基于PCR-DGGE技术的剑湖湿地湖滨带土壤微生物群落结构多样性分析

查看全文 作　　者：[1]刘绍雄索引[1]王明月 [2]王娟索引[2]杨宇明 [2]缪福俊 [1]王金华 [1]张敬宜 [1]熊智

机构地区：[1]西南林业大学,西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室,昆明650224;[2]云南省林业科学院,国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室,云南省森林植物繁育和开发利用重点实验室,昆明650204

出　　处：《农业环境科学学报》索引2013年第32卷第7期,共8页

基　　金：国家自然科学基金项目(U0933601);国家重点基础研究发展计划973前期研究专项(2010CB434807);云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010CI016);云南省西南林业大学生物技术特色专业建设项目(50116001);云南省教委湿地生态学创新团队项目资助 摘　　要：为了解剑湖湿地湖滨带植物根际土壤中细菌的群落结构特征多样性,应用PCR-DGGE技术对剑湖湿地湖滨带4种植物根际土壤细菌的群落结构进行了研究,根据DGGE指纹图谱,对它们的遗传多样性进行了分析。结果表明,不同植物群落根际和非根际土壤细菌多样性指数(H′)、丰度(S)和均匀度(J)均有所不同,根际土壤细菌多样性指数、均匀度、丰富度均高于非根际,其中茭草根际土壤细菌多样性指数、均匀度、丰富度均最高,说明植物群落类型与土壤微生物多样性的关系十分密切;不同植物群落根际土壤细菌群落结构相似性较高,非根际土壤细菌群落结构相似性较低,在82%的相似水平上聚为4大类群,根际土壤细菌和茭草非根际土壤细菌聚为一类,其余非根际土壤细菌各聚为一类,说明植物群落对微生物群落结构具有一定的影响。对DGGE的优势条带序列分析,同源性最高的微生物分别属于变形菌门(Proteobacteria)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、紫色杆菌属(Janthinobacte rium)、杜擀氏菌属(Duganella)、埃希氏菌属(Escherichia)和链球菌属(Streptococcus),它们均为未培养微生物。不同植物群落根际土壤氮磷含量均有所差异,其中茭草根际土壤氮磷含量最高,湿地土壤细菌多样性与土壤有机质、总N、总P的含量呈正相关关系,土壤细菌多样性与土壤pH值呈负相关关系。 关键词：PCR—DGGE 剑湖湿地根际微生物多样性

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