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| 1 | MicroRNA expression profiling in diabetic GK rat model显示文摘MicroRNAs (miRNAs ) 是小搁浅单人赛的非编码的 RNA 的一个最新识别的班,经由 post-transcriptional 调整他们的目标基因小径。miRNAs 在许多生物过程起重要作用,这被证明了。为了更好理解 miRNA,在类型 2 糖尿病上工作,我们使用了 oligonucleotide microarray 监视 GotoKakizaki (GK ) 和 Wistar 老鼠的骨胳的肌肉的 miRNA 表达式侧面。七 miRNAs 是下面表示的,二 miRNAs 在 GK 老鼠的肌肉是过去表示的,这被发现。在他们之中, miR-24 显示出最突出的变化。p38 MAPK,是 miR-24 的一个直接目标,也显示出表示差别。所有数据给 miR-24 可能通过 p38 MAPK 的下面规定与糖尿病被联系的线索。 | Bing Huang Wenming Qin Botao Zhao Yi Shi Chengguo Yao Jin Li Huasheng Xiao Youxin Jin | 2009 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2009，41，6： | 17 |
| 2 | MicroRNA in cell differentiation and development显示文摘The regulation of gene expression by microRNAs(miRNAs) is a recently discovered pattern of gene regulation in animals and plants.MiRNAs have been implicated in various aspects of animal development and cell differentiation,such as early embryonic development,neuronal development,muscle development,and lymphocyte development,by the analysis of genetic deletions of individual miRNAs in mammals.These studies show that miRNAs are key regulators in animal development and are potential causes of human diseases.Here we review some recent discoveries about the functions of miRNAs in cell differentiation and development. | SHI Yi & JIN YouXin State Key Laboratory of Molecular Biology,Shanghai Institute of Biochemistry and Cell Biology,Shanghai Institutes for Biological Sciences,Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200031,China | 2009 | Science China(Life Sciences)2009，52，3： | 11 |
| 3 | MiR-181a-5p inhibits cell proliferation and migration by targeting Kras in non-small cell lung cancer A549 cells显示文摘MicroRNAs 玩在 carcinogenesis 和肿瘤的重要角色进行。肺癌症是世界范围的癌症死亡的领先的原因。在这研究, miR-181a-5p 的功能在 non-small-cell 肺癌症(NSCLC ) 被调查。结果证明 miR-181a-5p 显著地在 NSCLC 纸巾和房间线被减少。有 miR-181a-5p 的 A549 房间 transfected 的增长和迁居模仿显著地被禁止。酶活动试金结果证明 Kras 的二个有约束力的地点能被 miR-181a-5p 直接指向。而且, Kras 由在 transcriptional 和翻译层次的 miR-181a-5p 是下面调整的。调停 SiRNA 的 Kras 下面规定能模仿 miR-181a-5p 的效果在 A549 模仿房间。我们的调查结果建议 miR-181a-5p 由部分指向 Kras 在肿瘤抑制起一个潜在的作用并且在 NSCLC 病人有潜在的治疗学的申请。 | Zhongliang Ma Xiang Qiu Detao Wang Yanli Li Bingjie Zhang Tianwei Yuan Jiali Wei Botao Zhao Xintai Zhao Jiatao LOU Yan Jin Youxin Jin | 2015 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2015，47，8： | 8 |
