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| 1 | 番茄bZIP基因家族的系统进化分析显示文摘bZIP基因家族是一类广泛存在于真核生物中的转录因子家族,参与多个植物生长发育及生物和非生物胁迫的响应过程。目前,已对多个物种的bZIP基因家族进行信息学分析,而未见番茄中bZIP基因家族的分析报道。通过番茄基因组数据库,鉴定和分析番茄bZIP转录因子家族,获得76个bZIP基因家族成员;根据系统进化、基因结构和保守序列的分析将这些基因分成16个亚类;染色体分布和遗传分析揭示,番茄bZIP基因家族存在于12条染色体上并主要以片段复制的方式进行扩增。研究结果为揭示番茄和其他物种的bZIP基因家族成员的功能奠定理论基础。 | 张珍珠 陈秀玲 王沛文 戚飞 谢莹 王傲雪 | 2014 | 东北农业大学学报2014，45，9： | 14 |
| 2 | 番茄YABBY基因家族的生物信息学分析显示文摘YABBY基因家族是植物特有转录因子,与植物形态有关,在植物叶和花器官发育过程中起重要调控作用。试验在番茄基因组范围内鉴定出9个YABBY基因家族成员,分别位于第1、5、6、7、8、11和12号染色体。利用MEGA程序对番茄、拟南芥、大白菜和玉米YABBY基因家族作进化分析,进化树可分为四个亚组;利用GSDS程序分析基因结构保守性,显示Sl YABBY基因内含子保守5~6个;MEME程序作基序分析,显示Sl YABBY基序保守,经鉴定所有Sl YABBYs均具有C2C2锌指结构域及YABBY结构域。运用plant CARE软件分析顺势作用元件发现,在番茄YABBY基因上游1 000 bp序列中存在多个应答不同生物和非生物胁迫的顺式作用元件,且种类和数目不同,表明其作用于番茄生长发育和逆境胁迫过程。基因功能预测和蛋白-蛋白网络分析表明,番茄YABBY家族对根、茎、叶、花、蜜腺、心皮、胚珠等部位发育具有重要调控作用。番茄YABBY基因家族表达分析发现Sl YABBY1、Sl YABBY3和Sl YABBY4在根、茎、花、叶及果实中均无表达,Sl YABBY2和Sl YABBY9表达具有较强组织特异性,为番茄YABBY基因功能研究提供参考。 | 陈秀玲 刘思源 孙婷 刘智琛 陶金宝 赵迎新 王傲雪 | 2017 | 东北农业大学学报2017，48，10： | 14 |
| 3 | 植物Dof转录因子的结构特点及功能研究进展显示文摘Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物中特有的转录因子,其N-末端具含保守锌指结构的Dof结构域,能够识别AAAG序列;Dof转录因子能够发挥多种功能,主要是由于其具有多变的C-末端,它是Dof蛋白的特异转录调控结构域。在植物中,Dof转录因子的功能主要与维管发育、叶片极性、保卫细胞特异基因的调控、碳氮代谢、种子发育和萌发、光响应及光周期调控的开花和花粉发育、次生代谢物合成、防御反应、生长素响应等生理过程有关。将这些进程归纳为组织分化、种子发育和代谢调节三个方面,通过对植物Dof转录因子的结构特点及功能进行分析,为Dof转录因子的深入研究提供参考。 | 张雪 尹悦佳 范贝 李慧杰 费小钰 崔喜艳 | 2016 | 作物杂志2016，，2： | 11 |
| 4 | 马铃薯基因组中Dof转录因子家族的鉴定与表达特征分析显示文摘Dof(DNA-binding with one zinc finger)锌指蛋白是植物特有的一类转录因子,在多种代谢途径中发挥着重要作用。为全面了解Dof基因在马铃薯基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了马铃薯Dof基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域进行了预测,分析了Dof基因在不同组织和系列胁迫下的表达特征。结果表明,马铃薯Dof转录因子家族由35个基因编码43个蛋白质;基因分布于除7号和12号染色体外的其余10条染色体上;STDOF蛋白长度在165~503个氨基酸之间,等电点介于4.72~10.04;系统发生分析表明,STDOF蛋白分为4个亚族;转录组数据分析显示,St Dof基因的表达具有组织特异性,在不同胁迫条件下,多数St Dof基因的表达也呈现有不同程度的差异。本研究为深入探讨St Dof基因的功能及在马铃薯的遗传改良中的应用奠定了基础。 | 吴智明 张圣旭 梁关生 | 2015 | 核农学报2015，29，7： | 10 |
