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| 1 | Highly Efficient A. T to G. C Base Editing by Cas9n- 3uided tRNA Adenosine Deaminase in Rice显示文摘 | Fang Yan Yongjie Kuang Bin Ren Jingwen Wang Dawei Zhang Honghui Lin Bing Yang Xueping Zhou Huanbin Zhou | 2018 | Molecular Plant2018，11，4： | 26 |
| 2 | A novel class of tRNA-derived small RNAs extremely en- riched in mature mouse sperm显示文摘 | HongyingPeng JunchaoShi YingZhang HeZhang ShangyingLiao WeiLi LiLei ChunshengHan LinaNing YujingCao QiZhou QiChen EnkuiDuan | 2012 | Cell Research2012，22，11： | 20 |
| 3 | Mitochondrial rRNA and tRNA and hearing function显示文摘人的耳朵是为正常通讯的听觉的一台精细的感觉仪器,并且它的合适的工作高度依赖于 mitochondrial oxidativephosphorylation。为 nonsyndromic 和 aminoglycoside-inducedhearing 损失的第一 mitochondrial 点突变在 1993 被识别。从那以后,很多个继承 mitochondrial 变化在听见损失被含有。大多数为联系 mitochondrialdisorder 的听觉损失负责的分子的缺点是在 12S rRNA 基因和 tRNA 基因的变化。在这评论,在对正常听觉机制和 mitochondrial 的短描述以后,我们构画出在联系聋的 mitochondrialmutations 的鉴定被做了的最近的进展,并且讨论 mitochondrial 机能障碍怎么贡献听觉损失。 | Guangqian Xing Zhibin Chen Xin Cao | 2007 | Cell Research2007，17，3： | 19 |
| 4 | Targeted mutagenesis in rice using CRISPR-Cpf1 system显示文摘Cpfl is a class 2/type V CRISPR effector that has been recently harnessed for genome editing(Zetsche et al.,2015;Hur et al.,2016;Kim et al.,2016).Cpfl recognizes thymidine-rich sequence as the protospacer-adjacent motif(PAM)at the 5'end of target sequences.In addition,Cpfl requires only a single shorter crRNA | Xixun Hu Chun Wang Qing Liu Yaping Fu Kejian Wang | 2017 | Journal of Genetics and Genomics2017，44，1： | 17 |
| 5 | Engineering Introns to Express RNA Guides for Cas9- and Cpfl-Mediated Multiplex Genome Editing显示文摘定期聚类 interspaced 短 palindromic 重复(CRISPR ) 系统为指向的 DNA 作为革命站台出现了。这个系统使用一个地点特定的 RNA 指南指导一个 CRISPR 受动器(例如, Cas9 和 Cpf1 ) 到一个 DNA 目标。这里,我们详细描述一般策略同时从 Cas9 和 Cpf1 的 introns 表示多重指南 RNA (gRNA ) 和 CRISPR RNA (crRNA ) 。这个方法利用处理系统或 Cpf1 的 crRNA 处理活动劈开包含 tRNA-gRNA polycistron 或 crRNA-crRNA 数组的拼接的 intron 的内长的 tRNA。我们证明 tRNA-gRNA intron 能作为一基因与 Cas9 熔化。如此的混合基因能用一个聚合酶 II 倡导者被表示,并且在同时指向多重地点展出了高效率和坚韧性。我们 ? 也在调停 Cpf1 的染色体用 intronic tRNA-crRNA 和 crRNA-crRNA 数组编辑实现了这策略。有趣地,包含 Cpf1 和 intronic crRNA 的混合基因与常规 Cpf1 向量相比穿展出显著地增加的效率。一起拿,这研究介绍一个方法从一混合基因表示 CRISPR 试剂增加编辑染色体的效率和能力。由于它的简洁和通用性,这个方法能广泛地被用来在优核质开发复杂 CRISPR 工具。 | Dan Ding Kaiyuan Chen Yuedan Chen Hong Li Kabin Xie | 2018 | Molecular Plant2018，11，4： | 14 |
