床与实验室标准协会(CLSI)沙门菌K-B法药敏测试方案,对2011-2013年分离自我省5个哨点医院的72株鼠伤寒沙门菌进行13种抗生素的药敏测试与PFGE分子分型分析。结果72株沙门菌对8类13种抗生素均有不同程度的耐药,有65株为多重耐药菌株(90.3%),其中耐3~5种的为6株(8.3%),耐6~8种的为34株(47.2%),耐9~10种的为10株(13.9%)。72株鼠伤寒沙门菌经XbaⅠ酶切与脉冲场凝胶电泳后,获得45种带型,每种带型包含菌株数1~9株不等,相似度区间为65.6%~100%。结论 河南省临床分离的鼠伤寒沙门菌耐药状况普遍比较严重,PFGE带型呈现出多样性的同时又具有较显著的优势带型特点,部分带型与其对应的耐药谱具有一定的关联性与相同的聚集性。赵嘉咏 黄丽莉 穆玉姣 谢志强 苏佳 张白帆 夏胜利 许汴利 2016中国人兽共患病学报2016,32,1:23
6副溶血性弧菌引起食物中毒的同源性研究显示文摘目的:探讨深圳市龙岗区由副溶血性弧菌O3:K6型引起食物中毒的分子流行病学研究和同源性分析。方法:收集不同地区、不同时期食物中毒事件的副溶血性弧菌菌株,并从7宗相同血清型O3:K6的溶血性弧菌菌株中,每宗取1株副溶血性弧菌进行生化鉴定、血清学分型、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析。结果:7株副溶血性弧菌,它们的血清型均为O3:K6,脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析结果显示,有2株副溶血性弧菌图谱一致,具有高度的同源性;5株副溶血性弧菌为紧密相关。结论:通过PFGE分子分型的方法了解到该血清型O3:K6的副溶血性弧菌菌株之间具有紧密相关和高度的同源性,表明副溶血性弧菌血清型O3:K6是该地区引起腹泻的主要菌型。甘莉萍 陈应坚 杨慧 兰全学 2008中国卫生检验杂志2008,18,7:20
7北京市丰台区腹泻患者中致泻大肠埃希氏菌感染状况及病原学分析显示文摘目的 了解北京市丰台区腹泻患者致泻大肠埃希氏菌感染状况、分子分型及耐药情况,为该菌的防治及预测预警提供依据及技术支持。方法 对2017年北京市丰台区515份腹泻患者粪便标本进行分离培养、生化鉴定、荧光定量PCR检测、脉冲场凝胶电泳(PulsedFieldGelElectrophoresis,PFGE)分子分型及药敏试验。结果 515份粪便标本共检出64株致泻大肠埃希氏菌,其中产毒性大肠埃希氏菌(ETEC)35株(54.69%)、致病性大肠埃希氏菌(EPEC)17株(26.56%)、黏附性大肠埃希氏菌(EAEC)12株(18.75%)。PFGE结果说明,64株致泻大肠埃希氏菌有不同带型,EPEC聚类分析结果有4组菌株具有100.00%相似带型,EPEC、EAEC聚类分析没有完全一致带型,且带型间相似度较低。药敏试验结果:64株致泻大肠埃希氏菌对氨苄西林耐药率最高,达65.63%;对1种以上抗生素耐药的菌株有48株,占75.00%,最高耐药达7耐。结论 2017年北京市丰台区致泻大肠埃希菌以ETEC为主;菌株分子分型带型成多态性,亲缘关系较远,但也有100.00%相似带型;菌株耐药情况严重,且多重耐药谱广。王兆娥 石婧 尉秀霞 余红 秦萌 封会茹 2018公共卫生与预防医学2018,29,6:19
8脉冲场凝胶电泳技术及其在细菌感染性疾病中的应用显示文摘为研究细菌的流行特征、追踪传染源,国内外广泛采用的方法是对相关菌株进行分型,分析菌株间的同源性关系。细菌分型方法分为表型分型和基因分型两种,表型分型主要有根据菌落形态和生化特征等的生物分型、抗菌药物药敏谱分型、血清分型、噬菌体分型,基因分型包括质粒分型、核糖体分型、染色体DNA限制性内切核酸酶图谱分析(REA)、限制片段长度多态性分析(RFLP)、脉冲场凝胶电泳分型(pulsedfield gel electrophoresis,PFGE)、随机引物PCR(AP-PCR)、重复片段PCR分型、多位点序列分型(MLST)等,其中PFGE是分子分型技术的“金标准”,其结果重复性好,分辨率高,易于标准化,被国内外研究者广泛接受。本文就PFGE技术及其在细菌感染性疾病中的应用进行综述。豆清娅 吴安华 2017中国感染控制杂志2017,16,7:18