| 5 | Dof转录因子在植物中的调控作用显示文摘DNA binding with one finger(Dof)蛋白是植物中特有的一类转录因子,自1993年在玉米中发现该转录因子到如今已有26年的历史。Dof蛋白只有一个由52个氨基酸组成的单锌指保守结构域,该结构域包含4个保守的半胱氨酸残基和一个二价锌离子,这两者都是Dof转录因子重要的组成部分,二者缺一不可,若半胱氨酸发生突变,或存在其他二价离子螯合剂都将会影响锌指结构的生成,进而使Dof蛋白不能与DNA结合,导致其丧失活性。半胱氨酸残基和Zn2+可以共价结合构成CX2CX21CX2C基序,此基序能够特异识别启动子中的AAAG(或CTTT)序列,从而激活或抑制靶基因的表达。Dof蛋白C-末端氨基酸序列的多变性导致该转录因子进化的多样性,从而在植物的生长发育过程中发挥着不同且重要的功能,如种子萌发、维管的发育和叶片极性、花和花粉发育、光周期反应、参与碳和氮的代谢、合成次生代谢产物、植物的逆境响应过程等。围绕着Dof转录因子的结构、系统进化关系、motif的组成和在植物中发挥的功能展开综述,以期为后续Dof转录因子的研究奠定相应的理论基础。 | 郭彦秀 陈静 王艳芳 孙春玉 王义 张美萍 | 2019 | 生物技术通报2019，35，5： | 9 |
| 6 | 核桃转录因子JrDof3的克隆及渗透胁迫表达分析显示文摘【目的】Dof转录因子普遍存在于植物,含有特殊的C2-C2型单锌指结构(C2-C2-Dof domain),在调控植物生命过程中发挥着重要作用,参与激素应答、碳固定和氮同化与吸收、开花结实等过程。但目前有关Dof转录因子响应逆境胁迫的研究报道较少,旨在探讨核桃Dof转录因子响应逆境胁迫的表达情况,探讨其响应逆境的潜在能力,为核桃抗逆优良品种选育及产业科学管理筛选重要的候选基因,并提供理论基础。【方法】从‘香玲’核桃转录组中鉴定出1条Dof基因(命名:JrDof3),对JrDof3基因上游启动子包含的顺式作用元件进行分析,预测其潜在的逆境响应功能;对该基因进行BLASTP搜索获得同源蛋白,利用MEGA构建进化树;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法对JrDof3基因在盐、干旱及ABA胁迫下的表达进行分析。【结果】JrDof3基因的完整开放读码框(ORF)长为873 bp,编码的多肽包含291个氨基酸,蛋白分子量为30.54 ku,理论等电点为9.36。系统发育分析发现JrDof3蛋白与来自壳斗科栎属的欧洲栓皮栎Quercus suber QsDof2.4蛋白具有较近的进化关系。其上游1 299 bp启动子包含逆境响应相关的DOF、MYB、MYC、WRKY等顺式作用元件和激素响应相关的ARFAT等元件。非生物胁迫下的表达分析发现JrDof3基因受NaCl、PEG6000及ABA诱导,且分别在处理24 h、3 d、48 h被诱导最为明显,分别为对照的6.56、7.82、6.08倍。【结论】JrDof3基因能积极响应渗透(盐和干旱)胁迫,并受上游启动子调控;且其逆境响应调控可能涉及ABA信号通路;JrDof3可作为核桃逆境响应调控的重要候选基因。 | 马凯恒 张彤 闫鹏宇 李文凯 李大培 杨桂燕 | 2020 | 中南林业科技大学学报2020，40，10： | 7 |
| 7 | 植物Dof基因结构特点及功能研究进展显示文摘DNA结合单锌指(DNA binding with one zinc finger,Dof)蛋白是由多基因共同编码的只在植物中存在的一类转录因子,其N-末端含有高度保守的由52个氨基酸残基组成的C2-C2型单锌指结构域,可以与DNA和蛋白质结合并相互作用;C-末端是特异转录调控结构域,因其序列具有多变性,导致Dof基因功能的多样性。随着基因组学和生物信息学的发展,近年来已有多个物种的Dof蛋白相继被报道出来。Dof基因主要参与植物的生长发育、碳氮代谢、非生物胁迫及开花调控等生物学过程。综述了植物Dof转录因子的结构特性、已经报道的Dof基因数目及生物学功能,在此基础上讨论了毛竹开花研究存在的问题,并提出未来的展望,以期为进一步研究Dof转录因子提供参考。 | 刘俊 金钰 吴耀松 刘燕 王文彬 任闪闪 刁松锋 陈玉龙 | 2020 | 生物技术通报2020，36，10： | 6 |
