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| 1 | GS6, A Member of the GRAS Gene Family,Negatively Regulates Grain Size in Rice显示文摘Grain size is an important yield related trait in rice.Intensive arti cial selection for grain size during domestication is evidenced by the larger grains of most of today’s cultivars compared with their wild relatives.However,the molecular genetic control of rice grain size is still not well characterized.Here,we report the identi cation and cloning of Grain Size 6(GS6),which plays an important role in reducing grain size in rice.A premature stop at the t348 position in the coding sequence(CDS)of GS6 increased grain width and weight signi cantly.Alignment of the CDS regions of GS6 in 90 rice materials revealed three GS6alleles.Most japonica varieties(95%)harbor the Type I haplotype,and 62.9%of indica varieties harbor the Type II haplotype.Association analysis revealed that the Type I haplotype tends to increase the width and weight of grains more than either of the Type II or Type III haplotypes.Further investigation of genetic diversity and the evolutionary mechanisms of GS6showed that the GS6gene was strongly selected in japonica cultivars.In addition,a'ggc'repeat region identi ed in the region that encodes the GRAS domain of GS6 played an important historic role in the domestication of grain size in rice.Knowledge of the function of GS6might aid efforts to elucidate the molecular mechanisms that control grain development and evolution in rice plants,and could facilitate the genetic improvement of rice yield. | Lianjun Sun Xiaojiao Li Yongcai Fu Zuofeng Zhu Lubin Tan Fengxia Liu Xianyou Sun Xuewen Sun Chuanqing Sun | 2013 | Journal of Integrative Plant Biology2013，55，10： | 44 |
| 2 | 利用RIL群体对水稻再生力及相关农艺性状的QTL分析显示文摘以粳糯稻品种糯89-1与籼型重穗型杂交稻骨干恢复系蜀恢527杂交构建的籼粳交F7代RIL群体的169个家系为作图群体,构建了一张含105个微卫星(SSR)标记的分子连锁图谱。定位了水稻正季7个农艺性状的QTL15个,分布在第1、第2、第3、第5、第6、第7、第10染色体上,LOD值介于2.10~7.51,贡献率3.77%~25.37%,其中贡献率10.0%以上的QTL7个,单个性状的QTL1~4个;定位了水稻再生季7个农艺性状的QTL19个,分布在第1、第2、第3、第4、第5、第6、第7、第10染色体上,LOD值介于2.17~18.34,贡献率3.23%~37.66%,其中贡献率10.0%以上的QTL7个,单个性状的QTL1~5个;定位了影响水稻再生力(最终再生率)的QTL2个(qRA4,qRA5),分别在第4和第5染色体上,贡献率分别为8.17%和7.09%,加性效应分别为0.32和0.39,贡献率和加性效应均较小,属微效基因。共检测到两季农艺性状QTL36个,同一性状被重复检测的QTL8个。水稻再生力与正季稻有效穗呈极显著负相关;水稻再生力与再生稻有效穗呈极显著正相关,与每穗总粒数和着粒密度呈显著负相关。QTL定位结果揭示了有效穗是影响再生力的主要因素。 | 杨川航 王玉平 涂斌 李婷 胡亮 李仕贵 | 2012 | 作物学报2012，38，7： | 21 |