| 4 | BMPRII is a direct target of miR-21显示文摘MicroRNAs (miRNAs ) 是在 post-transcriptional 阶段调整血缘的 mRNA 表情的小非编码的 RNA 的一种类型。尽管几 miRNAs 被知道涉及各种各样的生物进程,包括发展预定, patterning, embryogenesis,区别和 organogenesis,生长控制,和 apoptosis,许多目标基因和大多数 miRNAs 的函数仍然是不清楚的。因为仅仅在动物房间在 miRNAs 和他们的目标之间有部分补充,为给定的 miRNA 识别特定的目标基因并且阐明是困难的它的功能。在这研究,我们证实了形态基因的蛋白质受体 II (BMPRII ) 是的那根骨头 miR-21 的一个直接目标,并且也证明 BMPRII 的蛋白质水平在 PC3 和 Lncap 房间与 miR-21 的数量相反地相关。这些调查结果建议 miR-21 可以在由调整 BMPRII 的表示调整恶意和前列腺癌症房间并且在干细胞的自强的变形能力有一个潜在的角色。 | Wenming Qin Botao Zhao Yi Shi Chengguo Yao Li Jin Youxin Jin | 2009 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2009，41，7： | 5 |
| 5 | MicroRNA expression profiling during neural differentiation of mouse embryonic carcinoma P19 cells显示文摘MicroRNAs (或 miRNAs ) 是涉及与房间的发展和区别有关的大量活动的小非编码的 RNA (2125 核苷酸) 。区分的神经干细胞的有那些的鼠标 P19 胚胎的癌房间的 miRNA 表达式侧面的比较证明表达式在区别以后 65 铺平改变的 miRNAs (2 褶层) 。MiR-124a 是戏剧性地起来调整的(超过 20 褶层) 当在 miR-290295 簇的 miR-302 家庭和那些的 miRNAs 是强烈下面调整的时。进一步的分析表明象 Oct4 和 Sox2 那样的一些重要因素看起来涉及这些 miRNAs 的规定。这些结果可以在早老鼠胚胎贡献调整 miRNA 的神经区别的更好的理解。 | Bing Huang Wei Li Botao Zhao Caihong Xia Ruqiang Liang Kangcheng Ruan Naihe Jing Youxin Jin | 2009 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2009，41，3： | 5 |
| 6 | EBV-Induced Human CD8^+ NKT Cells Synergise CD4^+ NKT Cells Suppressing EBV-Associated Tumours upon Induction of Thl-Bias显示文摘 | Wei Xiao Li Li Rui Zhou Ruijing Xiao Yujuan Wang Xiang Ji Mengjun Wu Lan Wang Wei Huang Xiaoling Zheng Xinti Tan Lang Chen Tao Xiong Jie Xiong Youxin Jin Jinquan Tan Yuling He | 2009 | Cellular & Molecular Immunology2009，6，5： | 5 |
| 7 | Development of a low-cost detection method for miRNA microarray显示文摘MicroRNA (miRNA ) microarray 是一个强大的工具探索 miRNA 介绍的表示。在 miRNA microarray 使用的当前的察觉方法主要是基于的荧光,它通常要求象激光那样的昂贵的察觉系统几万美元的共焦的扫描仪。最近,我们基于连接酶的试金为 miRNA microarray 开发了一个便宜还敏感的察觉方法。在这条途径, biotinylated miRNAs 被在 microarray 上使不能调动的探针滑动的相应 oligonucleotide 捕获;然后 biotinylated miRNAs 将捕获结合 streptavidin 的碱的磷酸酶。每个 biotinylated miRNA 点上的紫色黑色猛冲被酶生产催化反应。它能被数字照相机在一台显微镜上装了的一台电荷耦合的设备容易检测,它降低与荧光方法的相比花去超过 100 褶层的察觉。我们的数据与 biotinylated miRNA 集中和察觉限制显示出点相互关联的那信号紧张很好因为 miRNAs 是动态范围跨越的至少 0.4 fmol 和察觉大约 2.5 个数量级,它比得上荧光方法的。 | Wei Li Botao Zhao Youxin Jin Kangcheng Ruan | 2010 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2010，42，4： | 3 |