| 6 | Mitochondrial tRNA mutations associated with deafness显示文摘Mitochondrial tRNA mutations are one of the important causes of both syndromic and non-syndromic deafness. Of those, syndromic deafness-associated tRNA mutations such as tRNALeu(UUR) 3243A>G are often present in heteroplasmy, while non-syndromic deafness-associated tRNA mutations including tRNASer(UCN) 7445A>G are often in homplasmy or in high levels of heteroplasmy. These tRNA mutations are the primary mutations leading to hearing loss. However, other tRNA mutations such as tRNAThr 15927G>A and tRNASer(UCN) 7444G>A may act in synergy with the primary mitochondrial DNA mutations, modulating the phenotypic manifestation of the primary mitochondrial DNA mutations. Theses tRNA mutations cause structural and functional alteration. A failure in tRNA metabolism caused by these tRNA mutations impaired mitochondrial translation and respiration, thereby causing mitochondr ial dysfunctions responsible for deafness. These data offer valuable information for the early diagnosis, management and treatment of maternally inherited deafness. | ZHENG Jing JI Yan-chun GUAN Min-Xin | 2012 | Journal of Otology2012，7，1： | 13 |
| 7 | 母系遗传糖尿病中线粒体tRNA^(leu(UUR))基因突变的研究显示文摘为了解线粒体tRNAleu(UUR)基因nt3243A→G突变在中国人家族性糖尿病中的发生率及该类糖尿病的临床特征,应用聚合酶链反应(PCR)结合限制性内切酶酶切分析,对58例有母亲患病史(第1组)、32例有父亲患病(第2组)、48例有兄弟姐妹患病史(第3组)和50例无家族史(第4组)的糖尿病患者进行该基因的筛查。在第1组和第3组患者中发现5例突变基因阳性者,并对其中2例先证者的家系成员进行临床和基因分析。结果显示该突变在家族中与糖尿病和耳聋共分离。提示这是一种独特的糖尿病亚型,存在于中国人IDDM和NIDDM群体中,在母系遗传糖尿病中有较高的发生率。 | 张庆 曾瑞萍 杜传书 程桦 梁奕铨 | 1997 | 中华医学遗传学杂志1997，14，2： | 10 |
| 8 | 部分ESIEC菌株存在耶尔森氏菌HPI毒力岛显示文摘本文应用小肠结肠炎耶尔森氏菌毒力岛HPI上的irp2、fyuA基因和大肠杆菌染色体上asnT -tRNA位点检测的引物 ,对 43株肠产志贺样毒素且具侵袭力的大肠杆菌 (ESIEC)进行了PCR检测。发现约 34 9%的菌株irp2、fyuA引物扩增阳性 ,而这部分菌株asnT -tRNA位点引物扩增为阴性 ,证实ESIEC中确有耶尔森氏菌毒力岛的irp2、fyuA基因 ,并且也在染色体上asnT -tRNA位点插入。 | 叶长芸 徐建国 | 2000 | 疾病监测2000，15，2： | 10 |
| 9 | 线粒体DNA突变、氨基糖苷类抗生素与耳聋显示文摘耳聋是全球公共卫生问题,严重影响人们的正常生活。据世界卫生组织(WHO)统计,全球约3.6亿人(3.28亿成人和3 200万儿童)有残疾性听力损失。耳聋由遗传因素和环境因素引起,其中大于50%的耳聋患者有遗传基础或遗传易感体质,耳聋的遗传方式可表现为常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传、X连锁遗传和母系遗传。 | 瞿剑伟 王建峰 徐思思 吴欣怡 曹思佩 王金丹 郑斌娇 唐雷雯 | 2015 | 临床耳鼻咽喉头颈外科杂志2015，29，22： | 10 |