| 3 | 水稻垩白性状遗传育种研究进展显示文摘水稻(Oryza sativa L.)垩白包括垩白率和垩白度,是重要的外观品质之一,对其他品质性状也有重要影响,阐明水稻垩白性状的遗传机制十分重要。近年来随着水稻功能基因组学和分子标记技术的发展,越来越多的垩白基因获得了克隆。本文综述了水稻垩白的评价指标、与其他品质性状的关系、遗传基础、垩白QTL定位和垩白基因克隆,并提出了借助显性核不育系进行轮回选择改良水稻垩白的分子育种策略,以期为水稻垩白性状的分子改良提供参考和借鉴。 | 邱先进 袁志华 何文静 刘环 徐建龙 邢丹英 | 2014 | 植物遗传资源学报2014，15，5： | 21 |
| 4 | Quantitative Trait Loci for Grain Chalkiness and Endosperm Transparency Detected in Three Recombinant Inbred Line Populations of Indica Rice显示文摘Quantitative trait loci(QTL) for percentage of chalky grain,degree of chalkiness,and endosperm transparency were detected using 3 recombinant inbred line populations derived from crosses between parental lines of commercial three-line hybrids of indica rice.Two of the populations showed great variations on heading date,and the other had a short range of heading date variation.A total of 40 QTLs were detected and fell into 15 regions of 10 chromosomes,of which 5 regions were detected for 1 or more same traits over different populations,2 were detected for different traits in different populations,3 were detected for 2 or all the 3 traits in a single population,and 5 were detected for a single trait in a single population.Most of these QTLs have been reported previously,but a region located on the long arm of chromosome 10 showing significant effects in all the 3 populations has not been reported before.It was shown that a number of gene cloned,including the Wx and Alk for the physiochemical property of rice grain,and GW2,GS3 and GW5 for grain weight and grain size,could have played important roles for the genetic control of grain chalkiness in rice,but there are many more QTLs exerting stable effects for rice chalkiness over different genetic backgrounds.It is worth paying more attentions to these regions which harbor QTL such as the qPCG5.2/qDC5.2/qET5.2 and qPCG10/qDC10/qET10 detected in our study.Our results also showed that the use of segregating populations having high-uniform heading date could greatly increase the efficiency of the identification of QTL responsible for traits that are subjected to great environmental influence. | MEI De-yong ZHU Yu-jun YU Yong-hong FAN Ye-yang HUANG De-run ZHUANG Jie-yun | 2013 | Journal of Integrative Agriculture2013，12，1： | 19 |
