|
|
|
题名
|
作者
|
年代
|
出处
|
被引量
|
| 1 | Genome and Comparative Transcriptomics of African Wild Rice Oryza Iongistaminata Provide Insights into Molecular Mechanism of Rhizomatousness and Self-Incompatibility显示文摘Dear Editor, Oryza Iongistaminata is an African wild rice species with AA genome type possessing special traits that are highly valued for improving cultivated rice,such as strong resistance to biotic and abiotic stresses (Song et al.,1995) for improving resistance of cultivars,rhizomatousness for perennial breeding (Glover et al.,2010),and self-incompatibility (SI) for new ways to produce hybrid seeds (Ghesquiere,1986).Deciphering the genome of O.longistaminata will be the key to uncovering the mechanism of these hallmark traits and improving cultivated rice. | Yesheng Zhang Shilai Zhang Hui Liu Binying Fu Lijuan Li Min Xie Yue Song Xin Li Jing Cai Wenting Wan Ling Kui Hui Huang Jun Lyu Yang Dong Wensheng Wang Liyu Fluang Jing Zhang Qinzhong Yang Qinfi Shan Qiong Li Wangqi Huang Dayun Tao Muhua Wang Mingsheng Chen Yeisoo Yu Rod A. Wing Wen Wang Fengyi Hu | 2015 | Molecular Plant2015，8，11： | 1 |
| 2 | Fifteen Million Years of Evolution in the Oryza Genus Shows Extensive Gene Family Expansion显示文摘在在为 O 可得到的整个染色体的序列分析基因家庭。sativa (AA ) , O。glaberrima (AA ) ,和 O。brachyantha (FF ) ,我们为总科与 FF 染色体相比在 AA 染色体观察了大尺寸扩大 F 盒子和 NB 弧,和五个另外的家庭:丁氨二酸朊酶, BTB/POZ 蛋白质(BTB ) , Glutaredoxins,胰岛素淀粉酶禁止者蛋白质,和 Zf-Dof 蛋白质。他们的进化动态被调查理解怎么并且如此的重要尺寸 variationsare 为什么在这些之间观察密切相关的种类。我们证明扩大源于扩大主要由 tandemduplications,并且由基因损失的收缩。为 F 盒子和 NB 弧基因家庭,当扩展 orthologous 基因在更多下面净化选择放松时,基因在所有种类 wereunder 保存了强壮的净化选择。在 F 盒子, NB 弧,和 BTB,扩展的组与表示的小证据在基因被充实,与也检测的保存 groups.We 比较在在扩展的组的积极选择下面的 87 loci。这些结果显示出扩展的组发展的复制 copiesin 的那个大多数在复制以后的中立因为功能的冗余性而是很少的这些基因 werepreserved 追随者 neofunctionalization。因此,在 Oryza 种类之间观察的系特定的扩大被方向性的 selection.Key 词部分驾驶: | Julie Jacquemin Jetty S.S. Ammiraju Georg Haberer Dean D. Billheimer Yeisoo Yu Liana C. Liu Luis F. Rivera Klaus Mayer Mingsheng Chen Rod A. Wing | 2014 | Molecular Plant2014，7，4： | 1 |
| 3 | Random sheared fosmid library as a new genomic tool to accelerate complete finishing of rice (Oryza sativa spp. Nipponbare) genome sequence: sequencing of gap-specific fosmid clones uncovers new euchromatic portions of the genome显示文摘 | Jetty S. S. Ammiraju Yeisoo Yu Meizhong Luo Dave Kudrna HyeRan Kim Jose L. Goicoechea Yuichi Katayose Takashi Matsumoto Jianzhong Wu Takuji Sasaki Rod A. Wing | 2005 | Theoretical and Applied Genetics2005，，8： | 1 |