| 8 | 小桐子Dof基因家族生物信息学与表达分析显示文摘Dof转录因子在植物的生长发育和非生物胁迫响应中起重要的调控作用。在本研究中,总共24个小桐子Dof基因被鉴定。保守域分析结果表明,小桐子Dof蛋白的结构域均含有CX2CX21CX2C基序。染色体定位分析结果表明,23个Dof基因不均匀地分布在9个连锁群(LGs)上。系统发育树表明,24个小桐子Dof蛋白被分成9个组。在这24个Dof基因中,大多数在被检测的组织中显示出差异表达; 14个Dof基因的表达在至少1个胁迫(干旱或盐胁迫)条件下显示出增加或者降低。在这14个差异表达Dof基因中,8个Dof基因(Jc Dof4、Jc Dof8、Jcdof9、Jcdof10、Jcdof11、Jcdof21 Jcdof22、Jcdof24)在至少1个处理时间点表现出对干旱和盐胁迫响应,2个基因(Jc Dof2、Jc Dof23)仅对盐胁迫响应,4个基因(Jc Dof3、Jc Dof5、Jc Dof17、Jc Dof20)仅对干旱胁迫响应。该结果将为进一步研究Dof基因在调控小桐子生长发育和非生物胁迫响应中的作用提供一些有价值的信息。 | 唐跃辉 包欣欣 王健 冯荆城 张梦 张慧聪 刘梦兰 王玉瑾 娄慧敏 闫浩 谭结 王清伟 刘坤 | 2019 | 江苏农业学报2019，35，1： | 5 |
| 9 | Transcriptome analyses of the Dof-like gene family in grapevine reveal its involvement in berry, flower and seed development显示文摘The Dof(DNA-binding with one finger)protein family spans a group of plant transcription factors involved in the regulation of several functions,such as plant responses to stress,hormones and light,phytochrome signaling and seed germination.Here we describe the Dof-like gene family in grapevine(Vitis vinifera L.),which consists of 25 genes coding for Dof.An extensive in silico characterization of the VviDofL gene family was performed.Additionally,the expression of the entire gene family was assessed in 54 grapevine tissues and organs using an integrated approach with microarray(cv Corvina)and real-time PCR(cv Pinot Noir)analyses.The phylogenetic analysis comparing grapevine sequences with those of Arabidopsis,tomato,poplar and already described Dof genes in other species allowed us to identify several duplicated genes.The diversification of grapevine DofL genes during evolution likely resulted in a broader range of biological roles.Furthermore,distinct expression patterns