| 5 | 水稻垩白性状的遗传研究进展显示文摘垩白性状是稻米最重要的品质性状之一,阐明水稻垩白性状的遗传机理十分重要.主要对水稻垩白的遗传基础、垩白数量性状位点(Quantitative trait loci,QTL)的定位及其垩白性状相关基因的分离与克隆进行了综述,并提出了相应的遗传改良措施,以期为优质水稻育种提供参考和借鉴. | 彭波 孙艳芳 李琪瑞 李丹 庞瑞华 周棋赢 宋晓华 李慧龙 宋世枝 | 2016 | 信阳师范学院学报(自然科学版)2016，29，2： | 19 |
| 6 | 用全基因组关联分析解析籼稻垩白的遗传基础显示文摘利用272份全球籼稻微核心种质的重测序SNP基因型,对海南三亚、广东深圳、浙江杭州和湖北荆州4个地点收集到的垩白粒率和垩白度性状采用TASSEL软件进行全基因组关联分析,解析籼稻垩白的遗传基础和挖掘影响垩白粒率和垩白度的优异等位基因。结果表明,依据SNP数据,可将籼稻微核心种质分成3个亚群。4个地点分别检测到42个和44个与垩白粒率和垩白度显著关联的位点,位于全部12条染色体上。2个性状分别有21个和19个位点在2个以上环境下同时被检测到,这些位点中有12个位点同时影响垩白粒率和垩白度,11个位点附近都有已克隆的水稻品质相关基因。其中,第5染色体3.3~5.3 Mb区间在4个地点都被检测到与垩白粒率显著关联,以杭州点对垩白粒率的贡献最大,优异等位基因载体品种为IRGC121689;第12染色体的17.5~18.0 Mb区间在三亚和杭州都被检测到与垩白度显著关联,以三亚点的垩白度贡献最大,优异等位基因载体品种为IRGC122285。这些位点和品种资源可作水稻外观品质分子改良的重要基因和品种资源。 | 邱先进 袁志华 陈凯 杜斌 何文静 杨隆维 徐建龙 邢丹英 吕文恺 | 2015 | 作物学报2015，41，7： | 16 |
| 7 | 豫南香稻品种Badh2基因功能标记的检测及应用显示文摘【目的】香稻中香味的产生是由于水稻第8染色体上面Badh2基因的功能缺失而导致2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)前体物质的增多,进而2AP积累使稻米产生香气。【方法】本研究利用Badh2基因开发的7个功能标记,针对豫南地区16份香稻品种进行了检测与分析。【结果】4份香稻品种属于第2外显子突变类型,2份香稻品种属于第4~5外显子突变类型,5份香稻品种属于第7外显子突变类型;并没有发现Badh2基因启动子区及第12~14外显子突变类型的香稻品种。【结论】通过Badh2基因功能标记的检测与分析,本研究鉴定了豫南香稻品种对应的突变类型,为利用分子标记辅助选择培育优质香稻新品种奠定基础。 | 彭波 孔冬艳 庞瑞华 孙艳芳 宋晓华 李慧龙 王青林 韩爽 郭桂英 李金涛 周棋赢 段斌 宋世枝 | 2017 | 西南农业学报2017，30，8： | 11 |
| 8 | 水稻千粒重和垩白粒率相关性分析及其QTL定位显示文摘千粒重和垩白粒率是水稻重要的产量和品质性状。本研究以粳稻Sasanishiki为受体、籼稻品种Habataki为供体构建的染色体片段渗入系群体(Introgression Lines,ILs)为材料,在两个不同的环境下进行了千粒重和垩白粒率相关性分析和QTL定位。相关分析表明,在两个不同的环境下,群体千粒重和垩白粒率之间相关性不显著。两个环境共检测到9个稻谷千粒重QTL、5个糙米千粒重QTL和6个垩白粒率QTL,分布在水稻的10条染色体上。在两个不同的环境下重复检测到其中的5个QTL,即影响稻谷千粒重的qPTGW3、qPTGW8.2和qPTGW11.1及控制垩白粒率qPGWC1.1和qPGWC1.2。其所对应染色体片段渗入系的相应性状与背景亲本Sasanishiki的表现型差异在连续两个环境中均达到显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)水平。这些材料为优良粒重和垩白粒率QTL的克隆及水稻产量和外观品质的标记辅助选择(MAS)育种利用提供了基础。 | 边建民 贺浩华 石桓 朱昌兰 彭小松 傅军如 贺小鹏 陈小荣 胡丽芳 欧阳林娟 | 2014 | 核农学报2014，28，1： | 10 |
| 9 | 利用高世代回交群体检测水稻垩白相关性状QTL显示文摘[目的]探究水稻垩白性状,为水稻垩白形成分子机制研究和水稻品质育种提供材料。[方法]通过高产品种‘桂朝2号’与低垩白优质品种‘越光’连续回交和分子标记辅助选择方法,构建一套包含71个家系的高世代回交群体,分别在2013年南京和2014年海南对其垩白粒率和垩白度2个性状进行表型调查和QTL检测。[结果]南京和海南两年两地垩白粒率和垩白度2个性状都存在显著相关。两年两地共检测到33个与垩白粒率相关的QTL,其中5个QTL在2个环境中重复检测到,分别位于第4染色体RM1359-RM16939和SSR11-RM17332区间,第5染色体RM13-RM430区间,第7染色体RM5344-RM6872区间,以及第8染色体RM152-RS73区间。两年两地共检测到了17个与垩白度相关的QTL,其中3个QTL能够重复检测到,分别位于第4染色体RM1359-RM16939区间,第8染色体RM152-RS73区间,以及第10染色体RM467-RM271区间,且有2个位点与垩白粒率位点重合。同时发现定位QTL中,有7个QTL属于一因多效,对垩白粒率及垩白度都有一定影响。[结论]本文共检测到50个垩白性状相关的QTL,其中有7个位点能够被重复检测到,其中控制垩白粒率的q PGWC4.1、q PGWC4、qPGWC7.1,控制垩白度的qDPGWC4.1、qDPGWC8.1和qDPGWC10.1,是新的QTL。 | 王林森 陈亮明 王沛然 王卓然 郑海 马宏阳 江玲 赵志刚 万建民 | 2016 | 南京农业大学学报2016，39，2： | 8 |