9烧伤病房铜绿假单胞菌的耐药检测及脉冲场凝胶电泳分析显示文摘目的了解烧伤病房铜绿假单胞菌的耐药性,用脉冲场凝胶电泳对铜绿假单胞菌进行分子流行病学的调查。方法采用琼脂纸片扩散法对9种抗菌药物作敏感试验,其中20株进行脉冲场凝胶分析。结果20株PAE对9种抗菌药物显示很高的耐药率,多重耐药率为30%;20株菌经脉冲场凝胶分析分别有3组菌株具有同源性。结论铜绿假单胞菌对常用抗菌药物耐药率高,多重耐药情况严重,脉冲场凝胶电泳是研究铜绿假单胞菌分子流行病学较好的基因分型方法。胡锡浩 许小敏 金春光 陈丽娜 2006中华医院感染学杂志2006,16,4:18
10医院感染高产Amp CB-内酰胺酶阴沟肠杆菌的分子流行病学研究显示文摘目的 了解医院感染中高产 Am p Cβ-内酰胺酶阴沟肠杆菌的流行情况。方法 通过药敏实验和等电点分析筛选出高产 Am p Cβ-内酰胺酶的阴沟肠杆菌 ,然后通过诱导实验分析了其 Am p Cβ-内酰胺酶表型 ,最后 ,通过PFGE分型技术考察了其克隆构成情况。结果 在 35株阴沟肠杆菌中 ,2 8株 (80 % )高产 Am p Cβ-内酰胺酶 ,其中18株 (6 5 % )属完全去抑制型 ,10株 (35 % )属部分去抑制型 ;2 8株高产 Am p Cβ-内酰胺酶阴沟肠杆菌的染色体DNA指纹图呈 17种克隆的多克隆构成模式。结论 阴沟肠杆菌引起的医院感染中流行高产 Amp Cβ-内酰胺酶的菌株 ,完全去抑制型为其主要表型 ;其内源性感染方式使阴沟肠杆菌医院感染株呈多克隆构成模式。张磊 李萍 冯萍 2001中华医院感染学杂志2001,11,4:17
11耐亚胺培南铜绿假单胞菌耐药特征及其耐药机制的研究显示文摘目的探讨耐亚胺培南铜绿假单胞菌耐药特征及其耐药机制。方法收集2016年1月至2017年12月东莞地区2家医院110株耐亚胺培南铜绿假单胞菌,采用VITEK2系统分析临床菌株耐药性,脉冲场凝胶电泳(PFGE)行同源性分析,PCR法检测金属β?内酰胺酶相关基因以及oprD基因,并对阳性株进行测序;对oprD基因无中断突变株,利用qRT?PCR检测其mRNA表达情况。结果 110株耐亚胺培南铜绿单胞菌PFGE分析结果显示高度克隆多样性。PCR法检测出18株金属β?内酰胺酶基因阳性的菌株,主要类型是:IMP?25,VIM?2,SIM?2。PCR法检测出107株阳性菌株,测序结果表明有意突变率高达93.46%(100/107),类型包括点突变,缺失突变,插入突变以及提早终止突变。7株oprD mRNA表达量均降低。结论本实验进一步证实了oprD基因缺失,发生广泛有意突变,mRNA表达减少以及金属β?内酰胺酶基因产生是铜绿假单胞菌对亚胺培南耐药的主要机制。李飞 李丽娟 梁德志 王凤平 张拔山 2019分子诊断与治疗杂志2019,11,2:17
12鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的污染分析及PFGE分型研究显示文摘目的了解鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的分布和传播情况。方法参考GB/T4789.9-2008、SN0175-2010、ISO10272-1:2006、FDA/BAM:2001、USDA/FSIS:1998等方法组合出分离鸡源疑似空肠弯曲杆菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)的方法,采用16SrDNA和hipO基因的二重PCR方法对其准确鉴定;采用SmaⅠ对83株空肠弯曲杆菌进行PFGE分型。结果从鸡肉生产链中采集样品519份,分离鉴定出空肠弯曲杆菌180株,分离率为34.87%。其中养鸡场和屠宰场鸡粪样空肠弯曲杆菌分离率分别为74.29%和66.38%,屠宰场和市场的鸡肉样中空肠弯曲杆菌的分离率分别为17.33%和13.66%。83株空肠弯曲杆菌通过PFGE分型结果产生了45种不同的谱型。结论四川省部分地区鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的污染较严重,空肠弯曲杆菌在鸡肉生产链中可能存在水平传播现象。陈荀 刘书亮 吴聪明 韩新锋 陈栎娜 陆思琴 2012中国人兽共患病学报2012,28,10:15
