基于细胞色素B(Cyt b)基因对翘嘴鲌不同群体遗传多样性的分析

查看全文 作　　者：[1]张桂宁 [1,2]方弟安索引[1]薛向平 [2]张敏莹 [1]冯晓婷 [1]杨雪军

机构地区：[1]上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心,上海201306;[2]中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业农村部长江下游渔业资源环境科学观测实验站,江苏无锡214081

出　　处：《中国农学通报》索引2021年第37卷第23期,共7页

基　　金：国家重点研发计划“太湖大型渔业生境修复与资源养护技术”(2019YFD0901200);江苏省水生生物资源重大专项(ZYHB16)。 摘　　要：为了解长江下游翘嘴鲌(Culter alburnus Basilewsky)不同群体遗传多样性水平,评估其资源状况。研究以淀山湖(DSH)、太湖(TH)、长荡湖(CD)和长江(CJ)4个水域共211尾翘嘴鲌为研究对象,对其线粒体DNA细胞色素b基因(Cyt b)序列进行测序分析,所得基因序列在NCBI中比对,运用MEGA、DNASP等软件分析得到4个翘嘴鲌群体的遗传多样性数据。翘嘴鲌Cyt b基因序列长度为1088 bp,其中碱基A+T含量为55%,G+C为45%。共检测到258个多态位点,占核苷酸总数的23.71%。4个群体211个样本中得到46个单倍型,单倍型多样性为0.849~0.946,具体表现为TH>CD>CJ>DSH。核苷酸多样性为0.0083~0.174,具体表现为DSH> CD>CJ>DSH。4个群体间遗传距离0.052~0.152,太湖群体和淀山湖群体的群体间遗传距离最大为0.152。群体间的遗传分化指数范围为0.197~0.646,基因流值范围为0.152~1.019,其中长江与淀山湖群体的基因流值最小,长江与长荡湖群体的基因流值最大。基于NJ法构建的系统进化树结果显示,4个群体翘嘴鲌没有明显地理区分。本研究结果表明,长江下游翘嘴鲌群体遗传多样性较高,结合近年来翘嘴鲌渔业资源的调查结果,以深入了解其遗传背景和种质资源现状,为翘嘴鲌的野生资源保护提供基础数据。 关键词：翘嘴鲌线粒体DNA 细胞色素B基因遗传多样性

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