| 10 | 不同播种期对日本“黄金晴”稻米品质性状的影响显示文摘【目的】研究不同播种期对'黄金晴'稻米品质的影响,实现日本'黄金晴'稻米品质提升,促进日本'黄金晴'在豫南地区应用与推广。【方法】针对来源于日本的优质水稻品种'黄金晴',在2014和2016年采用分批播种试验,并结合不同播种期'黄金晴'全生育期内对应的气象资料进行综合分析。【结果】日本'黄金晴'的加工品质(糙米率、精米率和整精米率)、稻米蛋白质含量(糙米蛋白质含量和精米蛋白质含量)和食味值与灌浆期温度(最低温度、最高温度和日平均温度)之间成反比,即随着播种期的推迟,灌浆期温度的降低,稻米的加工品质、蛋白质含量和食味值显著提升;日本'黄金晴'的垩白性状(垩白率、垩白面积和垩白度)与灌浆期温度(最低温度、最高温度和日平均温度)之间成正比,灌浆期温度高,稻米中的垩白率、垩白面积和垩白度都有所增加。2年试验数据表明,随着播种期的延迟,灌浆期温度降低,日本'黄金晴'稻米加工品质、蛋白质含量、垩白率、垩白面积、垩白度和食味值等重要品质性状均得到逐步提高。【结论】在实际生产中可以通过改变日本'黄金晴'播种期,将其灌浆期调整到一个相对有利的时期,为实现日本'黄金晴'在豫南地区的应用与推广奠定基础。 | 彭波 宋晓华 段斌 易常会 孔冬艳 彭宇 柳琳 庞瑞华 孙艳芳 李慧龙 郭桂英 李金涛 周棋赢 宋世枝 | 2018 | 西南农业学报2018，31，9： | 8 |
| 11 | 江苏省水稻品质性状遗传和重要基因克隆研究进展显示文摘水稻(Oryza sativa L.)是保障我国粮食安全和农业可持续发展的主粮作物,江苏是我国重要的水稻种植区。经过40多年的发展,江苏水稻产量和品质性状研究都取得了重要进展。稻米品质性状组成复杂,涉及生产、加工、销售和消费多方面。本文对江苏省水稻几个主要品质性状的遗传研究历程进行了概括,重点对水稻外观品质、蒸煮食味品质和营养品质的遗传调控研究进行了总结。文章介绍了稻米品质性状的经典遗传规律和分子遗传特点,综述了各个品质性状遗传调控相关的重要功能基因。相关研究成果凸显了江苏水稻品质遗传改良基础研究在国内外的重要地位。特别指出,随着水稻功能基因组学的发展和品质性状遗传调控网络的明晰,未来针对特定或复合品质性状的分子设计育种是江苏水稻品质遗传改良研究中要重点推进的方向。 | 张昌泉 冯琳皓 顾铭洪 刘巧泉 | 2021 | 遗传2021，43，5： | 8 |
| 12 | 利用染色体单片段代换系定位水稻垩白QTL显示文摘为了鉴定和定位水稻垩白相关QTL,分析其遗传效应,利用籼稻品种广陆矮4号为受体,粳稻品种日本晴为供体构建的84个染色体单片段代换系群体为试验材料,通过单因素方差分析和Dunnett′s多重比较,对代换片段上垩白相关QTL进行鉴定。以P≤0.001为阈值,共检测到36个垩白相关QTL。其中,垩白度QTL共19个,其加性效应值为-6.44~12.86,加性效应百分率为-34.04%~68.02%。垩白粒率相关QTL共17个,其加性效应值为-7.32~3.63,加性效应百分率为-8.07%~4.00%。这些QTL的鉴定为进一步精细定位并克隆相应QTL,提高稻米外观品质奠定了基础。 | 陶亚军 徐梦彬 王飞 陈达 周勇 梁国华 | 2015 | 华北农学报2015，30，1： | 7 |
| 13 | 60 Years of Development of the Journal of Integrative Plant Biology显示文摘In celebration of JIPB's 60 th anniversary,this paper summarizes and reviews the development process of the journal.To start,we offer our heartfelt thanks to JIPB's pioneer Editors-in-Chief who helped get the journal off the ground and make it successful.Academic achievement is the soul of academic journals,and this paper summarizes JIPB's course of academic development by analyzing it in four stages:the first two stages are mostly qualitative analyses,and the latter two stages are dedicated to quantitative analyses.Most-cited papers were statistically