| 8 | A glucocorticoid amplifies IL-2-induced selective expansion of CD4^+CD25^+FOXP3^+ regulatory T cells in vivo and suppresses graft-versus-host disease after allogeneic lymphocyte transplantation显示文摘规章的 T (Treg ) 房间是不仅阻止 autoimmunity,而且控制大量 T 房间依赖者免疫者回答的 T 房间的 subpopulation。Glucocorticoid 处理(dexamethasone,或 Dex ) 被报导了放大在 Treg 房间的 vivo 扩大选择的 IL-2-mediated。我们同时在一个鼠科的 allogeneic 淋巴细胞移植模型予施主以 Dex 和 IL-2 在接枝扩展功能的镇压 CD4+CD25+FOXP3+ T 房间并且提起规章的 T 房间 / 受动器 T 房间(Treg/Teff ) 比率阻止 graft-versus-host 疾病(GVHD ) 。在有 Dex (5 mg/kg/day ) 和为 3 天的 IL-2 (300,000 IU/mouse/day ) 的施主的联合处理以后,接枝受到流动 cytometric 分析,并且移植 812 个星期从男 C57BL/6 老鼠被执行到女 BALB/c 老鼠。结果显示出 Dex 的那个短期的同时的政府, IL-2 显著地在鼠科的怒气扩展了功能的镇压 CD4+CD25+FOXP3+ T 房间。在这个鼠科的 allogeneic 移植模型,从有 Dex 和 IL-2 预告的处理的施主的接枝比为控制组为接受者导致了一更长的幸存时间(中部的幸存时间 > 60 白天对 12 白天, P = 0.0002 ) 。Treg/Teff 的比率也显著地增加了(0. | Yanhui Xie Min Wu Runhua Song Jiexian Ma Yi Shi Wenming Qin Youxin Jin | 2009 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2009，41，9： | 3 |
| 9 | Cloning of Novel Repeat-associated Small RNAs Derived from Hairpin Precursors in Oryza sativa显示文摘包括 microRNAs (miRNAs ) 种小非编码的 RNA,小介入 RNA (siRNAs ) 和交易的 siRNAs,在房间在 modulating 基因表达起重要作用。这里,我们孤立 21 个新奇内长的小 RNA 分子,从 18 ~ 24 核苷酸,在能被印射到 111 位发卡先锋的 Oryza sativa。进一步的分析显示大多数这些发卡序列从通常认为的缩小的转换重复的 transposable 元素发源, miRNA 内长的 siRNAs 经常是的像发卡的先锋和植物是特征的 DNA transposon.Considering 的一种主要类型在转座子定位了区域,我们假设了我们的克隆的小 RNA 可能在在 siRNAs 和 miRNAs.Northern 污点分析之间的进化进程代表中间的产品,这显示他们中的五个更富有地与另外的纸巾相比在花被表示,在开花期暗示他们的潜在的函数。在结论,我们的结果充实米饭小 RNA 数据并且在植物为小 RNA 注解提供一个有意义的观点。 | Chengguo YAO Botao ZHAO Wei LI Yang LI Wenming QIN Bing HUANG Youxin JIN | 2007 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2007，39，11： | 2 |
| 10 | Species-specific aminoacylation of Oryza sativa mitochondrial tRNA^(Trp)显示文摘Abstract The details of species- spe- cific aminoacylation in Oryza sativa mitochondrial tRNATrp by bacterial and eukaryotic (cytoplasm) tryptophanyl-tRNA synthetases (TrpRS) were inves- tigated. Seven single or multiple mutations of three bases (G73, U72, A 68) were made in O. sativa mi- tochondrial tRNATrp to the corresponding nucleotides present in human tRNATrp. In vitro transcripts of these mutant genes were tryptophanylated by Bacil- lus subtilis and human tryptophanyl-tRNA syntheta- ses (TrpRS), and the kinetic parameters were deter- mined. The results showed that the aminoacylation of seven mutant transcripts by B. subtilis TrpRS was 53.33%―99.79% less efficient than that by wild-type O. sativa mitochondrial tRNATrp, but was 4―330 times more efficient than that by human TrpRS. The mutant MPH7 (G73, U72 and C68 in O. sativa mito- chondrial tRNA were all replaced by the counterpart residues from human tRNATrp and showed a great change in aminoacylation efficiency. Our results in- dicate that the species-specific identity elements of O. sativa mitochondrial