were identified between samples analyzed,corroborating such hypothesis.Our expression results indicate that several VviDofL genes perform their functional roles mainly during flower,berry and seed development,highlighting their importance for grapevine growth and production.The identification of similar expression profiles between both approaches strongly suggests that these genes have important regulatory roles that are evolutionally conserved between grapevine cvs Corvina and Pinot Noir. | Danielle Costenaro da Silva Vítor da Silveira Falavigna Marianna Fasoli Vanessa Buffon Diogo Denardi Porto Georgios Joannis Pappas Jr Mario Pezzotti Giancarlo Pasquali Luís Fernando Revers | 2016 | Horticulture Research2016，3，1： | 5 |
| 10 | 不结球白菜BrCDF1的克隆和蛋白亚细胞定位及其与BrFKF1蛋白的互作验证显示文摘[目的]本文旨在揭示CDF1基因在不结球白菜(Brassica rapa ssp.chinensis)抽薹开花过程中的调控机制,验证其是否与FKF1蛋白发生互作。[方法]以‘苏州青’为材料,采用同源克隆方法获得BrCDF1基因全长序列,并与其他物种进行氨基酸序列比对;将BrCDF1与报告基因YFP融合构建亚细胞定位载体p Early Gate101-BrCDF1-YFP,采用农杆菌介导的方法将其瞬时表达于本氏烟(Nicotiana benthamiana)叶片中;激光共聚焦显微镜观察,利用酵母双杂交和双分子荧光互补技术验证不结球白菜BrCDF1和BrFKF1蛋白是否存在互作。[结果]BrCDF1基因含有876 bp开放阅读框,编码292个氨基酸。与甘蓝型油菜(Brassica napus)、野甘蓝(原变种)(Brassica oleracea var.oleracea)、萝卜(Raphanus sativus)的氨基酸序列比对结果显示:BrCDF1在进化过程中的保守程度分别为91.11%、88.25%、84.76%,保守性较高。BrCDF1蛋白定位于细胞核中,BrCDF1和BrFKF1之间存在相互作用。[结论]BrCDF1定位于细胞核,并且与BrFKF1互作,在进化过程中保守性较高,并可能参与了不结球白菜的光周期开花途径。 | 吴小婷 邵帅旭 李英 张昌伟 侯喜林 沈振国 刘同坤 | 2017 | 南京农业大学学报2017，40，5： | 3 |
| 11 | 9个玉米DOF基因对逆境胁迫的响应模式分析显示文摘植物DOF(DNA-binding with one zinc finger)锌指蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育及代谢途径中发挥着重要作用。该研究采用qRT-PCR方法分析了玉米应答逆境(盐、干旱、硝态氮缺乏和铵态氮缺乏)胁迫条件下9个ZmDOFs基因的表达模式。结果表明:(1)生物信息学分析显示,9个ZmDOF基因散布于5个染色体上,聚类为一个基因亚家族,且9个基因还可以细分为4个小亚家族。(2)9个ZmDOFs基因的表达具有组织特异性,且主要在玉米的穗和雄花中表达,其中ZmDOF1、ZmDOF4、ZmDOF11和ZmDOF12在穗部的表达量分别是根部的18倍、60倍、11倍和75倍以上,ZmDOF19、ZmDOF26、ZmDOF27和ZmDOF42在雄花中的表达量分别是根部的360倍、28倍、13倍和44倍以上,推测这些基因在玉米的雄花和穗的生长发育进程中具有重要的作用。