| 10 | 线粒体tRNA^(leu(UUR))基因突变和细胞色素C氧化酶活性降低在妊高征发病中的作用显示文摘目的探讨细胞色素C氧化酶活性及线粒体tRNAleu(UUR)基因3243位点A→G突变在妊高征发病中的作用。方法应用聚合酶链反应(PCR)结合限制性核酸内切酶酶切反应,对57例妊高征患者(妊高征组)和60例正常妊娠妇女(对照组)进行线粒体tRNAleu(UUR)基因3243位点A→G突变的检测,并应用紫外分光光度法对两组部分病例的胎盘细胞色素C氧化酶的活性进行测定。结果妊高征组细胞色素C氧化速率为(0.30±0.39)/分,明显低于对照组(0.73±0.54)/分,两组均未检测到线粒体tRNAleu(UUR)基因3243位点A→G突变,仅见294bp片段。结论细胞色素C氧化酶活性降低,可能导致妊高征发病及胎盘功能障碍;线粒体tRNAleu(UUR)基因3243位点A→G突变可能不是引起妊高征的常见原因。 | 张广兰 王泽华 林美华 | 1999 | 中华妇产科杂志1999，34，7： | 9 |
| 11 | 线粒体tRNA^(Leu(UUR))3243A→G突变所致糖尿病的临床特征及治疗显示文摘目的:探讨线粒体tRNALeu(UUR)3243A→G突变所致糖尿病的临床特征及治疗原则。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)对338例随机抽样无亲缘关系的糖尿病患者和132名正常人进行线粒体tRNALeu(UUR)3243A→G突变的检测,并对阳性患者进行临床分析。结果:糖尿病组共检测出6个先证者(1.8%),并在这些家系中共发现13例该突变的糖尿病患者。大部分患者为消瘦体型,10例伴有神经性耳聋,除1例外其他均需用胰岛素治疗。另外,在同一家系中,子代的糖尿病发病年龄明显低于母辈的发病年龄。结论:线粒体tRNALeu(UUR)3243A→G突变所致糖尿病是胰岛β细胞功能缺陷型糖尿病,因此对携带此突变基因者应进行随访,已确诊的患者在可能的条件下应尽早用胰岛素治疗。 | 修玲玲 梁伟 吴华 余斌杰 | 2001 | 新医学2001，32，10： | 9 |
| 12 | Reversible RNA Modification N^1-methyladenosine(m^1A) in mRNA and tRNA显示文摘More than 100 modifications have been found in RNA. Analogous to epigenetic DNA methylation, epitranscriptomic modifications can be written, read, and erased by a complex network of proteins. Apart from N^6-methyladenosine(m^6A), N^1-methyladenosine(m^1A) has been found as a reversible modification in tRNA and mRNA. m^1A occurs at positions 9, 14, and 58 of tRNA, with m^1A58 being critical for t RNA stability. Other than the hundreds of m^1A sites in mRNA and long non-coding RNA transcripts, transcriptome-wide mapping of m^1A also identifies>20 m^1A sites in mitochondrial genes. m^1A in the coding region of mitochondrial transcripts can inhibit the translation of the corresponding proteins. In this review, we summarize the current understanding of m^1A in mRNA and tRNA, covering high-throughput sequencing methods developed for m^1A methylome, m^1A-related enzymes(writers and erasers), as well as its functions in mRNA and tRNA. | Chi Zhang Guifang Jia | 2018 | Genomics, Proteomics & Bioinformatics2018，16，3： | 8 |