tRNATrp are similar to bacterial and eukaryotic (cytoplasm). They are mainly located at the discriminator base, the first and the fifth pairs of bases, the discriminator base G73, two bases in the acceptor stem G1/U72 and U5/A68. Our results also provide new data in support of the hypothesis that mitochondrial tRNATrp is of eubacterial origin. | JIN Xiaoling TAO Zhijian JIA Jie HE Xinxia JIN Youxin | 2006 | Chinese Science Bulletin2006，51，7： | 2 |
| 11 | MiR-200a is involved in rat epididymal development by targeting β-catenin mRNA显示文摘在到成年人的从出生后的开发的老鼠的 epididymis 的 350 microRNAs (miRNAs ) 的表达式(从出生后的天 770 ) 与自制 miRNA microarray 被介绍。在他们之中, 48 miRNAs 显著地变化了,在哪个 miR-200a 的表示与时间显然增加了,在与从北污点分析获得了那的一个好协议。即时量聚合酶的链反应结果显示老鼠 -catenin 的那时间的表情确切在老鼠 epididymal 开发期间是到 miR-200a 的 inversed,暗示 miR-200a 可能也指向在由 Saydam 等报导了的老鼠 epididymis 的 -catenin mRNA。在人。生物信息的分析显示老鼠 -catenin mRNA 的 3 untranslated 区域确实为 miR-200a 包含了一个通常认为的有约束力的地点。同时,这个有约束力的地点的顺序与有二邻近的核苷酸(U 和 C ) 的删除的人的 -catenin mRNA 的不同,这被发现。但是在老鼠 NRK 房间在 HEK 293T 房间和 miR-200a 的 overexpression 指向试金的酶的结果证明 miR-200a 确实指向了老鼠 -catenin mRNA 并且引起它的表示的抑制。所有这些结果证明 miR-200a 应该被指向老鼠的 -catenin mRNA 并且压制它的表达式涉及老鼠 epididymal 开发。 | Xiaojiang Wu Botao Zhao Wei Li Yue Chen Ruqiang Liang Lin Li Youxin Jin Kangcheng Ruan | 2012 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2012，44，3： | 2 |
| 12 | Unraveling the large cell lung carcinoma-specific miRNA profile and the downstream regulation network显示文摘Large cell lung carcinoma(LCLC)is a rare subtype of highly migratory non-small cell lung carcinoma(NSCLC)[1] with resistance of chemotherapy[2],which leads to its poor diagnosis and prognosis in clinical practice[3].Evidence showed that non-coding RNAs participating in tumorigenesis and tumor progression can be potential therapeutic targets iii NSCLC[4].However,due to the low incidence and typical clinical feature of LCLC,knowledge about non-coding RNAs,especially LCLC characteristic miRNAs,their downstream conventional mRNA targets,and the involved lncRNAs is quite limited[5]. | Yifeng Gong Xue Li Lei Deng Li Jin Youxin Jin Yan Jin | 2019 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2019，51，10： | 1 |