(3)实时定量qRT-PCR方法显示,在硝态氮胁迫下有7个ZmDOFs基因强烈诱导表达(>5倍),其中ZmDOF12、ZmDOF27和ZmDOF42基因的表达超过10倍,表明这些基因参与调控硝态氮胁迫的响应途径;有7个ZmDOFs基因受铵态氮胁迫的强烈诱导表达(>2倍),表明这7个基因在玉米应答铵态氮胁迫中起作用;有5个ZmDOFs基因受PEG6000胁迫的强烈诱导表达(>2倍),其中ZmDOF34的表达上调超过10倍;有8个ZmDOFs基因受NaCl胁迫的强烈诱导表达(>2倍),其中ZmDOF4、ZmDOF11和ZmDOF12的表达上调在10倍以上,表明这些基因在玉米抵御干旱或盐胁迫中起重要作用。 | 贾利强 赵秋芳 陈曙 | 2020 | 西北植物学报2020，40，8： | 2 |
| 12 | 转录因子BvM14-Dof3.4响应盐胁迫的功能研究显示文摘Dof(DNA binding with one finger)家族转录因子是植物特异的转录因子,在胁迫响应、种子发芽、氮同化、光合作用等多种生物学过程中发挥着重要作用。为了探究转录因子BvM14-Dof3.4在响应盐胁迫过程中的生物学功能,本研究以具有强耐盐特性的甜菜M14品系为试验材料,用花序浸染法将BvM14-Dof3.4基因在野生型拟南芥植株中异源表达,经150 mmol/L NaCl处理后发现,BvM14-Dof3.4基因的异源表达促进了盐胁迫下转基因拟南芥植株根的生长,提高了异源表达植株的鲜重和干重,与野生型拟南芥相比异源表达植株中K^(+)/Na^(+)比值增加1.3倍、甜菜碱含量增加1.1倍以及SOD和POD的酶活性分别上调1.3和1.2倍,从而减少了盐胁迫对异源表达拟南芥植株的损伤。这些结果表明了BvM14-Dof3.4基因响应盐胁迫,并且BvM14-Dof3.4基因的异源表达能够提高拟南芥植株的耐盐能力,该结果对甜菜M14品系优质基因资源的挖掘以及开展栽培甜菜抗逆性的遗传改良工作具有重要意义。 | 杜晓雪 黄园园 马春泉 李海英 | 2021 | 中国农学通报2021，37，21： | 2 |
| 13 | 药用植物金银花Dof基因家族的筛选及表达分析显示文摘Dof(DNA-binding one zinc finger)蛋白是一类植物所特有的转录因子,N-末端具有高度保守的C2-C2单锌指结构域,C-末端的转录调控区的氨基酸具有高度多样性,其在植物光合、细胞周期及逆境响应等过程中发挥着重要的作用。本研究基于金银花测序数据,利用生物信息学的方法筛选了候选的LjDof基因,并对其理化性质、亚细胞定位、同源序列比对、保守基序、系统进化发育和表达模式进行了深入分析。结果表明,金银花Dof转录因子家族包含11个基因,编码的氨基酸的个数为157~492,理论等电点为5.45~9.48,均为不稳定亲水性蛋白。亚细胞定位显示,LjDof基因都在细胞核中有定位,个别在其他部位也有定位。同源比对和Motif分析发现,11个LjDof基因都含有完整的C2-C2单锌指结构。系统进化发育分析表明,金银花Dof蛋白分为五个亚类。实时荧光定量PCR及表达模式分析表明,LjDof基因在金银花低温胁迫不同时间下有着不同的表达规律。本研究结果为进一步研究金银花Dof基因在逆境胁迫下的功能提供了理论基础。 | 乔永刚 陈亮 王勇飞 崔芬芬 曹亚萍 贺嘉欣 贾孟君 宋芸 | 2020 | 核农学报2020，34，9： | 2 |
| 14 | 黄藤Dof家族的全基因组鉴定及系统进化分析显示文摘为了揭示黄藤全基因组中Dof基因家族的生物学功能,利用生物信息学手段,对黄藤Dof基因家族进行了全基因组鉴定,并系统分析了黄藤与其他9个物种Dof基因家族分子进化关系。结果表明:黄藤基因组中含有25个Dof基因,亚细胞定位预测发现它们均位于细胞核,跨膜结构预测到黄藤所有的Dof蛋白成员均不具有跨膜结构;黄藤的Dof蛋白家族均为不稳定亲水蛋白,其二级结构由α-螺旋、无规则卷曲为主导,其三级结构主要由α-螺旋和β-转角进行复杂的空间构象变化组成;黄藤Dof蛋白成员的氨基酸个数为184到586 AA,pI范围为4.71~9.57;根据系统进化分析,黄藤Dof基因家族分为ClassⅠ-ClassⅣ共4个亚组,其中ClassⅡ成员最多(8个),约占总数的32%;其次是ClassⅣ(7个)、ClassⅠ(5个)和ClassⅢ(5个);从组别上来看,ClassⅡ成员分化速度是最快的,与原始祖先的亲缘关系最远。