13云南省鼠伤寒沙门氏菌PFGE分子分型及耐药情况显示文摘目的了解云南省鼠伤寒沙门氏菌PFGE分子分型及耐药状况,为防控由鼠伤寒沙门氏菌引起的疾病提供科学依据.方法根据Pulse Net China公布的沙门氏菌PFGE分型技术进行分子分型.分析得出药敏板MIC值,根据CLSI的相应标准获得出S、I、R结果.结果云南省68株鼠伤寒沙门氏菌呈53种PFGE带型.68株鼠伤寒沙门氏菌对复合磺胺(SXT)的耐药率最高,为45.59%,对亚胺培南(IMP)最敏感.其中1株菌对14种抗生素中11种抗生素耐药.结论云南省鼠伤寒沙门氏菌分子分型呈多样性.复方磺胺是云南地区鼠伤寒沙门氏菌最耐药抗菌素.地区鼠伤寒沙门氏菌多重耐药不典型.田云屏 邹颜秋硕 金莉 赵江 任翔 尹建雯 2018昆明医科大学学报2018,39,8:15
14PFGE在医院内感染细菌的分子流行病学方面的应用显示文摘康梅 申艳娜 李明远 2002华西医学2002,17,4:14
15伤寒沙门菌PFGE基因分型研究显示文摘目的了解1979-2005年间河南省分离的伤寒沙门菌菌株的脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因型,探讨河南省伤寒沙门菌的分布、流行及变异情况。方法伤寒沙门菌单个菌落增菌后定量,制备琼脂糖菌体包埋胶块,蛋白酶K等消化处理,限制性内切酶XbaΙ酶切,制备琼脂糖凝胶,脉冲场凝胶电泳获取菌株指纹图谱,图谱条带进行分子量标化,用统计软件进行聚类分析。结果以80%相似度为标准,235株伤寒沙门菌被分成69个不同的PFGE基因型。各地区间和不同年份间基因型既有交叉,又存在差异,2005年有新的基因型出现。结论PFGE基因分型技术在确定菌株之间的分子流行病学关系方面是一种有效、稳定的方法。河南省伤寒沙门菌PFGE基因型别呈现多样性,地区间存在差异。马宏 王建丽 黄丽莉 申晓靖 谢志强 马桂芳 底秀娟 2006医药论坛杂志2006,27,19:14
162006-2010年中国鼠伤寒沙门菌分子分型分析显示文摘目的了解近几年我国鼠伤寒沙门菌临床分离株的分子分型特点,为以实验室为基础的食源性暴发的发现提供基线数据。方法根据国际PulseNet公布的沙门菌PFGE分型方案及鼠伤寒沙门菌多位点MLVA分型方法,对2006-2010年分离自我国7个省(直辖市)的294株鼠伤寒沙门菌进行分子分型分析。结果 294株鼠伤寒沙门菌经XbaⅠ酶切,脉冲场凝胶电泳后,获得87种带型,其分辨能力(D值)为0.905 0。对其中的主要优势带型JPXX01.CN0001菌株76株、JPXX01.CN0006菌株40株和JPXX01.CN0073菌株24株进一步用第2种内切酶BlnⅠ酶切后,分别获得10、22和17种带型。应用MLVA分析,获得198种型别,D值为0.992 9。对流行病学调查显示为鼠伤寒沙门菌暴发病人和食物来源的菌株进行PF-GE双酶切及MLVA分型,两种分型方法获得一致性结果,均显示这些菌株具有明显的聚集性。结论两种分子分型结果显示我国鼠伤寒沙门菌临床分离株具有遗传多样性,MLVA分型方法的分辨能力高于PFGE,在确认鼠伤寒沙门菌引起的暴发事件时,采用需时较短,操作方便的MLVA分型方法可满足菌株聚集性分析。陈建才 樊粉霞 王淑京 娄静 刁保卫 阚飙 赵英伟 闫梅英 2012中国人兽共患病学报2012,28,12:14