| 13 | 线粒体tRNA Thr T15943C突变可能是影响耳聋相关12s rRNA A1555G突变表型表达的新突变位点显示文摘目的通过对一个中国汉族耳聋塞系进行分析研究,探索与耳聋相关的新的继发突变位点。方法对一个中国汉族耳聋家系进行临床和分子遗传学特征分析,然后建立永生化淋巴母细胞系,从细胞倍增时间和活性氧等部分功能实验方面进行验证。结果家系内听力下降的母系成员在听力损失程度和听力曲线方面存在差异。该家系耳聋外显率较高,包括药物致聋的耳聋外显率为66.7%,而非药物致聋的外显率为44.4%。对先证者及母系成员进行线粒体DNA全序列分析,发现除了12s rRNA A1555G和tRNA Thr T15943C突变位点外,其余33个均为已报道的多态性位点。进一步的单体型进化树分析发现,该家系属于东亚线粒体单体型F。15943位点位于tRNA Thr茎结构上,该位点发生T-C碱基变化时会破坏tRNAn Thr 二级结构上十分保守的T-A碱基对。细胞功能实验表明,与相同F单体型的正常对照组和仅携带12s rRNA A1555G单突变家系相比,该双突变耳聋家系永生细胞系的细胞倍增时间均较其他两个对照组延长,活性氧水平则增高。结论线粒体tRNA Thr T15943C突变可能作为潜在的修饰因子与12s rRNA A1555G突变相互作用,从而增强耳聋外显率和表现度。 | 肖红利 何哲耘 高应龙 阳娅玲 郑静 蔡朝阳 郑斌娇 唐霄雯 管敏鑫 | 2015 | 中华医学遗传学杂志2015，32，2： | 7 |
| 14 | 细菌的毒力岛显示文摘毒力岛是指细菌染色体上一段具有典型结构特征的基因簇,主要编码与细菌的毒力及代谢等功能相关的产物,已在致病菌中发现了30几个毒力岛。由于毒力岛具有可移动性,使其在细菌的进化,毒力的获得,以及新病原的出现中均具有重要的意义。 | 叶长芸 徐建国 | 2002 | 微生物学通报2002，29，4： | 7 |
| 15 | 家蚕线粒体ND2、COⅠ和若干tRNA基因的克隆及序列分析显示文摘克隆并测定了家蚕 (Bombyxmori)线粒体基因组 34 6 8bp的EcoRⅠ和HindⅢ双酶切片段序列 ,根据序列同源性比较 ,该DNA片段包括 3个蛋白质编码基因 :ND2基因、COⅠ基因和COⅡ基因 5′端 399bp的序列 ,以及 6个tRNA基因和一个尚待确定的tRNAMet基因。家蚕与果蝇的ND2基因序列同源性约 6 9 7% ,COⅠ基因的同源性约 83 8% ,COⅡ基因 5′端的同源性约 80 % ,这表明细胞色素氧化酶基因在物种间比烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶基因保守。 6个推定的tRNA基因序列与果蝇相应tRNA基因序列差异较大。另外 ,除tRNAGln基因的二级结构相似外 ,其它tRNA基因的二级结构与果蝇相应tRNA基因的二级结构也有较大差异。 | 廖顺尧 刘运强 鲁成 周泽扬 向仲怀 | 2002 | 动物学报2002，48，3： | 7 |
| 16 | Modifications and functional genomics of human transfer RNA显示文摘转移 RNA (tRNA ) 在在一个人的房间的百万个抄本中的十个点是在场的并且是最丰富的 RNA ? 在在所有细胞的 RNA 之中的鼹鼠。tRNA 也是最广泛地修改的 RNA 与在一般水准上, 13 修正每分子。在蛋白质合成的氨基酸和遗传密码的适配器是众所周知的 tRNA 的主要功能。tRNA 修正在译码和另外的细胞的过程起滑稽得多的作用。丰富,修正,和 aminoacylation (收费) tRNAs 的层次贡献以反映房间类型和它的环境的方法译码的 mRNA;然而,这些因素怎么一起工作最大化翻译效率,尚待被理解。tRNAs 也与没涉及翻译的许多蛋白质交往,这可以在房间协调翻译活动和其它过程。这评论集中于修正和人的 tRNA 的功能的 genomics 并且在人的 tRNA 生物学的探索上讨论未来观点。 | Tao Pan | 2018 | Cell Research2018，28，4： | 7 |
| 17 | 硒的分子生物学显示文摘硒蛋白是硒以氨基酸——硒半胱氨酸的形式存在的蛋白质。硒半胱氨酸有自己独特的tR-NA和UGA密码子。硒半胱氨酸的合成发生在它的tRNA上。UGA作为硒半胱氨酸的密码子在自然界是通用的。tRNA的转录由RNA聚合酶Ⅲ催化,还有特异的外部启动子、TATAbox和近端序列元件。硒半胱氨酸参入到蛋白质中需要硒半胱氨酸插入顺序元件(SECIS)和特殊的延长因子。 | 张在香 | 1999 | 国外医学(卫生学分册)1999，26，2： | 6 |
| 18 | 遗传密码子进化的阶段性显示文摘密码子的起源与进化可划分为 4个阶段 ,即 :前密码子期 ,tRNA形成期 ,原密码子与有序肽同步起源期 ,以及密码子进化期 .不同的观点 ,大都能在不同时期找到自己的位置 ,从而是互补的 .在此基础上 ,首次将主要理论的主旨整合为一个进化过程的理论框架 ,基本上协调了持续了近半个世纪的确定论和偶然论之争 。 | 肖敬平 | 2002 | 生命科学研究2002，6，3： | 6 |