从组中来看,ClassⅡ中成员DjDof9和DjDof10分化最快,与原始祖先的亲缘关系最远,DjDof12和DjDof24分化较慢,与原始祖先的亲缘关系相对较近;黄藤与拟南芥的进化关系表明两者亲缘关系不是很近;黄藤与其他9个物种的Dof基因的系统进化分析表明黄藤与甘蓝型油菜和小麦有较近的亲缘关系,序列同源性也较高,与可可亲缘关系最远。 | 张丹丹 杨瑶君 江纳 付春 | 2021 | 西南林业大学学报(自然科学)2021，41，6： | 2 |
| 15 | 11个玉米DOF基因对逆境胁迫的表达模式分析显示文摘研究玉米DOF基因在玉米不同组织和非生物胁迫条件下的响应表达模式,为进一步阐明玉米DOF基因的生物学功能提供有价值的信息。利用qRT-PCR技术探测11个玉米DOF基因在‘郑58’自交系不同组织中以及在200 mmol/L NaCl溶液、20%PEG6000溶液和铵态氮、硝态氮缺乏胁迫等条件下的表达模式。进化树分析结果表明,这11个ZmDOF基因聚为一个家族,可进一步划归为4组。表达分析结果表明,有6个ZmDOF基因具有组织特异性表达模式,集中在雄花中表达,表明这6个ZmDOF基因在雄花生长发育进程中发挥作用。ZmDOF22和ZmDOF40没有检测到表达,可能是表达量太低或者特异时空表达模式。在模拟盐和干旱胁迫下,多数ZmDOF基因表达上调,其中分别有2个和6个基因的表达上调至少5倍。在铵态氮或硝态氮胁迫处理下,分别有3个和5个基因的表达量上调至少5倍,而ZmDOF2和ZmDOF18/ZmDOF39的表达量明显受到抑制。结果预示这11个ZmDOF基因可能广泛参与玉米生长发育以及抵御各种逆境胁迫的响应途径。 | 贾利强 赵秋芳 陈曙 | 2021 | 西北农业学报2021，30，7： | 1 |
| 16 | 转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达显示文摘单锌指DNA结合蛋白(DNA binding with one finger,Dof)是植物中特有的一类转录因子,在植物生长发育与非生物胁迫响应中发挥非常重要的作用。利用妃子笑荔枝果实发育RNA-seq数据库,采用生物信息学分析方法,对荔枝Dof(LcDof)基因家族的基本理化特性,亚细胞定位,蛋白质保守结构域,进化关系等进行分析,同时对LcDof基因家族在果实发育中的表达情况进行分析。结果表明:荔枝中包含有19个LcDof基因家族成员,LcDof编码蛋白范围在157~497个氨基酸残基(Amino acid,aa),对应的分子量为17.70~54.35 kDa,等电点(pI)范围为4.49~9.42;预测LcDof家族成员亚细胞定位均定位于细胞核。系统进化关系分析表明,LcDof基因家族分为4组(GroupⅠ~GroupⅣ),LcDof在不同发育阶段的表达模式不同,其中LcDof7、LcDof9、LcDof12、LcDof15在果肉不同发育时期表达量较高,而LcDof3、LcDof10、LcDof16、LcDof17、LcDof19表达量较低。 | 董晨 魏永赞 王弋 郑雪文 李伟才 | 2021 | 热带生物学报2021，12，1： | 1 |
| 17 | 玉米ZmCDF1的克隆、编码蛋白的亚细胞定位及其与ZmGI的互作关系显示文摘为研究CDF1在玉米光周期开花途径中的作用,本文确定了ZmCDF1的亚细胞定位及其与ZmGI的互作关系。本文以玉米自交系B73为材料,克隆获得了玉米ZmCDF1的全长编码序列(coding sequence,CDS),并与其他6个物种进行了氨基酸序列比对。结果显示ZmCDF1基因含有2个外显子,3个内含子,CDS序列全长1296 bp,编码432个氨基酸,包含一个典型的Dof(DNA binding with one finger)结构域。亚细胞定位显示,ZmCDF1定位于细胞核中。酵母双杂交和荧光素酶互补实验显示ZmCDF1能够与玉米光周期途径的重要因子ZmGI互作。上述结果暗示ZmCDF1在玉米光周期途径中发挥重要作用。本研究为玉米光周期开花途径提供了新的基因资源。 | 杨敏 胥华伟 王翠玲 杨护 魏岳荣 | 2020 | 植物生理学报2020，56，5： | 1 |