172016年福建省单核细胞增生李斯特菌临床病例及食品来源菌株的分子特征分析显示文摘目的研究福建省单核细胞增生李斯特菌感染病例的临床特征及分离菌株的分子型别,为食源性疾病溯源和防控提供参考依据。方法通过监测网报告的感染病例进行个案访谈调查;对2016年临床病例和即食食品来源的单核细胞增生李斯特菌分离株进行血清分型和PFGE分子分型。结果感染病例均为免疫力低下的孕妇和新生儿,3株病例分离株血清型为2株1/2a和1株4b。8株食品分离株血清型为5株1/2a、2株4b和1株1/2b。11株PFGE分为10个型别。结论 2016年福建存在散发的单核细胞增生李斯特菌病例,PT型各异,无同源性。应加强监测、流行病学调查和饮食卫生宣教,保护孕妇和新生儿等高危人群。陈伟伟 吴晓敏 廖冬冬 曾妍 郑盈翔 2019中国人兽共患病学报2019,35,2:14
18耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌分子流行病学研究显示文摘目的分析武汉两所医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)临床分离株产碳青霉烯酶的情况,以及分子流行病学特征。方法收集武汉两所医院2018年1-10月临床分离的42株非重复CRKP,采用CarbaNP试验方法对菌株产碳青霉烯酶情况进行初筛,聚合酶链反应(PCR)检测碳青霉烯酶基因携带情况,采用质粒接合试验分析耐药基因的水平转移情况,应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行亲缘关系分析。结果42株CRKP菌株中14株CarbaNP试验阳性,其中有10株扩增出NDM-1基因,3株扩增出KPC-2基因。共13株CRKP碳青霉烯基因检测阳性,其中12株质粒接合试验成功。PFGE分析结果显示,携带NDM-1基因的CRKP菌株共分成6型,无明显优势型;携带KPC-2基因的CRKP菌株为同一型别。结论检出产NDM-1和KPC-2的CRKP菌株,质粒接合试验提示质粒介导的水平传播在碳青霉烯酶基因的播散过程中可能起重要作用。龚林 刘小丽 许慧琼 梁建生 2019中国感染控制杂志2019,18,7:14
19吉林省致泻大肠埃希氏菌分子分型与耐药性研究显示文摘目的了解吉林省食源性疾病患者中致泻大肠埃希氏菌的毒力基因分布、流行特征、耐药情况、以及PFGE分子分型特征,为致泻大肠埃希氏菌的监测、爆发预警、耐药抗生素规避使用提供依据。方法对2016年从吉林省食源性疾病患者粪便中获得的26株致泻大肠埃希氏菌进行生化鉴定、多重PCR检测毒力基因、MIC微量肉汤稀释法药敏实验以及PFGE脉冲场凝胶电泳分子分型。结果26株致泻大肠埃希氏菌中13株(50%)为EAEC;7株(26.92%)为EPEC;4株(15.38%)为ETEC;2株(7.69%)为EHEC;对四环素、甲氧苄啶/磺胺甲噁唑、环丙沙星耐药极为严重,分别高达92.30%、88.46%和84.62%;XbaI酶切后进行PFGE脉冲场凝胶电泳分为23个型别。结论吉林省腹泻患者中致泻大肠埃希氏菌感染类型以EAEC为主,存在混合感染情况;耐药、多重耐药情况较为严重应加强规范抗生素的使用;在DNA水平上呈现出多态性。石奔 赵薇 孙景昱 杨修军 李可维 2020中国实验诊断学2020,24,10:14
20一起鼠伤寒沙门氏菌食物中毒的流行病学调查显示文摘目的对一起食物中毒事件开展现场流行病学调查,查明导致此次事件的致病因子、传播途径和感染来源,提出针对性预防控制措施建议。方法采用流行病学方法调查事件总体情况、临床特征及三间分布,分析可疑食品或可疑餐次与发病的关联性,开展溯源调查。结果患者临床症状是腹泻、腹痛、发热。潜伏期中位数为27.5 h。66名病例最早的唯一共同就餐时间为2015年5月4日中餐。实验室检测结果显示10名病人便标本、4名食堂从业人员便标本及2件外环境涂抹标本中检出鼠伤寒沙门氏菌,经PFGE图谱同源性比对分析,带型一致。结论该事件为一起由某公司5月4日提供的中餐导致的鼠伤寒沙门氏菌食物中毒。付秀影 黄露 2016首都公共卫生2016,10,2:13
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