| 19 | 中国科学家首次合成一个完整的核酸分子——酵母丙氨酸转移核糖核酸的人工全合成显示文摘“酵母丙氨酸转移核糖核酸(酵母丙氨酸tRNA)人工全合成”研究结果先后发表在1982年的《科学通报》和1983年的《中国科学》上.本工作启动于1968年,完成于1981年11月,是继我国1965年在世界上首次人工合成蛋白质——结晶牛胰岛素后,又在世界上首次人工合成一个核酸分子,其组成、序列和生物功能与天然的酵母丙氨酸tRNA完全相同.人工合成酵母丙氨酸tRNA历时13年.1982-1984年,本研究的主要负责人之一王德宝以“酵母丙氨酸tRNA人工全合成”为题先后在国际tRNA学术研讨会,以及在美国、加拿大、英国、日本和西德等国的大学、研究所做过报告,获得了重视和赞扬. | 祁国荣 | 2010 | 中国科学(C辑)2010，40，1： | 6 |
| 20 | SPORTS1.0: A Tool for Annotating and Profiling Non-coding RNAs Optimized for rRNA-and tRNA-derived Small RNAs显示文摘High-throughput RNA-seq has revolutionized the process of small RNA(sRNA) discovery, leading to a rapid expansion of s RNA categories. In addition to the previously wellcharacterized sRNAs such as micro RNAs(mi RNAs), piwi-interacting RNAs(piRNAs), and small nucleolar RNA(sno RNAs), recent emerging studies have spotlighted on t RNA-derived s RNAs(tsRNAs) and rRNA-derived s RNAs(rs RNAs) as new categories of s RNAs that bear versatile functions. Since existing software and pipelines for sRNA annotation are mostly focused on analyzing mi RNAs or pi RNAs, here we developed the sRNA annotation pipeline optimized for rRNA-and tRNA-derived sRNAs(SPORTS1.0). SPORTS1.0 is optimized for analyzing ts RNAs and rsRNAs from sRNA-seq data, in addition to its capacity to annotate canonical sRNAs such as mi RNAs and pi RNAs. Moreover, SPORTS1.0 can predict potential RNA modification sites based on nucleotide mismatches within sRNAs. SPORTS1.0 is precompiled to annotate s RNAs for a wide range of 68 species across bacteria, yeast, plant, and animal kingdoms, while additional species for analyses could be readily expanded upon end users' input. For demonstration, by analyzing sRNA datasets using SPORTS1.0, we reveal that distinct signatures are present in tsRNAs and rsRNAs from different mouse cell types. We also find that compared to other s RNA species, tsRNAs bear the highest mismatch rate, which is consistent with their highly modified nature. SPORTS1.0 is an opensource software and can be publically accessed at https://github.com/junchaoshi/sports1.0. | Junchao Shi Eun-A Ko Kenton M.Sanders Qi Chen Tong Zhou | 2018 | Genomics, Proteomics & Bioinformatics2018，16，2： | 6 |
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