| 18 | 绿豆Dof家族基因的生物信息学分析及盐胁迫下的表达分析显示文摘【目的】Dof家族基因是植物特有的一类转录因子,在植物的生长发育、细胞的防御反应等方面具有重要的调控作用。【方法】本文从绿豆转录组数据库中筛选出41条Dof基因,对其蛋白序列进行生物信息学分析和盐胁迫下表达分析。【结果】Dof基因分布在除6号染色体外的1~11号染色体上,都具有1个高度保守的结构域;Dof蛋白含有5~28个磷酸化位点,并且都定位在细胞核里;系统进化分析将Dof基因分为8个组别,分析发现相同组别的Dof基因有相似的基因结构和蛋白基序,而不同组别间则存在差异;Dof基因能够响应盐胁迫,但不同胁迫时间基因间的表达模式存在差异,同组别的基因表达模式存在一定程度的相似性。【结论】相同组别的Dof基因具有相似的基因结构和蛋白基序,推测它们有相似的生物学功能。Dof基因能够不同程度响应盐胁迫,说明它们在绿豆抵御盐胁迫中发挥不同作用,这些分析结果将为绿豆Dof基因功能研究提供参考。 | 张文慧 杜吉到 贺登美 谷心茹 黄勇 国凤双 | 2021 | 西南农业学报2021，34，6： | 1 |
| 19 | 青花菜BoDof5.3基因的克隆及渍水胁迫表达特征分析显示文摘从青花菜中克隆得到一个Dof基因,命名为BoDof5.3。序列分析结果表明:该基因ORF全长774 bp,编码257个氨基酸,编码的蛋白质为亲水性蛋白质。青花菜BoDof5.3蛋白具有典型的Zf-Dof结构域,其二级结构以无规则卷曲为主。系统进化分析结果表明,青花菜BoDof5.3蛋白与甘蓝、花椰菜Dof蛋白亲缘关系最近,在进化树上聚为一组,同属植物的Dof蛋白具有较近的亲缘关系。qRT-PCR分析结果显示,在渍水胁迫0 d到2 d时,BoDof5.3基因表达量呈下降趋势,6 d时表达量升高为对照的1.3倍,推测该基因可能参与青花菜渍水胁迫的响应。 | 裴徐梨 荆赞革 徐境 唐征 宋波 | 2020 | 江苏农业学报2020，36，6： | 1 |
| 20 | 黄花蒿Dof基因家族鉴定及在GA-UV处理下对青蒿素生物合成的影响显示文摘目的 Dof(DNA binding with one finger)家族是高等植物中特有的一类转录因子家族,参与植物中光、激素、非生物胁迫等多种胁迫响应调控。本研究基于全基因组数据对黄花蒿Dof(AaDof)转录因子家族进行鉴定及表达模式分析,探究Dof家族基因在青蒿素合成调控中的作用。方法 经PFAM数据库鉴定获得AaDof序列,通过生物信息学软件分析其理化性质、亚细胞定位、基因结构、蛋白保守结构以及启动子序列结合元件等,并基于赤霉素(Gibberellic acid,GA)、紫外线B(UV-B)及二者协同胁迫下黄花蒿转录组数据对其表达模式进行分析。结果 本研究从全基因组水平共鉴定出51个AaDof基因,均含有保守的C2-C2单锌指结构,依据系统发育分析分为8个亚族,同一亚族内基因结构与蛋白保守结构域相对保守。亚细胞定位预测显示12个AaDof蛋白定位在细胞外,其余均定位在细胞核。启动子元件分析发现AaDof家族基因启动子区富含光、激素等多种响应元件。对AaDof在GA、UV-B和GA+UV-B处理下的表达模式分析发现,AaDof基因对GA胁迫处理响应较弱,仅有少量基因敏感,其表达主要受到UV-B胁迫影响。C1及C2.1亚族大部分基因在UV-B胁迫下上调表达,而A亚族大部分基因在UV-B胁迫下下调表达。qRT-PCR验证表明AaDof1、AaDof17和AaDof44在GA和UV-B处理下表达量显著上调,推测其可能通过参与GA和UV-B调控网络,正向调控青蒿素生物合成。结论 本研究系统鉴定了黄花蒿AaDof家族基因并筛选了3个可能正向调控青蒿素生物合成的候选AaDof基因,为黄花蒿Dof家族基因功能研究及其在青蒿素生物合成中的调控机制解析奠定基础。 | 王星文 邬兰 马婷玉 尹青岗 师玉华 向丽 | 2022 | 世界科学技术-中医药现代化2022，24，5： | 0 |
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