analyzed.Improvements in editing,publication,distribution and online accessibility-which are detailed in this paper-contribute to JIPB's sustainable development.In addition,JIPB's evaluation index and awards are provided with accompanying pictures.At the end of the paper,JIPB's milestones are listed chronologically.We believe that JIPB's development,from a national journal to an international one,parallels the development of the Chinese plant sciences. | Jinzhong Cui Ping He Fenghong Liu Jingjing Tan Lingfeng Chen Joshua Fenn | 2012 | Journal of Integrative Plant Biology2012，54，10： | 5 |
| 14 | Genetic dissection of rice appearance quality and cooked rice elongation by genome-wide association study显示文摘Appearance and cooked rice elongation are key quality traits of rice. Although some QTL for these traits have been identified, understanding of the genetic relationship between them remains limited. In the present study, large phenotypic variation was observed in 760 accessions from the 3 K Rice Genomes Project for both appearance quality and cooked rice elongation. Most component traits of appearance quality and cooked rice elongation showed significant pairwise correlations, but a low correlation was found between appearance quality and cooked rice elongation. A genome-wide association study identified 74 QTL distributed on all 12 chromosomes for grain length, grain width, length to width ratio, degree of endosperm with chalkiness, rice elongation difference, and elongation index. Thirteen regions containing QTL stably expressed in multiple environments and/or exerting pleiotropic effects on multiple traits were detected. By gene-based association analysis and haplotype analysis, 46 candidate genes, including five cloned genes, and 49 favorable alleles were identified for these 13 QTL. The effect of the candidate gene Wx on rice elongation difference was validated by a transgenic strategy. These results shed light on the genetic bases of appearance quality and cooked rice elongation and provide gene resources for improving rice quality by molecular breeding. | Xianjin Qiu Jing Yang Fan Zhang Yanan Niu Xiuqing Zhao Congcong Shen Kai Chen Sheng Teng Jianlong Xu | 2021 | The Crop Journal2021，9，6： | 5 |