| 4 | Genome sequence of the palaeopolyp|oid soybean 显示文摘 | Jeremy S Steven B C Jessica S Ma J X Therese M William N David L H Qijian S Jay J T Cheng J L Xu D Uffe H Gregory D M Yeisoo Y Tetsuya S Taishi U Madan K B Devinder S Babu V Erika L Myron P David G Shu S Q David G Kerrie B Montona F Brian A Du J C Tian Z Zhu L Navdeep G Trupti J Marc L Anand S Zhang X C Kazuo S Henry T N Rod A Perry C James S Jane G Dan R Gary S Randy C S Scott A J | 2010 | Nature2010，463，： | 1 |
| 5 | The Subtelomere of Oryza sativa Chromosome 3 Short Arm as a Hot Bed of New Gene Origination in Rice显示文摘尽管有新基因的非随机的 genomic 分发的一般观察,新基因是否优先地在相关分子的机制驾驶的某些 genomic 区域发生,是不清楚的。用 1.5 ? 从染色体 3 Oryza glaberrima 和 O 的短手臂的 genomic 序列的 Mb。punctata,我们与参考 O 进行了比较 genomic 分析。sativa ssp。装饰用的梨树染色体。我们识别了位于染色体 3 的 subtelomeric 区域的中间的一个 60-kb 片断,它对种类 O 唯一。sativa。这个区域包含了在 100 万年以前从亚洲、非洲的栽培米饭的祖先分叉的亚洲栽培米饭种类(MYA ) 发生了的基因副本。为 12 基因和在 O 在这个片断识别的一完全的 retrotransposon。sativa ssp。装饰用的梨树,我们寻找了他们的父母基因。复制 paralogs 的高类似进一步支持这些基因的最近的起源。我们发现这个片断最近通过多重独立基因再结合和 transposon 插入事件被产生。在 12 基因之中,我们发现五把妄想的基因结构从多重父母基因导出。九从 12 新基因似乎功能,由 Ka/Ks 分析和 cDNA 或 MPSS 数据的存在建议了。为八抄录基因,而且,至少二基因能作为防卫被分类或强调反应相关的基因。给 subtelomeres 与再结合和抄写的高率被联系的这些调查结果,和事实, subtelomeres 可以便于基因再结合和 transposon 插入并且在米饭染色体为新基因起源用作热点,是可能的。 | Chuanzhu Fana Yong Zhang Yeisoo Yu Steve Rounsley Manyuan Long Rod A. Wing | 2008 | Molecular Plant2008，1，5： | 1 |
| 6 | 基于辣椒基因组测序探究辣味在种群中的进化显示文摘辣椒(Capsicum annuum)是美洲最古老的驯化作物之一,在全世界被广泛种植。本研究对CM334(墨西哥地方品种)进行了全基因组测序和组装(覆盖度为186.6×),同时还对另外两个栽培种和一个野生种分别进行了重测序和从头(de novo)测序。结果表明辣椒基因组大小约为番茄的4倍,辣椒基因组上存在大量gypsy转座子和花椰菜病毒家族元件的积累。结合转录组综合分析认为,辣椒素合成酶基因表达模式的改变及新功能化是导致辣椒素生物合成的原因,研究还发现辣椒与番茄在乙烯合成及果实成熟调控方面存在明显不同的分子模式。辣椒参考基因组的发布为辣椒营养品质和药用价值的改善提供了重要平台。 | Seungill Kim Minkyu Park Seon-In Yeom Yong-Min Kim Je Min Lee Hyun-Ah Lee Eunyoung Seo Jaeyoung Choi Kyeongchae Cheong Ki-Tae Kim Kyongyong Jung Gir-Won Lee Sang-Keun Oh Chungyun Bae Saet-Byul Kim Hye-Young Lee Shin-Young Kim Myung-Shin Kim Byoung-Cheorl Kang Yeong Deuk Jo Hee-Bum Yang Hee-Jin Jeong Won-Hee Kang Jin-Kyung Kwon Chanseok Shin Jae Yun Lim June Hyun Park Jin Hoe Huh June-Sik Kim Byung-Dong Kim Oded Cohen Ilan Paran Mi Chung Suh Saet Buyl Lee Yeon-Ki Kim Younhee Shin Seung-Jae Noh Junhyung Park Young Sam Seo Suk-Yoon Kwon Hyun A Kim Jeong Mee Park Hyun-Jin Kim Sang-Bong Choi Paul W Bosland Gregory Reeves Sung-Hwan Jo Bong-Woo Lee Hyung-Taeg Cho Hee-Seung Choi Min-Soo Lee Yeisoo Yu Yang Do Choi Beom-Seok Park Allen van Deynze Hamid Ashrafi Theresa Hill Woo Taek Kim Hyun-Sook Pai Hee Kyung Ahn Inhwa Yeam James J Giovannoni Jocelyn K C Rose Iben Sφrensen Sang-Jik Lee Ryan W Kim Ik-Young Choi Beom-Soon Choi Jong-Sung Lim Yong-Hwan Lee Doil Choi 刘峰 张西露 | 2014 | 辣椒杂志2014，0，2： | 0 |
您所在的机构暂未开通此部分的功能，请联系管理员