| 13 | Expression and characterization of rice putative PAUSED gene显示文摘在 Arabidopsis,暂停了(PSD ) 编码 los1p/exportin-t 的 ortholog,它调停在酵母和哺乳动物的转移 RNA (tRNA ) 的原子出口。在象米饭那样的 monocot 植物,然而,相应 ortholog 的知识被限制,并且它在生长开发和生产率的效果仍然保持未知。在这研究,我们验证了一根米饭 transfer-DNAinsertional 异种 psd 线并且分析了它的显型;异种与野类型的米饭相比包括延迟的开发和低富饶显示了严重词法缺点。与在野类型、变异的叶织物之间的北污点分析在细胞质、原子的部分检验 intronless tRNA-Tyr 和包含 intron pre-tRNA-Ala 表示层次建议米饭 PSD 可能从原子核涉及 tRNA 出口到细胞质。另外,反向的抄写聚合酶链反应分析表明那个 PSD 抄本在整个正常米饭植物开发被表示,并且 subcellular 本地化试金证明那米饭 PSD 蛋白质在原子核和细胞质是在场的。在摘要,我们的数据暗示通常认为的 PSD 基因可能为正常米饭开发是不可缺少的,它的函数可能与 Arabidopsis PSD 的一样。 | Chengguo Yao Liangfa Ge Wei Li Botao Zhao Chaoqun Li Kangcheng Ruan Hongxuan Lin Youxin Jin | 2008 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2008，40，10： | 1 |
| 14 | Tanshinones suppress non-small cell lung cancer through up-regulating miR-137显示文摘大进步在肺癌症的治疗被取得了,尤其是在基于 PD-1 包括象那些那样的免疫疗法的治疗学的药的多样化。在这些之中,有许多反疾病分子,从中国传统的药提取,例如 artemisinin 和 tanshinones。Tanshinones,包括 Tanshinone 我(T1 ) , Tanshinone IIA (T2A ) ,并且 ? cryptotanshinone (CT ) ,是 Salia miltiorrhiza 的 liposoluble 成分,传统的植物,它有利药用的价值。特别兴趣中是 tanshinone 在肿瘤房间上有的细胞毒素的效果,它被认为首先通过 apoptosis 的正式就职和房间周期前进, angiogenesis,房间侵略,和转移的禁止发生。以前的研究显示了 tanshinones 的导致 apoptosis 效果可能有效地指向并且禁止人的肺癌症细胞的生长[1 ] 。因此,推测那 tanshinones 是合理的可以在非小的房间肺癌症(NSCLC ) 的治疗起一个重要作用。研究已经证明了 tanshinone 分子能在 vitro 禁止肺癌症细胞的生长[2 ] ,并且机制可能通过细胞周期前进和细胞 apoptosis 的正式就职的打断,导致 miR-137 的起来规定表示。 | Bingjie Zhang Zhongliang Ma Xue Li Caiyan Zhang Yang Shao Zhenguo Liu Yanli Li Youxin Jin | 2016 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2016，48，8： | 1 |
| 15 | Hybridization kinetics analysis of an oligonucleotide microarray for microRNA detection显示文摘MicroRNA (miRNA ) microarrays 成功地被使用了在象开发,区别, oncogenesis,和另外的疾病进程那样的许多生理的进程介绍 miRNA 表示。由 miRNA microarray 检测 miRNA 实际上基于在目标分子和他们的相应互补探针之间的 nucleic 酸杂交。由于小尺寸和在 miRNA 序列之中的类似的高度,杂交条件必须小心地被优化得到特定、可靠的信号。以前,我们报导了一个 microarray 平台检测 miRNA 表示。在这研究,我们评估了我们的 microarray 站台的敏感和特性。在系统的分析以后,我们为 miRNA 察觉与高敏感和特性决定了一个优化杂交条件。我们的结果将对另外的基于杂交的 miRNA 察觉方法有用,例如北污点和核酸酶保护试金。 | Botao Zhao Shuo Ding Wei Li Youxin Jin | 2011 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2011，43，7： | 1 |
| 16 | Proliferative capacity of stem/progenitor-like cells in the kidney may associate with the outcome of patients with acute tubular necrosis显示文摘 | Youxin Ye Bingyin Wang Xinxin Jiang Weiming Hu Jian Feng Hua Li Mei Jin Yingjuan Ying Wenjuan Wang XiaoOu Mao Kunlin Jin | 2011 | Human Pathology2011，，8： | 1 |
| 17 | miRNAs associated with the malignant transformation of non-small cell lung cancer显示文摘肺癌症是癌症相关的死亡的领先的原因在中国并且全球,与非小的房间肺癌症(NSCLC ) 为 80% 所有肺癌症的财务。尽管有在临床的策略的改进,在药品治疗以后的 5 年的幸存率仍然是很差的[1,2 ] 。KRAS 变化被发现是显著地在腺癌病人更经常[3 ] 。p53 抄写因素是批评肿瘤 suppressor,作为由它在所有人的癌症的一半上被变异在并且 p53 0 老鼠与 100% 外显率得癌症的观察证实了[4 ] 。而且,有 p53/LKB1 损失的 KRAS 变化的存在在现出症状之前的潜的鼠科的模型授与更坏的结果并且为到 selumetinib 和 docetaxel 的抵抗是预兆的[5 ] 。到对待人 NSCLC,因此,更好的目标的鉴定基于背景遗传型成为了最大的重要性的一个立即的目标,并且为新、更有效的策略的发展关键。 | Detao Wang Qian Zhang Youxin Jin | 2016 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2016，48，4： | 0 |