| 15 | 不同环境基于高密度遗传图谱的稻米外观品质QTL定位显示文摘为解析稻米外观品质遗传基础,挖掘稳定存在的控制稻米外观品质性状的QTL,本研究以籼稻品种V20B和爪哇稻品种CPSLO17作为亲本,构建包含150个重组自交家系(recombinantion inbred line,RIL)的RIL作图群体,进行外观品质性状QTL定位分析。利用特定位点扩增长度测序(SLAF-seq)技术,构建了一个由12个连锁群包含8602个标记,平均间距为0.29 cM的高密度遗传图谱。采用Ici Mapping 4.0软件的ICIM-ADD方法在3种环境(贵阳、贵定、三亚)对4个外观品质性状(粒长、粒宽、垩白度和垩白粒率)进行QTL(quantitative trait locus)定位分析。结果表明:3种环境共检测到9个粒长QTL、6个粒宽QTL、3个垩白度QTL和4个垩白粒率QTL;有5个QTL在多个环境被重复检测到,其中3种环境都定位到的粒宽QTL q GW5-1和垩白度QTL qCha5-1为同一定位区间(第5染色体的Marker1642127-Marker1514505);此外,垩白度QTL qCha5-2的定位区间(Marker1554573-Marker1554589)和垩白粒率QTL qCGP5-2也是一样的。序列比对发现QTL qCha5-1定位区间仅51.5 kb,是新的垩白性状主效QTL。本研究结果不仅为挖掘新的外观品质性状基因奠定基础,也有助于开发新的分子标记进行水稻外观品质性状遗传改良。 | 彭强 李佳丽 张大双 姜雪 邓茹月 吴健强 朱速松 | 2018 | 作物学报2018，44，8： | 5 |
| 16 | 稻米垩白性状的研究进展显示文摘垩白是影响稻米品质的重要性状。本文综述了稻米垩白形成的生理机制、垩白的遗传及分子生物学研究进展,讨论了水稻垩白性状改良的策略。 | 陈峰 王海凤 高洁 周学标 信彩云 张士永 徐建第 袁守江 | 2018 | 大麦与谷类科学2018，35，2： | 3 |
| 17 | 水稻垩白性状的遗传研究进展及遗传改良策略显示文摘垩白是评价稻米外观品质的重要指标,培育垩白度较小和垩白粒率较低的水稻(Oryza sativa L.)品种是水稻育种研究的重要目标之一。垩白属于复杂的数量性状,受多基因控制,而且易受环境条件影响。近10年来,在水稻12条染色体上定位了近百个与垩白相关的QTL。对控制垩白性状的QTL特别是能稳定表达QTL的定位研究、垩白相关基因的克隆以及垩白性状与其他农艺性状的关联等方面进行了综述,提出了通过分子育种技术并结合表型鉴定技术培育优质稻品种的策略。 | 杜雪树 戚华雄 | 2016 | 湖北农业科学2016，55，23： | 3 |
| 18 | 稻米垩白形成的生理与分子机制研究进展显示文摘垩白是稻米胚乳中白色不透明的部分,垩白粒率高是影响南方稻区优质粳米生产的主要限制因素之一。目前,仅有3个垩白QTLs被精细定位或克隆,16个参与淀粉与蛋白质合成、降解及其调控相关的基因被鉴定与垩白的发生密切相关。但其受基因型和环境所共同控制的复杂性,以及试验材料和研究方法等因素所限,对垩白形成的生理与分子机制尚未完全明晰。从试验材料创新、采用系统生物学理论和技术以及碳氮代谢的视角进一步探究垩白形成的生理与分子机制,将有助于破解垩白较高这一制约我国南方粳稻优质生产的主要难题。 | 林赵淼 郑德益 张新城 刘正辉 王绍华 丁艳锋 | 2015 | 中国稻米2015，21，4： | 3 |
| 19 | 稻米垩白性状的遗传研究进展显示文摘垩白是影响稻米品质的重要因素,揭示稻米垩白性状的遗传机理是低垩白优质稻选育的理论基础。近年来,国内外研究人员成功定位和克隆了一些控制稻米垩白性状的基因。综述了稻米垩白性状的经典遗传研究、QTL定位和基因克隆等方面的研究进展。 | 雷东阳 唐文帮 祝瑜 | 2014 | 杂交水稻2014，29，6： | 2 |
| 20 | 水稻心白突变体xb1的淀粉理化特性分析显示文摘淀粉是稻米胚乳的主要成分,解析其理化特性对改良水稻品质具有十分重要的意义。为了探究心白稻米淀粉的理化特性,本研究以经EMS诱导粳稻品种辽星1号获得的心白突变体xb1为材料,利用扫描电镜、激光粒度分析仪、RVA快速黏度分析仪、差示扫描量热仪等方法,对形态结构、淀粉颗粒结构和粒径分布、糊化特性及热力学特性等进行了分析。结果表明,与野生型相比,突变体xb1籽粒的粒宽、粒厚和千粒重均显著降低;淀粉结构和淀粉粒粒径分布均发生改变,淀粉粒粒径值大于13左右的淀粉粒数量明显低于野生型;突变体种子中蛋白质含量极显著高于野生型,总淀粉含量极显著低于野生型,而直链淀粉含量没有明显改变;在支链淀粉分支结构上,聚合度(DP)在6-9之间的短链及25-35之间的中长链比例有所增加,而DP值在10-24之间的中短链及36-50之间的长链比例有所减少;突变体xb1淀粉的糊化起始温度(To)、峰值温度(Tp)、终止温度(Tc)和糊化距离(Tr)均未发生明显改变,只有热焓值(△H)极显著提高。同时,突变体xb1的RVA谱特征值中,热浆黏度(HPV)、峰值黏度(PKV)、冷胶黏度(CPV)和消减值(SBV)极显著提高,崩解值(BDV)和回复值(CSV)极显著降低。本研究结果为探索垩白形成的生理机制以及进一步的基因克隆奠定了基础。 | 吕军 姜秀英 刘军 解文孝 韩勇 沈枫 | 2021 | 核农学报2021，35，10： | 2 |
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