| 18 | Identification of novel miRNAs in mouse embryonic stem cells and reprogrammed pluripotent cells显示文摘MicroRNAs(miRNAs)are a class of endogenous small RNAs that regulate target gene expression at the posr-transcriptional level.miRNAs play an important role in almost all physiological activities including the processes of embryonic stem cell(ESC)pluripotency maintenanee and differentiation,as well as induced pluripotent stem cell(iPSC)reprogramming.In this study,we identified eight novel miRNAs by mining the deep sequencing dataset from mouse ESCs and three kinds of reprogrammed pluripotent cells.Most of them are con served at least in Murinae animals.Seven of them are derived from gene introns.We further showed that miR-novel-41 is a mirtron that derives from the intron of Man2cl,a protein-coding gene.Mirtrons are a kind of special non-canonical miRNAs encoded in introns.Their precursors are not processed by Drosha but generated by intron splicing. | Botao Zhao Chunsun Fan Youxin Jin | 2020 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2020，52，9： | 0 |
| 19 | miR-290 contributes to the low abundance of cyclin D1 protein in mouse embryonic stem cells显示文摘老鼠 miR-290 簇 miRNAs 在早胚胎和胚胎的细菌房间明确地被表示。这些 miRNAs 戏在 pluripotency 和自强的维护的关键角色。这里,我们证明 Cyclin D1 是 miR-290 簇 miRNAs 的直接目标基因。在在 pluripotent 和 non-pluripotent 房间,以及在区分 CGR8 房间的 Cyclin D1 蛋白质和 miR-290 簇 miRNAs 的表示之间的否定关系被观察。miR-290 簇 miRNAs 的抑制能在 G1 阶段逮捕房间并且在 CGR8 老鼠干细胞减慢房间增长。因为 miR-290 簇 miRNAs 是最主导的 stem-cell-specific miRNAs,我们的结果在老鼠为 Cyclin D1 的缺席揭示了一个重要原因胚胎的干细胞。 | Zizhen Gong Detao Wang Shaoliang Zhu Yuqing Xia Chunsun Fan Botao Zhao Youxin Jin | 2017 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2017，49，7： | 0 |
| 20 | Identification of differentially expressed miRNAs in mouse spinal cord development显示文摘MicroRNAs (miRNAs ) 是 22 nt 的非编码的、规章的小 RNA 的一个班。这些小 RNA 在各种各样的重要生物过程起关键作用,这被含有。在开发期间,某 miRNAs 明确地在单个纸巾并且在特别发展阶段被表示。许多 miRNAs 表演在中央神经系统的发展的不同表示模式,包括针的绳索。在这研究,我们首先在鼠标的开发报导了 miRNAs 表达式针的绳索。差别表示了 miRNAs 在胚胎(白天 13.5 ) 并且新生的老鼠针的绳索被识别。差别的预言的目标基因表示了 miRNAs 服从于基因本体论和 KEGG 小径分析,并且几条紧张的发展相关的小径被充实暗示这些 miRNAs 可以涉及调整老鼠的这些小径针的绳索开发。 | Botao Zhao Menggui Huang Yanyan Bai Chunsun Fan Yi Fan Youxin Jin | 2015 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2015，47，3： | 0 |
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